BIFI - - Institute for Biocomputation and Physics of Complex Systems

Curso de Verano: Estructura y Función de Proteínas
2015-07-06 - 2015-07-10 | Jaca (Huesca)
Objetivos:

1.- Proporcionar un conocimento detallado de la estructura de las proteínas.
2.- Describir las técnicas usadas en la actualidad para caracterizar estructuralmente las proteínas.
3.- Describir las técnicas usadas en la actualidad para caracterizar la función de las proteínas.
4.- Describir las implicaciones en medicina de las enfermedades relacionadas con el plegamiento de las proteínas (Alzheimer, enfermedades priónicas, escelerosis…).
5.- Describir las implicaciones del ensamblaje de las cápsidas virales para controlar su infectividad.
6.- Describir cómo los fenónemos de unión de proteínas con otras moléculas pueden alterar su función, y cómo este tipo de interacciones pueden producir el desarrollo de enfermedades, y cómo se pueden caracterizar este tipo de uniones. Asimismo, se explicará, desde el punto de vista farmacológico, la forma en que, regulando estas interacciones, se pueden desarrollar nuevos fármacos para tratar diversas enfermedades.
7.- Conocer y manejar software de alineamiento de secuencias de proteínas y de modelado molecular.
8.- Conocer como funciona una editorial de prensa científica.
9.- Conocer como escribir y elaborar un artículo científico.

Programa:

Lunes, 6 de Julio
09:00 h. Introducción al curso (1)
10:00 h. Calorimetría diferencial de barrido (2)
11:30 h. Técnicas espectroscópicas de ultravioleta, fluorescencia y dicroísmo circular (1)
12:30 h. Tutorías, talleres y cuestiones (3) (1)
16:30 h. Calorimetría de titulación isoterma (2)
17:30 h. Biosensores ópticos basados en el fenómeno de Resonancia Plasmón de Superficie. Biacore(4)
19:00 h. Tutorías, talleres y cuestiones (3) (1)
Martes, 7 de Julio
09:00 h. Difracción de Rayos X (5)
11:30 h. Resonancia Magnética Nuclear (1)
16:30 h. Microscopía electrónica (6)
19:00 h. Tutorías, talleres y cuestiones (3) (1)
Miércoles, 8 de Julio
09:00 h. Resonancia paramagnética de electrón (3)
10:00 h. Espectroscopía de fuerza atómica y técnicas de una única molécula (7) (7)
11:30 h. Métodos para medir interacciones macromoleculares usando dispersión de luz y ultracentrifugación analítica (8)
16:30 h. Alineamiento de secuencias y filogenia (9)
17:30 h. Dinámica molecular (10)
19:00 h. Visita cultural
Jueves, 9 de Julio
09:00 h. Modelado molecular e interacción entre proteínas (11)
11:30 h. Relación estructura-función en proteínas (3)
12:30 h. Como trabajar uno mismo con el alineado de secuencias y los estudios filogenéticos (9)
16:30 h. Ingeniería de proteínas para aplicaciones biotecnológicas (7) (7)
19:00 h. Enfermedades conformacionales de proteínas (12)
19:00 h. Tutorías, talleres y cuestiones (3) (1)
Viernes, 10 de Julio
09:00 h. How to write a scientific paper (13)
12:30 h. Behind the curtains of an editorial (14)
16:30 h. Mesa redonda: Estructura y función de proteínas en el siglo XXI (1) (3)

Ponentes:

1. José Luis Neira Faleiro (Instituto de Biologia Molecular y Celular, Universidad Miguel Hernández de Elche)
2. Adrián Velázquez Campoy (Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos, Universidad de Zaragoza)
3. Milagros Medina Trullenque (Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos, Universidad de Zaragoza)
4. Patricia Ferreira Neila (Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos, Universidad de Zaragoza)
5. Ana Cámara Artigas (Universidad de Almería)
6. José María Valpuesta (Centro Nacional de Biotecnología, CSIC-Madrid)
7. Mauricio García Mateu (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, U. Autónoma de Madrid)
8. Carlos Alfonso Botello (Centro de Investigaciones Biológicas CSIC, Madrid)
9. Bruno Contreras Moreira (Estación Experimental de Aula Dei, CSIC-Zaragoza y Fundación ARAID)
10. Federico Gago Badenas (Universidad de Alcalá)
11. Juan Fernández Recio (Centro Nacional de Supercomputación)
12. Javier Sancho Sanz (Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos, Universidad de Zaragoza)
13. Anthony Newman (Elsevier B.V., The Netherlands)
14. Andy Deelen (Elsevier B.V., The Netherlands)
15. Ponente Por determinar (1) (3)

Alumnado:

Estudiantes de los últimos cursos de los grados en Química, Biología, Física, Farmacia, Medicina, Bioquímica, Biotecnología y Veterinaria. Estudiantes de másteres de Bioquímica, Biología Molecular y Celular, Biotecnología y Tecnología de Alimentos.
Estudiantes de doctorado. Profesionales en activo en cualquiera de las áreas de conocimiento y especialidades arriba indicadas. Como novedad, respecto a ediciones anteriores, se propone el último día un taller de “Cómo escribir un artículo científico” y “de los entresijos, a nivel editorial, detrás de algunas revistas del grupo Elsevier” (uno de los gigantes en la actualidad en la publicación de textos científicos). Este taller es de interés para cualquier profesional en investigación y docencia.

Procedimiento de evaluación:

Se evaluará la participación activa tanto durante la exposición (el conferenciante dirigirá preguntas a la audiencia, para conseguir involucrar a la misma) como durante las horas de tutorías o talleres que al final de cada día sobre los temas comentados a lo largo de esa jornada. Se propondrá asimismo un cuestionario en el último día del curso (en la sesión vespertina, de tal foma que ya haya transcurrido la totalidad del curso) sobre los aspectos más relevantes tratados durante la duración del mismo.

Alojamiento:

Lugar de celebración
Palacio de Congresos
Avda. Juan XXIII, s/n
22700 JACA
Alojamiento
Residencia Universitaria de Jaca, C/Universidad, 3 22700 JACA.
Precio del alojamiento durante el curso: 184,23 € (consultar información en el enlace Sedes).
Consultas y reservas de alojamiento:
Web http://www.unizar.es/resijaca
Tfno.: +34 974 360 196 , e-mail: resijaca@unizar.es

Jornada CloudSME
2015-06-24 17:30 - 20:30 UTC | Aula Magna Edificio Paraninfo, Zaragoza
El objetivo de la sesión es dar a conocer los casos de éxito del proyecto, tanto nacionales como internacionales,que puedan servir como referente para otras empresas. En concreto se presentarán los desarrollos llevados a cabo en logística para agroalimentación, logística de grandes mercancías, diseño de productos en el sector del calzado y en optimización de procesos en la industria del acero. Además se presentarán diversas oportunidades de financiación en H2020 destinadas a la Industria con el fin de promover la participación del tejido empresarial nacional en iniciativas europeas.

Puede consultar la agenda en el siguiente enlace:

http://cloudsme.eu/content/cloudsme-industrial-event-2015

Aforo limitado, rogamos confirmación a través del siguiente enlace: Inscripciones

CloudSME es un proyecto financiado por la Comisión Europea bajo la iniciativa I4MS cuya finalidad es acercar la soluciones Cloud a pequeñas y medianas empresas para optimizar sus procesos productivos o logísticos. Más información: http://cloudsme.eu/

JORNADA PKU: Hacia la mejora en la calidad de vida de los enfermos con Fenilcetonuria
2015-05-23 10:00 - 14:00 | Centro Joaquín Roncal Fundación CAI-ASC,
El próximo sábado 23 de mayo de 2015 tendrá lugar una jornada abierta, centrada en la fenilcetonuria (PKU), una enfermedad genética, metabólica, rara que afecta a 1 de cada 10.000 personas. Su detección precoz (mediante la prueba del talón) es fundamental para que los recién nacidos sean tratados inmediatamente para evitar los trastornos de la enfermedad. El tratamiento puede durar toda la vida.
Pacientes, familiares, investigadores y profesionales sanitarios, se darán cita en el Centro Joaquín Roncal Fundación CAI-ASC, C/ San Braulio 5-7, 50003 Zaragoza, para compartir conocimiento y experiencias reales orientados a la mejora de la calidad de vida de los enfermos. La asistencia es libre y cualquier persona interesada en conocer más sobre la fenilcetonuria es bienvenida hasta completar el aforo.
La jornada es una iniciativa promovida por el Instituto BIFI de la Universidad de Zaragoza, enmarcada en el proyecto Neuromed y organizada gracias a la colaboración entusiasta de la Asociación aragonesa de PKU y otros trastornos metabólicos, ARAPKUOTM, organización sin ánimo de lucro formada principalmente por afectados y familiares de enfermos con Fenilcetonuria y que pertenece a la Federación Española de Fenilcetonuria y Otros Trastornos Metabólicos PKU y OTM (FEEMH). También ha colaborado en la organización la Fundación CAI-ASC, que ha cedido sus instalaciones para celebrarla.
El proyecto Neuromed investiga en el desarrollo de terapias moleculares para el tratamiento de la fenilcetonuria, además de otras dos enfermedades neurodegenerativas, la enfermedad de Parkinson y la Polineuropatía amiloidótica familiar. Es un proyecto de colaboración europea, financiado por el programa Interreg IV SUDOE, de 14 meses de duración, que está liderado por el Profesor Javier Sancho, catedrático de Bioquímica y Biología Molecular y Director del Instituto BIFI de la Universidad de Zaragoza. En el proyecto participan dos equipos de investigación españoles, dos portugueses y dos franceses.
Intervendrán por una parte el coordinador del proyecto Neuromed, Prof. Javier Sancho que hablará de los avances en tratamientos alternativos o complementarios a los actuales, la Dra. Inmaculada García del servicio de Pediatría del Hospital Universitario Miguel Servet, el Dr. Koldo Aldamiz, médico en el Hospital de Cruces, Jorge Palomera, presidente de la asociación ARAPKUOTM y enfermo con fenilcetonuria, Cati López, vocal de la FEEMH en Pamplona) y Pilar Alvo, madre de un paciente con fenilcetonuria y Natalia Barbero, paciente con fenilcetonuria, que explicarán su experiencia.
Se invita al público en general a participar en esta jornada, ya que conociendo más de la enfermedad, todos podemos aportar algo para mejorar las condiciones de vida de las personas que la padecen.

Jornada de “Supercomputación y Almacenamiento hyperscale para HPC, Big Data y Cloud”
2014-11-27 09:30 - 14:00 | Edificio Institutos I+D, Mariano Esquillor, 50018 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50018, España
Intro:
El Instituto Universitario de Investigación en Biocomputación y Física de Sistemas Complejos (BIFI) de la Universidad de Zaragoza, tiene el placer de invitarle a la “Jornada de Supercomputación y Almacenamiento hyperscale para HPC, Big Data y Cloud”. El evento tendrá lugar el próximo jueves 27 de Noviembre en el Salón de Actos del Edificio I+D, Campus Río Ebro.
Agenda:

09:30
Bienvenida
Guillermo Losilla; BIFI-UNIZAR
Xavier Salvat; Fujitsu

09:45
Fujitsu: Roadmap Exascale
Adriano Galano: Director de Supercomputación y Big Data; Fujitsu

10:15
Intel: Xeon Phi y Big Data
Antonino Albarrán; Director de Tecnología de Intel

10:45
Pausa Café

11:15
Soluciones de almacenamiento hyperscale para HPC, Big Data y Cloud: ETERNUS CD10000
Manuel Millares, Consultor Senior de Almacenamiento; Fujitsu

12:15
Soluciones de Fabric de Red para entornos HPC
Raúl Morata, Director de Servicios de Red; Fujitsu

12:45
Coloquio

Registro:
La asistencia al evento es gratuita y de libre acceso. SIn embargo, para garantizarse un asiento (aforo limitado) y tener derecho a certificado de asistencia, es necesario registrarse previamente.
Regístrese aquí.

6ª Jornada de Jóvenes Investigadores de Química y Física en Aragón
2014-11-20 08:30 - 19:00 | Edificio Betancourt (Campus Río Ebro)
El jueves 20 de noviembre se celebrará la 6ª Jornada de Jóvenes Investigadores (Química y Física) de Aragón organizada por las Secciones Territoriales en Aragón de las Reales Sociedades Españolas de Química y de Física junto con la Escuela de Ingeniería y Arquitectura de la Universidad de Zaragoza y que cuenta con el apoyo de una mayoría de los Institutos Universitarios de Investigación, entre ellos el BiFi. La asistencia a los actos está abierta a todos aquellos que quieran participar.
Se puede encontrar más información acerca de la Jornada en la dirección http://jjiqfa.wordpress.com

Actividades colaboración con FUJITSU-INTEL 2014-2015
2014-09-01 - 2015-08-31 | BIFI – Universidad de Zaragoza
A lo largo del curso 2014-2015 y en colaboración con las empresas FUJITSU e INTEL, el BIFI va a organizar varios eventos sobre temas actualmente de interés en el mundo de la Computación.
En concreto, se han planificado las siguientes actividades:
· Workshop de Supercomputación, BIFI-Universidad de Zaragoza, en Noviembre de 2014
· Participación en la VII Conferencia Nacional BIFI2015 (link), durante la sesión dedicada a Computación, BIFI-Universidad de Zaragoza, en Febrero de 2015
· Participación en evento de la Red Española de Supercomputación (link), Universidad de Zaragoza, durante la primera mitad de 2015 (fecha aún por concretar)
La información detallada de cada evento (registro, programa etc) se irá publicando en esta misma página web conforme se aproxime su fecha de celebración.

Presentación tesis doctoral: A Bioinformatics Study of Protein Conformational Flexibility and Misfolding: A Sequence, Structure and Dynamics Approach
2014-04-01 12:00 - 14:00 | Salón de Grados, Facultad de Ciencias
Speaker: Espinosa Angarica, Vladimir
Date & location: Tuesday 1st April 2014, 12:00 (CEST). Sala de Grados de la Facultad de Ciencias

BIFI-I3A Fujitsu Innovation Day
2014-03-20 09:30 - 15:00 | Edificio Institutos I+D, Mariano Esquillor, 50018 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50018, España
Intro:
El BIFI y el I3A de la Universidad de Zaragoza, en colaboración con Fujitsu e Intel, organizan el próximo jueves 20 de Marzo una Jornada sobre Innovación que tratará distintos topics actualmente candentes en el mundo de la computación (HPC, Big data, Horizon2020 y Green Computing). El evento tendrá lugar en el Salón de Actos del Edificio I+D, Campus Río Ebro.

Agenda:

09.30 – 10.00
Recepción y bienvenida

10.00 – 10.20
Introducción Fujitsu
Rosa Capell. Directora Comercial Sector Público Fujitsu

10.20 – 10.40
Computing the Ideal Future
Adriano Galano. Director HPC & Big Data Fujitsu

10.40 – 11.00
Computación en el BIFI: proyectos, servicios e infraestructuras.
Guillermo Losilla.
Responsable infraestructuras de cálculo del BIFI

11.00 – 11.40
Café

11.40 – 12.00
I3A: HPC al servicio de la investigación en ingeniería
Antonio Sanz, Responsable de sistemas del I3A.

12.00 – 12.40
Caminando juntos hacia el “Horizonte 2020”
Marcial Valdemorisco.
Experto en C.E. Miembro High Level Groups CE

12.40 – 13.00
Intel

13.00 – 13.20
Green Computing. Eficiencia energética en los Data Centers
Javier López. Director Data Center de Fujitsu

13.20 – 15.00
Cóctel en la zona de networking

Registro:
La asistencia al evento es gratuita y de libre acceso. SIn embargo, para garantizarse un asiento (aforo limitado) y tener derecho a certificado de asistencia, es necesario registrarse previamente.
Regístrese aquí: http://descubrefujitsu.com/Universidad-Zaragoza/registro/

Seminario de Física Nuclear: Fotónica con pocos fotones en guías de onda
2014-03-11 14:00 - 17:00
Speaker: Eduardo Sanchez Burillo (Departamento de Física de la Materia Condensada e ICMA.)
Date: Tuesday 11th March 2014, 14:16 (CET)

VI International Conference BIFI 2014
2014-02-22 - 2014-02-24 | Ibercaja Zentrum, Calle Joaquín Costa, 13, 50001 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50001, España
Welcome!
The VI International Conference of the Institute for Biocomputation and Physics of Complex Systems (BIFI) will take place at Zaragoza (Spain), in January, 22-24, 2014.
The aim of this international meeting is to bring together researchers from whatever discipline where demanding computer simulations are required as a fundamental research tool. The approach will be focused on the techniques (Monte Carlo, Molecular Dynamics, quantum chemistry, cellular automata, optimization techniques,…), while the goal is that researchers from different field may learn from each other’s approach and methods. A special attention will be also given to the interplay between simulation techniques and new high-performance computing paradigms. Contributions in Disordered Systems, Molecular Biology, Molecular Dynamics, Complex Networks, Computation in Neuroscience, Big Data Analytics and Visualization, High-throughput data analysis and screening, Massive Genomic Sequencing, Complex Systems, as well as any other fields, will be welcome.

Official webpage: https://bifi.es/events/bifi2014/

Main topics to be covered during the meeting:
Molecular Modeling

QM/MM simulations
Molecular dynamics
Multiscaling techniques
Ab initio method models

Biological Systems

High throughput analysis
Massive sequencing
Transcriptome analysis
Proteomics
Phylogenetic analysis

Computational Physics

Monte Carlo simulations
Disordered systems
Dedicated machines
Complex networks

To this end, the format of the Congress will include plenary sessions and short talks. Short talks will be selected among poster contributions. The official language of the conference is English. Researchers from any Institution are warmly invited to attend the meeting.

Organizing committee:

Javier Borge-Holthoefer (BIFI Institute)
Pierpaolo Bruscolini (BIFI Institute and Department of Theoretical Physics, U. Zaragoza)
Alberto Castro (ARAID Foundation, BIFI Institute)
Bruno Contreras (ARAID Foundation, Estación Experimental de Aula Dei / CSIC)
María Fillat (Department of Biochemistry and Molecular and Cell Biology, U. Zaragoza)
Sergio Perez-Gaviro (ARAID Foundation, BIFI Institute)

Contact: For any issue related to the conference, please contact the Institute secretaries: Isabel Vidal, Beatriz Antolí

Actividades de ciencia ciudadana curso 2013 - 2014
2013-09-30 08:00 | Aragón
Contexto

Este programa impulsa la ciencia ciudadana en sus vertientes investigadora y docente permitiendo a los alumnos, sin restricción por edad o de conocimiento o de localización, ser parte protagonista de los avances científicos contribuyendo y aportando valor útil a la labor investigadora de científicos aragoneses. Todas las actividades planteadas generarán los datos experimentales para grupos de investigación que necesitan de la participación de los alumnos aragoneses. El BIFI, como parte de su liderazgo internacional en experimentos participativos, está creando el Libro Blanco de la Ciencia Ciudadana en Europa de cara al Horizonte2020 en el que se recogerán las prácticas y experiencias ganadas a partir de esta convocatoria y de posteriores fases que se produzcan en el resto de Europa tomando como referencia Aragón, sus investigadores, sus centros de enseñanza, sus profesores y sus alumnos. La Fundación Ibercivis da soporte a estos proyectos y experimentos aportando fondos complementarios para mejorar el impacto científico, docente y social.

Descripción de los experimentos de ciencia ciudadana

Inicialmente se concretan tres experimentos disponibles desde el primer trimestre del curso académico a los que se pueden sumar otros nuevos en los siguientes trimestres. Los experimentos iniciales que se ofertan a los centros para realizar con sus alumnos son:

Análisis de células. A través de una página web los alumnos analizan imágenes reales de un microscopio y ayudan a avanzar en el conocimiento de muerte celular asociada a enfermedades como el cáncer o el alzheimer. Los alumnos aprenden de primera mano conceptos y técnicas usadas en biotecnología mejorando sus conocimientos en la materia.
Creación del mapa de temperaturas. Se pide a los alumnos que hagan de sensores humanos proporcionando datos como su sensación de confort, temperaturas o de consumo energético para crear un mapa de temperaturas a microescala de mejora de eficiencia energética. Los alumnos, a través de las TIC y de la participación activa, reciben información y consejos energéticos que mejoran su conciencia y comportamiento.
Creación de mapas semánticos. Los alumnos juegan a encontrar caminos mentales entre palabras y conceptos en inglés para estudiar patrones psicolingüísticos. Los alumnos compiten y mejoran sus capacidades perfeccionando el idioma.

Descripción de la actividad docente y calendario

Durante el primer trimestre se realizará un taller de 3 horas de formación en a los profesores de las herramientas y de los experimentos científicos a realizar en el que se proporcionarán los materiales docentes auxiliares necesarios para la puesta en marcha en el aula. Este taller inicial se aprovechará para fijar calendarios específicos de cada centro y necesidades puntuales. Se realizará en las instalaciones del BIFI en Zaragoza o por medios virtuales tipo videoconferencia, en función de las disponibilidades y agendas. de 1 hora a final de curso de revisión y consolidación de conceptos aprendidos. Estas sesiones se recomiendan en el aula de informática de cada centro. A partir de las sesiones de formación inicial, toda la actividad de los alumnos se realizará a través de sitios web o de aplicaciones móviles y quedará registrada y controlada por parte de los servidores del BIFI. En todo momento los profesores podrán saber la tarea que realiza cada alumno. El BIFI montará las herramientas necesarias para los experimentos y para la correcta coordinación y soporte técnico y de resolución de dudas entre investigadores, docentes y alumnos. Si finalmente se concretan nuevos experimentos complementarios a los tres propuestos en esta convocatoria, cabe la posibilidad de que se promuevan nuevas sesiones de formación y despliegue de cada actividad en cada centro. En total se estima una dedicación por parte de cada coordinador de centro de unas 20 horas en todo el curso académico 2013-2014.

Destinatarios y número de participantes

Educación Secundaria y Bachillerato. No hay restricción en cuanto al mínimo ni máximo de centros ni de alumnos participantes por centros. Cualquier alumno, sin importar su orientación académica y formación, puede realizar las tareas de todos los experimentos en el aula y en casa. A pesar de ser investigaciones complejas y punteras, no es necesario ser un experto para contribuir sino que se fomenta la participación y protagonismo de personas externas a los laboratorios y el mundo científico.

Presentación recursos y servicios de cálculo: BIFI, Ibercivis, BSC, RES y PRACE
2013-09-26 11:00 - 13:00 | Edificio Institutos I+D, Mariano Esquillor, 50018 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50018, España
El próximo jueves 26 de Septiembre la Universidad de Zaragoza acogerá una reunión informativa donde se presentarán los distintos recursos y servicios de cálculo que a día de hoy el BIFI, la Fundación Ibercivis, el BSC-CNS (Barcelona Supercomputing Center), la RES (Red Española de Supercomputación) y el proyecto europeo PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe) ponen a disposición del investigador.
El objetivo de esta reunión es dar a conocer a la comunidad I+D+I local los recursos y servicios de cálculo disponibles, muchos de ellos gratuitos para el investigador, así como informarles del método de solicitud de acceso a los mismos.
La jornada, organizada por el BSC y el BIFI, tendrá lugar en horario de mañana (11-13h) en el Salón de Actos del Edificio I+D (Campus Río Ebro).
Más información y registro gratuito (necesario para obtener certificado):
http://www.bsc.es/bsc-bifi-reunion-2013

Heterogeneous human mobility behavior and spatial spread of infectious diseases
2013-09-12 13:00 - 17:00 | Edificio Institutos I+D, Mariano Esquillor, 50018 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50018, España
Seminario Grupo Cosnet/BIFI

Speaker: Dr. Chiara Poletto, Computational Epidemiology Laboratory, Institute for Scientic Interchange (ISI) Foundation, Turin, Italy & INSERM, U707, Paris, France & UPMC Universit e Paris 06, Facult e de M edecine Pierre et Marie Curie, UMR S 707, Paris, France

Dia y Hora: Jueves 12 de Septiembre a las 13:00 horas

Lugar: Seminario A (primera planta) del Edificio de Institutos I+D+i

Title: Heterogeneous human mobility behavior and spatial spread of infectious diseases
Abstract:
Human mobility and interactions represent key ingredients in the spreading dynamics of an infectious disease. The flows of traveling people form a network characterized by complex features, such as strong topological and traffic heterogeneities, that unfolds at different temporal and spatial scales. Theoretical frameworks that consider reaction-diffusion processes on a network of populations are able to provide understandings on the interplay between individual mobility and epidemic dynamics. However the empirically observed heterogeneities in the frequency of travels and trip duration represents additional complex ingredients that may have a profound impact on the disease spread. Models studied till now are unable to address these aspects since they consider a homogenous population (in which people are characterized by the same behavior regarding traveling and interaction) and a markovian mobility process (in which the memory of the origin of traveling individuals is lost). Here we present a theoretical work that goes beyond the traditional approaches allowing us to account for the complex features of individual behavior, such as heterogeneous distributed trip durations and heterogeneous attitude regarding traveling. We show by means of analytical calculations and numerical simulations, that the degree of such heterogeneities crucially affects the global epidemic dynamics altering the ability of a disease to invade the system and to reach pandemic proportions.

4th International Workshop on Nonlinear Maps and Applications
2013-09-03 - 2013-09-04 | Faculty of Sciences, University of Zaragoza
3-4 September 2013, Zaragoza, Spain
http://noma2013.wordpress.com/
CALL FOR ABSTRACTS – DEADLINE: 10-July-2013
http://noma2013.wordpress.com/submision/
The “International Workshop on Nonlinear Maps and their Applications” will be held at the University of Zaragoza (Spain) in September 3rd-4th 2013. The aim of this International Workshop is to bring together researchers working on nonlinear iterative processes in order to exchange and share the main achievements and ideas recently developed in this field. Contributions in Economics, Biology, Computational methods, Networks, Engineering, besides other more fundamental lectures, are wellcome.

Invited Speakers:

Yves Pomeau, Paris, France
Elena Blokhina, University College Dublin, Dublin, Ireland
Oreste Piro, University of Balearic Islands, Palma de Mallorca, Spain
Víctor Mañosa, Polytechnic University of Catalunya, Terrassa, Spain
Anirban Chakraborti, École Centrale Paris, Châtenay-Malabry, France

More information (deadlines, submission, fees, venue, etc.) at the web page:
http://noma2013.wordpress.com/

Defensa de Tesis Doctoral de Sonia Arilla Luna
2013-07-15 11:30 - 17:00 | Salón de Grados, Facultad de Ciencias
El próximo día 15 de Julio tendrá lugar la defensa de la siguiente tesis doctoral realizada en el Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos y en el Departamento de Bioquímica de la Universidad de Zaragoza:
Defensa de Tesis Doctoral
“ENZYMES INVOLVED IN THE METABOLISM OF FLAVINS IN PROKARYOTIC ORGANISMS: STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIP”
Doctorando: SONIA ARILLA LUNA
Director: MILAGROS MEDINA TRULLENQUE
Fecha: 15 de julio de 2013, 11:30 h
Sala de Grados de la Facultad de Ciencias (Edif. A)

Defensa de Tesis Doctoral de Jorge Monforte
2013-07-09 11:00 - 17:00 | Salón de Grados, Facultad de Ciencias
El martes proximo, dia 9 de Julio a las 11h, tendrá lugar la defensa de Tesis de Jorge Monforte
“Study of the critical and low temperature properties of finite dimensional spin glasses”.
Director: Alfonso Tarancón
Sala de Grados Edif A
Facultad de Ciencias

Hack day de Ciencia ciudadana
2013-06-29 11:00 - 18:00 | CIEM de Zaragoza
Estamos organizando un hack day especial de Ciencia, que tendrá lugar en el edificio CIEM de Zaragoza (Avda. Autonomía), el sábado 29 de junio, de 11:00 – 18:00 h.
Ven y únete a otros científicos ciudadanos, personas humanas, tecnólogos, diseñadores, estudiantes, científicos, humanistas y todos los que sienten curiosidad por diversos temas. Se pretende reunir a todos en el mismo espacio físico durante un breve pero intenso periodo de colaboración, afrontando retos colectivos.
Te animamos a formar parte del Hack Day de Ciencia Ciudadana, queremos concentrar a personas con ideas o bien dispuestos a unirse a las propuestas que se manifiesten, con ilusión de trabajo en equipo y voluntad para integrar sus diversos intereses sociales, tecnológicos, de diseño, comunicación, etc.
El objetivo del evento es mostrar el potencial que la Ciencia Ciudadana brinda a los ciudadanos así como a científicos profesionales gracias a las nuevas tecnologías. En el evento se mostrarán herramientas sobre red de sensores: adquisición de datos con teléfonos móviles para proyectos científicos; red de talento: resolución de problemas científicos desde tu navegador web; red de ordenadores: donde tu ordenador contribuye con sus recursos ejecutando simulaciones científicas y red de experimentos: mediante juegos, se pueden comprobar aplicaciones y experimentos científicos. Mostraremos y trabajaremos con herramientas de software libre que utilizan en sus proyectos científicos (Epicollect, PyBossa y/o BOINC) y no solo software, también tiene cabida el hardware.
¿Cómo participar?
Solo tienes que reservar tu TICKET (ya mismo, que se agotan, no queda mucho tiempo) y además si tienes una idea colectiva de trabajo, la puedes facilitar, es muy rápido, solo escribirla, no es necesario ni registrarte.
Te recomendamos que te traigas un portátil y/o móvil con datos y/o cámara fotos o cualquier tipo de hardware que sirva para crear/mejorar proyectos científicos de ciencia ciudadana.
Recuerda todos tienen cabida, no es necesario que seas científico ni informático ni…
Ya sabes que un hack es un truco, una solución rápida a un problema – quizás no sea la solución más elegante, pero a menudo la más eficiente. Así que cuantos más seamos más proyectos-soluciones surgirán!!!
¿Qué se obtiene?
Nadie lo sabe, pero una cosa es segura, temas interesantes surgirán durante esta cooperación y pasaremos un buen día además de conocer a mucha gente.
Funcionamiento
1·Al comienzo, tendremos una serie de introducciones muy cortas sobre las diferentes propuestas para desarrollar.
2· A continuación se formarán los grupos de trabajo, con los nuevos proyectos de ciencia ciudadana que queremos prototipar a lo largo del día y uniéndose cada participante al proyecto que más le guste.
3· Al final del día nos reuniremos para mostrar lo que cada grupo ha desarrollado.
NOTA: Se proporcionará ayuda y consejo a aquellos equipos que quieran continuar en sus proyectos o aplicaciones después del evento.
Unos conceptos
La Ciencia Ciudadana consiste en realizar investigación científica, en la que el total o solo una parte de la investigación se realiza en colaboración con científicos amateurs o no profesionales que ayudan en la recolección de datos, resolución de problemas e incluso proporcionando nuevas ideas en la investigación. En otras palabras, la Ciencia Ciudadana abre las puertas de la ciencia a la participación ciudadana. Aprovecha las herramientas digitales, tecnologías móviles y la web con el objetivo de hacer partícipe a ciudadanos de todo el mundo en proyectos científicos.
La Ciencia Abierta significa, entre otras muchas cosas, que el conocimiento científico se pueda utilizar por todo el mundo libremente sin ningún tipo de restricciones legales, sociales o tecnológicas.
ORGANIZADORES
Fundación Ibercivis
Ibercivis es una iniciativa de ciencia ciudadana compuesta por una plataforma de computación voluntaria y por una serie de experimentos que permiten a la comunidad científica aprovechar dos de las herramientas más potentes que existen hoy en día: la capacidad del ordenador y el cerebro.
Cachirulo Valley
Un colectivo de personas que organiza distintas iniciativas y actividades para fomentar el ecosistema emprendedor tecnológico en Aragón.
DLabs
Es un espacio de trabajo, un espacio de colaboración, un espacio de aprendizaje; pero sobre todo, Dlabs es un espacio de experimentación artística y tecnológica.
Socientize
Liderado por la Universidad de Zaragoza, es un proyecto financiado por la Comunidad Europea bajo el 7º Programa Marco y lanzado en el 2012 que coordina y promociona experimentos científicos utilizando infraestructuras ciudadanas, eliminando las fronteras entre el científico profesional y el amateur. El proyecto creará el Libro Blanco de Ciencia Ciudadana para el Horizonte 2020.
Milla Digital-Ayuntamiento de Zaragoza
Proyecto urbanístico-tecnológico innovador del Ayuntamiento de Zaragoza para ayudar a que empresas, instituciones y ciudadanos se posicionen para formar parte del medio económico y social del siglo XXI.
¿Alguna sugerencia? Sientete libre de enviarnos un mail a info@ibercivis.es

JORNADA DE PUERTAS ABIERTAS DEL INSTITUTO DE BIOCOMPUTACIÓN Y FÍSICA DE SISTEMAS COMPLEJOS EN LA FACULTAD DE VETERINARIA
2013-05-23 10:00 - 17:00 | Aula de Grados, Facultad de Veterinaria
Con motivo del décimo aniversario del BIFI el Instituto está realizando una serie de seminarios y jornadas de puertas abiertas en distintos centros de investigación de nuestra comunidad. El objetivo de estos seminarios es dar a conocer las principales líneas de investigación del BIFI, haciendo especial énfasis en sus infraestructuras. Dichas líneas e infraestructuras podrían resultar de interés para otros grupos de investigación aragoneses.
Por todo ello el Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos tiene el placer de invitarles al seminario que tendrá lugar el jueves 23 de Mayo a las 10 h en el Aula de Grados de la Facultad de Veterinaria
Ponentes:

Dra. Marta Martínez. Profesora Titular de la Universidad de Zaragoza e investigadora del BIFI. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular y Celular.
Dr. José Alberto Carrodeguas. Profesor Contratado Doctor del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular y Celular e investigador del BIFI.

III Circuitos científicos
2013-02-12 - 2013-02-27
Por tercer año consecutivo, el BIFI participa en los circuitos científicos organizados por la Universidad de Zaragoza en la que jóvenes estudiantes de secundaria visitan las instalaciones de mano de los investigadores.
Calendario de visitas:
12 de Febrero: IES ELAIOS de Zaragoza
19 de Febrero: IES Bajo Cinca de Fraga
25 de Febrero: IES Ateca-E.Jimeno de Calatayud
27 de Febrero: IES AVEMPACE de Zaragoza

Workshop virtual abierto
2013-01-30 16:00 - 18:00
WORKSHOP VIRTUAL ABIERTO, miércoles día 30 de enero
Reconocidos expertos analizan los últimos avances en plataformas computacionales de ciencia ciudadana.
Este miércoles, 30 de enero, a las 16.00 horas, se celebra el taller virtual abierto Citizen Science en el que, a través de la herramienta Google Hangout, expertos de todo el mundo en este modelo de investigación darán a conocer sus últimos trabajos y experiencias en infraestructuras abiertas para la computación en red, que posibilitan la participación de miles de voluntarios en proyectos de investigación.
El taller tendrá una duración de dos horas en el transcurso de las cuales se repasarán tecnologías como BOINC, Bossa, PyBossa, Furnivall, Ourgrid y otras similares, siempre prestando especial atención a los últimos desarrollos, administración y casos de éxito.
Este workshop virtual, organizado por la Fundación Ibercivis y por el proyecto Society as Infrastructure for e-Science que financia la Comisión Europea en el FP7, contará con la participación de David Anderson, de la Universidad de Berkeley); Daniel Lombrana, del Citizen Cyberscience Centre; Francisco Sanz, del Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos (BIFI); Eduardo Lostal, en representación de Ibercivis; Francisco Brasileiro, de la Universidad Federal de Campina Grande; Candida Silva, de la Universidad de. Coimbra, y el desarrollador de Software Juanjo Molinero.
Todos estos expertos expondrán sus últimos avances y contestarán en tiempo real a los usuarios que podrán plantear sus dudas a través de la cuenta de Twitter @SOCIETIC_EU y a través del canal de Youtube de Ibercivis. http://www.youtube.com/channel/UCbkYEbbo8qMYbA3P5iLanGw

VI National Conference BIFI 2013
2013-01-30 - 2013-02-01 | Edificio Institutos I+D, Mariano Esquillor, 50018 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50018, España
The VI National Congress of the Institute for Biocomputation and Physics of Complex Systems (BIFI) will take place at the Edificio I+D of the “Río Ebro” (Actur) Campus of the University of Zaragoza (Spain), on January, 30- February 1, 2013.
The Congress will also host a special session dedicated to the celebration of the 10th anniversary of our Institute.

The aim of the Congress is to give to all participants a chance to disseminate their work and strengthen existing collaborations or establish new ones, within the different research lines promoted by the BIFI Institute.
To this end, the format of the Congress will include plenary sessions in the morning, with invited and contributed talks, as well as short outlines of the progress in each research line of the Institute, providing the audience with an introduction on what will be discussed in the related workshops. The latter will run, in the afternoon, as two parallel sessions, devoted to “Biochemistry, Biophysics and Molecular Cell Biology”, and “Physics and Computation”. The program also includes presentations and tutorials about the experimental and computational facilities of the institute.
Researchers from any Institution are warmly invited to attend the meeting, up to the capacity limits of the conference rooms (accordingly, if necessary, the organizers might reject applications to participate).
More info: https://bifi.es/events/bifi2013/
Registration: https://bifi.es/events/bifi2013/registration.html

International workshop EU-China on scientific computing
2012-11-26 - 2012-11-28 | Edificio Institutos I+D, Mariano Esquillor, 50018 Zaragoza, Zaragoza, Zaragoza, 50018, España
This event, organized within the framework of the EU-funded SCC-Computing project, pursues to: (i) foster scientific collaboration between Europe and China in the ICT field; (ii) identify research challenges for further development of joint research projects in the area of computing systems; (iii) influence and make contributions to strategic research planning on future European Research Frameworks (Horizon 2020).
More info: http://www.scc-computing.eu/zaragoza

Researchers' Night
2012-09-28 17:00 - 21:00 | Campus San Francisco de la Universidad de Zaragoza
Por segundo año consecutivo, el BIFI va a participar en Researchers’ Night el próximo día 28 de Septiembre en la Universidad de Zaragoza. Pronto sabremos más detalles sobre los eventos a realizar.
http://ec.europa.eu/research/researchersnight/

RGD28 Congress
2012-07-09 - 2012-07-13 | Edificio Betancourt (Campus Río Ebro)
La Universidad de Zaragoza acoge durante los días 9 al 13 de julio un Congreso Internacional sobre la dinámica de gases, “RGD28 28th International Symposium on Rarefied Gas Dynamics”. En él participan unos 250 científicos de 28 países. Ingenieros, físicos, químicos y matemáticos debatirán sobre la dinámica de fluidos, con aplicaciones en aeronáutica, ingenieria química, civil e industrial, meteorología, construcciones navales y oceanografía.
Nota de prensa del congreso

Congreso NOLINEAL 2012
2012-06-04 - 2012-06-06 | Aula Magna de la Facultad de Ciencias, Campus San Francisco
El congreso No Lineal 2012 es la octava edición de la serie congresual “No Lineal” iniciada en Ávila en 1997, con sedes posteriores en Almagro (2000), Cuenca (2002), Toledo (2004), Ciudad Real (2006), Barcelona (2008) y Cartagena (2010). Este congreso tendrá lugar en Zaragoza, en la Facultad de Ciencias (Aula Magna), los días 4, 5 y 6 de Junio de 2012 y está organizado por la Universidad de Zaragoza, a través de los Institutos Universitarios de Investigación BIFI (Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos) e IUMA (Instituto Universitario de Matemáticas y sus Aplicaciones).
Más info: http://neptuno.unizar.es/jgg/nolineal2012
Nota de prensa

BIFI 2012 - Protein Targets: Discovery of Bioactive Compounds
2012-02-01 - 2012-02-04 | IberCaja – Patio de la Infanta Center (Obra Social IberCaja)
The V International Conference of the Institute for Biocomputation and Physics of Complex Systems (BIFI) will take place on February 1-4, 2012.
The meeting will be an international conference on Drug Discovery from a protein perspective, covering most of the initial steps in drug discovery and preclinical studies (new protein targets, protein target validation, new methodologies and tools for structural and functional characterization, experimental and computational high-throughput screening, etc.). We wish the conference to represent a venue for gathering active researchers on drug discovery, with strong roots in the scientific and academic communities to discuss recent developments and future challenges in the field.

More info: https://bifi.es/bifi2012
