{"id":2215,"date":"2016-11-01T09:56:45","date_gmt":"2016-11-01T08:56:45","guid":{"rendered":"http:\/\/new.bifi.es\/es\/biochemistry-mcb\/"},"modified":"2025-11-20T21:18:01","modified_gmt":"2025-11-20T20:18:01","slug":"bioquimica-bmc-old","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bifi.es\/es\/bioquimica-bmc-old\/","title":{"rendered":"OLD Bioqu\u00edmica y BMC OLD"},"content":{"rendered":"<div class=\"wpb-content-wrapper\">[mk_page_section bg_image=\u00bbhttps:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/research_investigacion_bifi-bn-2.jpg\u00bb bg_position=\u00bbcenter top\u00bb bg_repeat=\u00bbno-repeat\u00bb bg_stretch=\u00bbtrue\u00bb enable_3d=\u00bbtrue\u00bb video_opacity=\u00bb0.7&#8243; min_height=\u00bb400&#8243; js_vertical_centered=\u00bbtrue\u00bb padding_top=\u00bb0&#8243; top_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb bottom_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb sidebar=\u00bbsidebar-1&#8243;][vc_column][mk_fancy_title tag_name=\u00bbh1&#8243; color=\u00bb#ffffff\u00bb size=\u00bb60&#8243; force_font_size=\u00bbtrue\u00bb size_tablet=\u00bb40&#8243; size_phone=\u00bb28&#8243; font_weight=\u00bb300&#8243; txt_transform=\u00bbuppercase\u00bb letter_spacing=\u00bb2&#8243; font_family=\u00bbLato\u00bb font_type=\u00bbgoogle\u00bb align=\u00bbcenter\u00bb]Bioqu\u00edmica y BMC<span style=\"color: #ef5142;\">.<\/span>[\/mk_fancy_title][\/vc_column][\/mk_page_section][vc_row fullwidth=\u00bbtrue\u00bb][vc_column][mk_divider style=\u00bbthin_solid\u00bb thin_color_style=\u00bbgradient_color\u00bb thin_grandient_color_from=\u00bb#da391a\u00bb thin_grandient_color_to=\u00bb#fcd404&#8243; thin_gradient_color_angle=\u00bbhorizontal\u00bb thin_grandient_color_fallback=\u00bb#da391a\u00bb thickness=\u00bb10&#8243; margin_top=\u00bb0&#8243; margin_bottom=\u00bb160&#8243;][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css=\u00bb.vc_custom_1477994415462{padding-bottom: 100px !important;}\u00bb][vc_column width=\u00bb1\/3&#8243;][vc_single_image image=\u00bb377&#8243; img_size=\u00bbfull\u00bb onclick=\u00bblink_image\u00bb][\/vc_column][vc_column width=\u00bb1\/3&#8243;][vc_column_text]El objetivo final de esta \u00e1rea del BIFI es entender y controlar sistemas biol\u00f3gicos que dependen de prote\u00ednas de inter\u00e9s para aplicaciones qu\u00edmicas, biotecnol\u00f3gicas, farmacol\u00f3gicas y biom\u00e9dicas. El conocimiento del comportamiento de las prote\u00ednas a los niveles molecular y celular permite la interpretaci\u00f3n de los mecanismos macrosc\u00f3picos de las funciones celulares en las que est\u00e1n implicados, pero se desconocen todav\u00eda muchos de los par\u00e1metros que controlan estos procesos. Las prote\u00ednas adoptan una estructura tridimensional organizada \u00edntimamente relacionada con su funci\u00f3n, que puede ser regulada mediante la interacci\u00f3n con otras biomol\u00e9culas y\/o peque\u00f1as mol\u00e9culas org\u00e1nicas. Las disposiciones estructurales defectuosas pueden impedir las interacciones de las prote\u00ednas con otras mol\u00e9culas, provocando diversas patolog\u00edas en los seres humanos.[\/vc_column_text][\/vc_column][vc_column width=\u00bb1\/3&#8243;][vc_column_text css=\u00bb.vc_custom_1696423253052{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]Muchas otras enfermedades son producidas tambi\u00e9n por virus y microorganismos infecciosos, y una forma de detenerlos puede ser el bloqueo de alg\u00fan paso de su ciclo vital que implica a una biomol\u00e9cula proteica. Adem\u00e1s, peque\u00f1as mol\u00e9culas del medio ambiente pueden funcionar tambi\u00e9n como inhibidores o activadores t\u00f3xicos de actividades particulares en diferentes organismos, y en muchos casos pueden ser usadas como efectores de la expresi\u00f3n de algunos genes y de la producci\u00f3n y acci\u00f3n de determinadas prote\u00ednas. Las l\u00edneas de investigaci\u00f3n en Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular y Celular en el BIFI estudian distintos sistemas biol\u00f3gicos implicados en rutas moleculares clave que sirven como modelos de otros sistemas, combinando metodolog\u00edas cl\u00e1sicas de este \u00e1rea con m\u00e9todos biof\u00edsicos y computacionales. Las aplicaciones del conocimiento obtenido se utilizan adicionalmente para controlar y modular el comportamiento de determinados sistemas con beneficios para la sociedad.<\/p>\n<ul>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Regulaci\u00f3n g\u00e9nica, fisiolog\u00eda y aplicaciones biotecnol\u00f3gicas de cianobacterias<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Biolog\u00eda evolutiva y gen\u00f3mica de las plantas<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Gen\u00f3mica funcional del sistema OXPHOS (GENOXPHOS)<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Desarrollo de antimicrobianos y mecanismos de resistencia<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Apoptosis y metabolismo<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Gen\u00f3mica\u00a0computacional y Bio-medicina de sistemas<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<\/ul>\n[\/vc_column_text][\/vc_column][\/vc_row][vc_row fullwidth=\u00bbtrue\u00bb][vc_column][mk_divider style=\u00bbthin_solid\u00bb thin_color_style=\u00bbgradient_color\u00bb thin_grandient_color_from=\u00bb#da391a\u00bb thin_grandient_color_to=\u00bb#fcd404&#8243; thin_gradient_color_angle=\u00bbhorizontal\u00bb thin_grandient_color_fallback=\u00bb#da391a\u00bb thickness=\u00bb10&#8243; margin_top=\u00bb0&#8243; margin_bottom=\u00bb160&#8243;][\/vc_column][\/vc_row][vc_row][vc_column][vc_tabs orientation=\u00bbvertical\u00bb responsive=\u00bbfalse\u00bb container_bg_color=\u00bb#ffffff\u00bb][vc_tab title=\u00bbRegulaci\u00f3n g\u00e9nica, fisiolog\u00eda y aplicaciones biotecnol\u00f3gicas de cianobacterias\u00bb tab_id=\u00bb1477995658098-2-10&#8243;][vc_column_text title=\u00bbRegulaci\u00f3n g\u00e9nica, fisiolog\u00eda y aplicaciones biotecnol\u00f3gicas de cianobacterias\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1696926084428{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Mar\u00eda F. Fillat Castej\u00f3n<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Teresa Bes Fustero (Profesora titular)<br \/>\nEmma Sevilla Miguel (Contratado doctor)<br \/>\nAna Alonso Sim\u00f3n (Ayudante doctor)<br \/>\nJorge Gu\u00edo Mart\u00ednez (Contratado FPU)<br \/>\nIrene Oliv\u00e1n Muro (Contratada FPU)<br \/>\nIn\u00e9s Feder\u00edo Zalaya (Contratada programa Investigo)<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>Las cianobacterias son microorganismos que realizan la fotos\u00edntesis oxig\u00e9nica y son capaces de colonizar los h\u00e1bitats m\u00e1s extremos. Debido a su abundancia y ubicuidad, las cianobacterias juegan un papel fundamental en los ciclos del carbono y del nitr\u00f3geno y constituyen la base de la cadena tr\u00f3fica en ecosistemas acu\u00e1ticos. Algunas especies de cianobacterias son capaces de fijar el nitr\u00f3geno atmosf\u00e9rico y se han utilizado en la producci\u00f3n de fertilizantes. As\u00ed mismo, el uso de cianobacterias para la producci\u00f3n de biodiesel o en la eliminaci\u00f3n de metales pesados de aguas residuales son \u00e1reas de trabajo en continuo desarrollo.<\/p>\n<p>La l\u00ednea de investigaci\u00f3n estudia la regulaci\u00f3n del metabolismo del hierro en las cianobacterias y su relaci\u00f3n con el metabolismo del nitr\u00f3geno, el estr\u00e9s oxidativo, la producci\u00f3n de cianotoxinas y la formaci\u00f3n de biofilms. Todos estos procesos est\u00e1n interrelacionados mediante una familia de reguladores transcripcionales denominada FUR (ferric uptake regulator). La mayor parte de las cianobacterias expresan tres par\u00e1logos FUR denominados FurA (Fur), Zur (FurB) y PerR (FurC). Aunque la faceta mejor estudiada de estas prote\u00ednas es la de regulador transcripcional, en cianobacterias tienen un car\u00e1cter multifuncional, actuando mediante diversas estrategias no bien caracterizadas, complementando su actividad como reguladores transcripcionales.<\/p>\n<p>Por otra parte, los trabajos del grupo de investigaci\u00f3n han demostrado que las prote\u00ednas FUR son reguladores globales en cianobacterias, que a su vez controlan a otros reguladores, sistemas de dos componentes y factores sigma. Por ello, se est\u00e1 trabajando en la identificaci\u00f3n de nuevas redes reguladoras mediadas por prote\u00ednas FUR, caracterizando una serie de reguladores modulados por par\u00e1logos FUR cuya funci\u00f3n es desconocida.<\/p>\n<p>Otro de los campos de estudio del grupo es la formaci\u00f3n de biofilms de cianobacterias, por las implicaciones medioambientales y las aplicaciones que tienen estas formaciones. Para ello se est\u00e1 usando como modelo la cianobacteria filamentosa fijadora de nitr\u00f3geno <em>Anabaena<\/em> sp. PCC7120.<\/p>\n<p>El estudio del potencial de las cianobacterias en biorremediaci\u00f3n, en concreto de su capacidad de biodegradar lindano o \u03b3-hexaclorociclohexano (\u03b3-HCH) y sus is\u00f3meros (\u03b1-,\u03b2-,\u03b4-HCH) ha puesto de manifiesto que mutantes de sobreexpresi\u00f3n de FurC\u00a0 en <em>Anabaena <\/em>PCC7120, tienen una mayor capacidad de biorremediaci\u00f3n. La contaminaci\u00f3n por hexaclorociclohexano es un problema a nivel mundial, que afecta muy directamente a la Comunidad Aut\u00f3noma de Arag\u00f3n debido a la actividad que la industria productora de lindano, Inquinosa, llev\u00f3 a cabo en Sabi\u00f1\u00e1nigo hace unos a\u00f1os y a que los vertidos que gener\u00f3 siguen almacenados en territorio aragon\u00e9s. Los estudios realizados por el grupo en los \u00faltimos a\u00f1os, han permitido avanzar en la comprensi\u00f3n de la regulaci\u00f3n de la expresi\u00f3n de los genes implicados en la degradaci\u00f3n del lindano y sus is\u00f3meros, e identificar un gen candidato para el dise\u00f1o de un biosensor. Este biosensor podr\u00eda permitir una alerta temprana de riesgo en el caso de que estos organoclorados pasaran a cuerpos de agua. En este contexto, se va a trabajar en i) el desarrollo de un prototipo de biosensor de HCH de c\u00e9lulas enteras, y ii) la identificaci\u00f3n de los intermediarios de la ruta de degradaci\u00f3n de lindano en cianobacterias.<\/p>\n<p>El grupo de investigaci\u00f3n persigue como objetivos principales:<\/p>\n<p>\u2013 Identificaci\u00f3n de redes reguladoras mediadas por la familia FUR en cianobacterias, y caracterizaci\u00f3n de nuevos reguladores transcripcionales que forman parte de estas redes y tienen funciones desconocidas.<\/p>\n<p>&#8211; Estudio de la formaci\u00f3n de biofilms en <em>Anabaena<\/em>: condiciones que facilitan su formaci\u00f3n, genes implicados y potenciales usos de los biofilms en biorremediaci\u00f3n y biofertilizaci\u00f3n.<\/p>\n<p>\u2013 Caracterizaci\u00f3n del regulador Fur del pat\u00f3geno <em>Clostridium difficile<\/em> y evaluaci\u00f3n de esta prote\u00edna como potencial diana terape\u00faticas mediante la alteraci\u00f3n de su actividad mediante el escrutinio de quimiotecas.<\/p>\n<p>-Aplicaci\u00f3n de las cianobacterias como organismos relevantes en biorremediaci\u00f3n. Concretamente se est\u00e1 estudiando la capacidad de la cianobacteria modelo <em>Anabaen<\/em>a PCC7120 de degradar lindano y sus is\u00f3meros. Estos estudios han conducido a la obtenci\u00f3n de informaci\u00f3n que puede utilizarse para desarrollar un biosensor para alerta temprana de presencia de lindano en aguas.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.<\/strong><strong>Unbalancing Zur (FurB)-mediated homeostasis in <em>Anabaena<\/em> sp. PCC7120: Consequences on metal trafficking, heterocyst development and biofilm formation. <\/strong>Olivan-Muro I, Sarasa-Buisan C, Guio J, Arenas J, Sevilla E, Fillat MF. Environ Microbiol. 2023 Jun 14. doi: 10.1111\/1462-2920.16434.<\/p>\n<p><strong>2. Responses of <em>Anabaena <\/em>sp. PCC7120 to lindane: Physiological effects and differential expression of potential <em>lin<\/em> genes.<\/strong> Gu\u00edo J, Fillat MF, Peleato ML, Sevilla E. Microbiology open. 2023 Jun;12(3):e1355. doi: 10.1002\/mbo3.1355.<\/p>\n<p><strong>3. Expanding the FurC (PerR) regulon in <em>Anabaena<\/em> (<em>Nostoc<\/em>) sp. PCC 7120: Genome-wide identification of novel direct targets uncovers FurC participation in central carbon metabolism regulation. <\/strong>Sarasa-Buisan C, Gu\u00edo J, Peleato ML, Fillat MF, Sevilla E. PLoS One. 2023 Aug 7;18(8):e0289761. doi: 10.1371\/journal.pone.0289761. eCollection 2023.<\/p>\n<p><strong>4. Metal binding and oligomerization properties of FurC (PerR) from <em>Anabaena<\/em> sp. PCC7120: an additional layer of regulation?<\/strong> Sarasa-Buisan C, Emonot E, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Sevilla E, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Crouzy S, Bes MT, Michaud-Soret I, Fillat MF. Metallomics. 2022 Oct 20;14(10):mfac077. doi: 10.1093\/mtomcs\/mfac077.<\/p>\n<p><strong>5. FurC (PerR) from <em>Anabaena<\/em> sp. PCC7120: a versatile transcriptional regulator engaged in the regulatory network of heterocyst development and nitrogen fixation<\/strong>. Sarasa-Buisan C, Guio J, Broset E, Peleato ML, Fillat MF, Sevilla E. Environ Microbiol. 2022 Feb;24(2):566-582. doi: 10.1111\/1462-2920.15552.<\/p>\n<p><strong>6. Thioredoxin Dependent Changes in the Redox States of FurA from <em>Anabaena<\/em> sp. <\/strong><strong>PCC 7120. <\/strong>Gu\u00edo J, Bes MT, Balsera M, Calvo-Begueria L, Sevilla E, Peleato ML, Fillat MF. Antioxidants (Basel). 2021 Jun 4;10(6):913. doi: 10.3390\/antiox10060913.<\/p>\n<p><strong>7. Fur-like proteins: beyond the Fur uptake regulator (Fur) paralog<\/strong>. Sevilla E, Bes MT, Peleato Ml, Fillat MF. Archives in Biochemistry and Biophysics,701: 108770. doi: 10.1016\/j.abb.2021.108770.<\/p>\n<p><strong>8. 2-oxoglutarate modulates the affinity of FurA for the ntcA promoter in <em>Anabaena<\/em> sp. PCC 7120. <\/strong>Guio, Jorge; Sarasa-Buisan, Cristina; Velazquez-Campoy, Adrian; et \u00e1l.\u00a0\u00a0FEBS Lett. 2020 Jan;594(2):278-289. doi: 10.1002\/1873-3468.13610.<\/p>\n<p><strong>9. Regulation by FurC in <em>Anabaena<\/em> Links the Oxidative Stress Response to Photosynthetic Metabolism<u>.<\/u><\/strong>\u00a0Sevilla E, Sarasa-Buisan C, Gonz\u00e1lez A, Cases R, Kufryk G, Peleato ML,\u00a0<strong>Fillat MF<\/strong>. Plant Cell Physiol. 2019 Aug 1;60(8):1778-1789. doi: 10.1093\/pcp\/pcz094.2.<\/p>\n<p><strong>10. Redox-Based Transcriptional Regulation in Prokaryotes: Revisiting Model Mechanisms.\u00a0<\/strong>Sevilla E, Bes MT, Gonz\u00e1lez A, Peleato ML,\u00a0<strong>Fillat MF<\/strong>. Antioxid Redox Signal. 2019 May 1;30(13):1651-1696. doi: 10.1089\/ars.2017.7442. Epub 2018 Sep 18.<\/p>\n<p><strong>11. Transcriptional regulators: valuable targets for novel antibacterial strategies.\u00a0<\/strong>Gonz\u00e1lez A,\u00a0<strong>Fillat MF<\/strong>, Lanas \u00c1. Future Med Chem. 2018 Mar 1;10(5):541-560. doi: 10.4155\/fmc-2017-0181. Epub 2018 Feb 20. Review.<\/p>\n<p><strong>12. Molecular basis for the integration of environmental signals by FurB from\u00a0<em>Anabaena<\/em>\u00a0sp. PCC 7120<\/strong>.\u00a0Sein-Echaluce VC, Pallar\u00e9s MC, Lostao A, Yruela I, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Luisa Peleato M,\u00a0<strong>Fillat MF<\/strong>. Biochem J. 2018 Jan 5;475(1):151-168. doi: 10.1042\/BCJ20170692.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p style=\"margin: .1pt 0cm .1pt 0cm;\"><strong><span lang=\"ES-TRAD\">1.- E35_23R: Grupo de referencia biolog\u00eda estructural. <\/span><\/strong><span lang=\"ES-TRAD\">Gobierno de Arag\u00f3n.\u00a0Duraci\u00f3n: 01\/01\/2023 \u2013\u00a031\/12\/2025. Subvenci\u00f3n: 37.743 euros. PI:\u00a0Marta Mart\u00ednez-J\u00falvez y M\u00aa Teresa Bes Fustero.\u00a0Investigadores: 10.<\/span><\/p>\n<p style=\"margin: .1pt 0cm .1pt 0cm;\"><strong><span lang=\"ES-TRAD\">2<\/span><\/strong><span lang=\"ES-TRAD\">.- <strong>Redes reguladoras implicadas en la respuesta a estr\u00e9s y la formaci\u00f3n de biofilms en cianobacterias. Identificaci\u00f3n de nuevas rutas vinculadas a las prote\u00ednas FUR. <\/strong>IP Mar\u00eda Francisca Fillat Castej\u00f3n<strong>. <\/strong>Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n. 01\/06\/2020 &#8211; 31\/05\/2024.\u00a0 Duraci\u00f3n: 4 a\u00f1os<\/span><\/p>\n<p style=\"margin: .1pt 0cm .1pt 0cm;\"><strong><span lang=\"ES-TRAD\">3.-\u00a0Multifuncionalidad de las prote\u00ednas FUR en cianobacterias: mecanismos alternativos de regulaci\u00f3n del metabolismo y contribuci\u00f3n a la formaci\u00f3n de biofilms.\u00a0<\/span><\/strong><span lang=\"ES-TRAD\">MINECO.\u00a0Duraci\u00f3n: 01\/01\/2017 \u2013 31\/12\/2019. Subvenci\u00f3n: 140.000 euros.\u00a0PI: Mar\u00eda F. Fillat Castej\u00f3n.\u00a0Investigadores: 5.<\/span><\/p>\n<p style=\"margin: .1pt 0cm .1pt 0cm;\"><strong><span lang=\"ES-TRAD\">4.-\u00a0B18 BIOLOG\u00cdA ESTRUCTURAL.\u00a0<\/span><\/strong><span lang=\"ES-TRAD\">Gobierno de Arag\u00f3n.\u00a0Duraci\u00f3n: 01\/01\/2014 \u2013\u00a031\/12\/2016. Subvenci\u00f3n: 20.609 euros. PI:\u00a0Mar\u00eda Luisa Peleato S\u00e1nchez.\u00a0Investigadores: 16.<\/span><\/p>\n<p style=\"margin: .1pt 0cm .1pt 0cm;\"><strong><span lang=\"ES-TRAD\">5.-<\/span><\/strong><span lang=\"ES-TRAD\"> <strong>Identificaci\u00f3n y aplicaciones sint\u00e9ticas de nuevos biocatalizadores oxidativos en biotecnolog\u00eda industrial. (BIOXCAT). <\/strong>Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. Duraci\u00f3n: 01\/01\/2022-31\/12\/2023. Subvenci\u00f3n: 190.900 euros. PI: Patricia Ferreira y Juan Mangas. Investigadores: 5.<\/span><\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>Dr. I. Michaud-Soret (Institut de Recherche en Technologie et Science pour le Vivant. CEA, Grenoble, Francia)<\/li>\n<li>Dr. R. Helm (Virginia Tech, USA)<\/li>\n<li>Dr. Himadri Pakrasi (Washington St. University, USA)<\/li>\n<li>Conrad Mullineaux (Queen Mary, University of London, UK)<\/li>\n<li>Dr. I. Luque (Instituto de Bioqu\u00edmica vegetal y Fotos\u00edntesis, CSIC, Sevilla, Espa\u00f1a)<\/li>\n<li>Dr. Giulia Veronesi (ESFR, Grenoble, Francia)<\/li>\n<li>Dr. A. Lostao (Instituto de Nanociencia de Arag\u00f3n, Universidad de Zaragoza, Espa\u00f1a)<\/li>\n<li>Dr. A. Lanas (Instituto Aragon\u00e9s de Ciencias de la Salud, Zaragoza, Espa\u00f1a)<\/li>\n<li>Dra. Mar\u00eda Jos\u00e9 Bonete (Universidad de Alicante, Alicante, Espa\u00f1a)<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Contacto<\/strong><\/p>\n<p>Mar\u00eda F. Fillat, e-mail: <a href=\"mailto:fillat@unizar.es\">fillat@unizar.es<\/a><br \/>\nX del grupo: @cyanofur[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbBiolog\u00eda evolutiva y gen\u00f3mica comparada de plantas\u00bb tab_id=\u00bb1478179836977-7-10&#8243;][vc_column_text title=\u00bbBiolog\u00eda evolutiva y gen\u00f3mica comparada de plantas\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1728389962715{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Pilar Catal\u00e1n Rodr\u00edguez<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Pilar Catal\u00e1n Rodr\u00edguez<br \/>\nErnesto P\u00e9rez Collazos<br \/>\nSamira Ben-Menni Schuler<br \/>\nMaria \u00c1ngeles Decena Rodr\u00edguez<br \/>\nMiguel Campos C\u00e1ceres<br \/>\nAlba Sotomayor Alge<br \/>\nYana Malymon<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>El objetivo general de nuestra investigaci\u00f3n es establecer sistemas de plantas modelo de referencia (<em>Brachypodium<\/em>) mediante an\u00e1lisis gen\u00f3mico-funcionales y ecol\u00f3gicos, y la potencial transferencia de los resultados obtenidos con ellas a otras plantas de inter\u00e9s agron\u00f3mico y biocombustible. Complementariamente a ello, profundizamos en la investigaci\u00f3n de gram\u00edneas silvestres en <em>hotspots<\/em> mundiales, desentra\u00f1ando sus genomas y su evoluci\u00f3n, las interacciones de gram\u00edneas con sus hongos end\u00f3fitos y con el microbioma del suelo y sus implicaciones co-evolutivas y adaptativas. Tambi\u00e9n estudiamos la caracterizaci\u00f3n gen\u00e9tica y la conservaci\u00f3n de plantas end\u00e9micas o amenazadas.<\/p>\n<p><u>L\u00ednea 1: Gen\u00f3mica comparada y funcional de plantas modelo<\/u><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignleft wp-image-7624 size-full\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l1.jpg\" alt=\"\" width=\"482\" height=\"426\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l1.jpg 482w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l1-300x265.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 482px) 100vw, 482px\" \/>Los objetivos espec\u00edficos de nuestros estudios en las plantas modelo <em>Brachypodium<\/em> buscan obtener genomas completos y pan-genomas anotados de diversas especies clave, y dilucidar, a trav\u00e9s de gen\u00f3mica comparada funcional y filogen\u00f3mica de genomas, transcriptomas y elementos involucrados en la expresi\u00f3n g\u00e9nica (factores de transcripci\u00f3n, remodeladores cromat\u00ednicos), los mecanismos reguladores asociados con adaptaciones a estreses abi\u00f3ticos (sequ\u00eda, nutrientes) y a cambios fenot\u00edpicos en especies diploides\/alopoliploides y anuales\/perennes de <em>Brachypodium<\/em>. Tambi\u00e9n investigamos el impacto de los transposones en la expresi\u00f3n de la diversidad relacionada con rasgos fenot\u00edpicos y funcionales ecol\u00f3gicamente relevantes, y la potencial sobredominancia subgen\u00f3mica y regulaci\u00f3n epigen\u00f3mica que afecta a la expresi\u00f3n g\u00e9nica diferencial tras la poliploidizaci\u00f3n, y durante el desarrollo y la adaptaci\u00f3n ambiental de estas plantas.<\/p>\n<p><u>L\u00ednea 2: Sistem\u00e1tica y evoluci\u00f3n de angiospermas<\/u><\/p>\n<p>Utilizando los avances gen\u00f3micos obtenidos en <em>Brachypodium<\/em>, abordamos el an\u00e1lisis de los genomas apenas explorados de gram\u00edneas pasc\u00edcolas y forrajeras de alto valor ecol\u00f3gico y econ\u00f3mico (g\u00e9nero <em>Festuca<\/em> y subfamilia Pooideae), mediante aproximaciones de gen\u00f3mica comparada y funcional. En este contexto analizamos tambi\u00e9n las interacciones gram\u00ednea-end\u00f3fito. Para ello, secuenciaremos tambi\u00e9n genomas de especies f\u00fangicas del g\u00e9nero <em>Epichlo\u00eb<\/em>, investigando la filogen\u00f3mica de estos hongos haplo\/heteroploides, y su posible co-evoluci\u00f3n con sus gram\u00edneas hospedadoras. Complementariamente, investigaremos mediante an\u00e1lisis metabol\u00f3micos los beneficios del mutualismo en ecotipos de <em>Festuca<\/em> cuyos end\u00f3fitos les proporcionen ventajas adaptativas y agron\u00f3micas, incluida la s\u00edntesis de alcaloides con funci\u00f3n insecticida, para su selecci\u00f3n y posible registro como cultivares en la mejora de pastos, c\u00e9spedes y cubiertas herb\u00e1ceas.<\/p>\n<p><u><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-7626 size-full aligncenter\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l2.jpg\" alt=\"\" width=\"788\" height=\"573\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l2.jpg 788w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l2-300x218.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l2-768x558.jpg 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 788px) 100vw, 788px\" \/><\/u><\/p>\n<p><u>L\u00ednea 3: Gen\u00e9tica, ecolog\u00eda y conservaci\u00f3n de plantas en Arag\u00f3n y otras regiones<\/u><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignleft wp-image-7628 size-full\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l3.jpg\" alt=\"\" width=\"487\" height=\"634\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l3.jpg 487w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-l3-230x300.jpg 230w\" sizes=\"auto, (max-width: 487px) 100vw, 487px\" \/>Nuestra estrategia investigadora incluye adem\u00e1s nuestro compromiso cient\u00edfico y social en estudios de conservaci\u00f3n gen\u00e9tica (y gen\u00f3mica) de plantas end\u00e9micas y amenazadas, tanto de Arag\u00f3n como de otras regiones. Para ello emplearemos colecciones de herbario, datos de gen\u00e9tica (y gen\u00f3mica) poblacional, bio-\/filogeograf\u00eda y modelado de nicho ecol\u00f3gico, as\u00ed como an\u00e1lisis de biolog\u00eda de la reproducci\u00f3n y t\u00e9cnicas de conservaci\u00f3n <em>in-<\/em><em>situ<\/em> y <em>ex-situ<\/em>, y la divulgaci\u00f3n de estos resultados a la sociedad. Nuestras contribuciones constituyen una valiosa herramienta de transferencia de resultados de investigaci\u00f3n b\u00e1sica a la investigaci\u00f3n aplicada en la conservaci\u00f3n de la flora que permite una mejor gesti\u00f3n de las especies en riesgo de extinci\u00f3n y el seguimiento y control de las especies invasoras.<\/p>\n<h3><\/h3>\n<h3><\/h3>\n<h3><\/h3>\n<h3><\/h3>\n<h3><\/h3>\n<h3><\/h3>\n<h3><\/h3>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.\u00a0<\/strong>Mu W, Li K, Yang Y, Breiman A, Yang J, Wu Y, Wu S, Zhu M, Liu J, Nevo E, Catal\u00e1n P. 2023. <strong>Scattered differentiation of unlinked loci across the genome underlines ecological divergence of the selfing grass<\/strong> <em>Brachypodium stacei<\/em>. <em>PNAS <\/em>120: e2304848120<\/p>\n<p><strong>2.<\/strong> Mu W, Li K, Yang Y, Breiman A, Yang J, Wu J, Zhu M, Wang S, Catal\u00e1n P, Nevo E, Liu J. 2023. <strong>Subgenomic stability of progenitor genomes during repeated allotetraploid origins of the same grass <em>Brachypodium hybridum<\/em><\/strong>. <em>Molecular Biology Evolution <\/em>(accepted).<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong> Campos M, Kelley E, Gravendeel B, M\u00e9dail F, Christenhusz JM, Fay MF, Catal\u00e1n P, Leitch IJ, Forest F, Wilkin P, Viruel J. 2023. <strong>Genomic, spatial and morphometric data for discrimination of four species in the Mediterranean <em>Tamus<\/em> clade os yams (<em>Dioscorea<\/em>, Dioscoreaceae)<\/strong>. <em>Annals of Botany<\/em> 131(4):635-654.<\/p>\n<p><strong>4.<\/strong> Scarlett V, Lovell J, Shao M, Phillips J, Shu S, Lusinska J, Goodstein D, Jenkins J, Grimwood J, Barry K, Chalhoub B, Schmutz J, Hasterok R, Catalan P, Vogel J. 2022<strong>. <\/strong><strong>Multiple origins, one evolutionary trajectory: gradual<\/strong><strong> evolution characterizes distinct lineages of allotetraploid <em>Brachypodium<\/em><\/strong>. <em>Genetics<\/em>, 10.1093\/genetics\/iyac146.<\/p>\n<p><strong>5.<\/strong> Sancho R, Catal\u00e1n P, Contreras-Moreira B, Juenger TE, Des Marais DL. 2022. <strong>Patterns of pan-genome occupancy and gene co-expression under water-deficit in <em>Brachypodium distachyon<\/em><\/strong>. <em>Molecular Ecology<\/em> 31:5285-5306. doi: <a href=\"https:\/\/doi.org\/10.1111\/mec.16661\">10.1111\/mec.16661<\/a><\/p>\n<p><strong>6.<\/strong> Moreno-Aguilar MF, Inda LA, S\u00e1nchez A, Arnelas I, Catal\u00e1n P. 2022. <strong>Evolutionary dynamics of the repeatome explains contrasting differences in genome sizes and hybrid and polyploid origins of grass Loliinae lineages.<\/strong> <em>Frontiers in Plant Sciences <\/em>13: 901733. doi:\u00a0<a href=\"https:\/\/doi.org\/10.3389%2Ffpls.2022.901733\">10.3389\/fpls.2022.901733<\/a><\/p>\n<p><strong>7.<\/strong> Hasterok R, Catalan P, Hazen SP, Roulin AC, Vogel JP, Wang K, Mur LAJ. 2022. <strong><em>Brachypodium<\/em>: Twenty years as a grass biology model system; the way forward?<\/strong> <em>Trends in Plant Science<\/em> 27: 1002-1016. https:\/\/doi.org\/10.1016\/j.tplants.2022.04.008.<\/p>\n<p><strong>8.<\/strong> Sancho R, Inda LA, Diaz-Perez A, Des Marais D, Gordon SP, Vogel JP, Lusinska J, Hasterok R, Contreras-Moreira B, Catal\u00e1n P. 2022. <strong>Tracking the ancestry of <\/strong><strong>known and \u2018ghost\u2019 homeologous subgenomes in model grass <em>Brachypodium<\/em> polyploids<\/strong>. <em>The Plant Journal <\/em>109(6):1535-1558. doi: 10.1111\/tpj.15650. Epub 2022 Feb 8. PMID: 34951515.<\/p>\n<p><strong>9.<\/strong> Arnelas I, P\u00e9rez-Collazos E, L\u00f3pez-Mart\u00ednez J, Devesa JA, Catal\u00e1n P. 2022<strong>. <\/strong><strong>Molecular systematics of <em>Valerianella<\/em> Mill. (Caprifoliaceae): challenging the taxonomic value of genetically controlled carpological traits<\/strong>. <em>Plants<\/em> 11: 1276. https:\/\/doi.org\/10.3390\/plants11101276<\/p>\n<p><strong>10.<\/strong> Moreno-Aguilar MF, Inda LA, S\u00e1nchez A, Catal\u00e1n P, Arnelas I. 2022. <strong>Phylogenomics and systematics of overlooked Mesoamerican and South American polyploid broad-leaved <em>Festuca <\/em>grasses differentiate <em>F<\/em>. sects. <\/strong><strong><em>Glabricarpae<\/em><\/strong><strong> and <em>Ruprechtia<\/em> and <em>F<\/em>. subgen. <\/strong><strong><em>Asperifolia<\/em><\/strong><strong>, <em>Erosiflorae<\/em>, <em>Mallopetalon<\/em> and <em>Coironhuecu<\/em> (<em>subgen. nov.<\/em>).<\/strong> <em>Plants <\/em>11, 2303. \u00a0doi.org\/10.3390\/plants11172303<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.\u00a0<\/strong><strong>Co-evolution and adaptive speciation grass-endophyte (Festuca, Brachypodium, Epichlo\u00eb) in a pan-genomic framework (COEVOHOLOGENOME).<\/strong> Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. Proyecto PID2022-140074NB-I00. 2023- 2025. IP. P. Catal\u00e1n. Investigadores participantes del grupo: E. Perez, R. Sancho, M.A. Decena, M. Campos, A. Sotomayor, Y. Malymon. 281.250,00 euros<\/p>\n<p><strong>2. Integrative genomic characterization of the <em>Brachypodium<\/em> polyploid model to unravel bases of success of polyploidy in flowering plants. <\/strong>Joint Genome Institute. Department of Energy. Government of United States of America. Community Science Program (CSP) proposal 503504. INRA-Evry, University of Silesia, University of Aberystwyth. 2018-2022. IP: P. Catal\u00e1n. Investigadores participantes: E. Perez, R. Sancho, M.A. Decena, M. Campos, 7,5 TB of genomic and transcriptomic sequencing<\/p>\n<p><strong>\u00a03.\u00a0<\/strong><strong>Gram\u00ednea-end\u00f3fito-microbioma: evolucion, ecolog\u00eda y mejora ecosist\u00e9mica de pastos y cubiertas herb\u00e1ceas<\/strong>. Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. Proyecto TED2021-131073B-I00. 2022-2024. IP P. Catal\u00e1n. Investigadores participantes: E. Perez, R. Sancho, M.A. Decena, M. Campos, A. Sotomayor. 113.850,00 euros<\/p>\n<p><strong>4. Gram\u00ednea-Microbioma: registro de variedades protegidas de ecotipos de \u00e9lite y sus microbiomas. <\/strong>Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. Proyecto PDC2022-133712-I00. 2022-2024.IP. Catal\u00e1n. Investigadores participantes: E. Perez, R. Sancho, M. Campos, A. Sotomayor. 149.500,00 euros<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>COLABORADORES<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>John Vogel, Joint Genome Institute (DoE), USA<\/li>\n<li>David Des Marais, Massachussets Institute of Technology (MIT), USA<\/li>\n<li>Jianquan Liu, Lanzhou University, China<\/li>\n<li>Eviatar Nevo, University of Haifa, Israel<\/li>\n<li>Robert Hasterok, University of Silesia, Polonia<\/li>\n<li>Jan Hackel, University of Marburg, Alemania<\/li>\n<li>Itziar Arnelas, Universidad Complutense de Madrid, Espa\u00f1a<\/li>\n<li>I\u00f1igo Zabalgogeazcoa, IRNASA-CSIC, Espa\u00f1a<\/li>\n<li>Beatriz Rodriguez V\u00e1zquez-Aldana, IRNASA-CSIC, Espa\u00f1a<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>CONTACTO<\/strong><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/bioflora.web.bifi.es\/\">https:\/\/bioflora.web.bifi.es\/<\/a>[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbGen\u00f3mica funcional del sistema OXPHOS (GENOXPHOS)\u00bb tab_id=\u00bb1477995679810-4-3&#8243;][vc_column_text title=\u00bbGen\u00f3mica funcional del sistema OXPHOS (GENOXPHOS)\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1698674770414{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Patricio Fern\u00e1ndez Silva<br \/>\nPilar Bayona Bafaluy<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Nuria Garrido P\u00e9rez<br \/>\nPatricia Meade Huerta<br \/>\nRaquel Moreno Loshuertos<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>La actividad de la l\u00ednea \u201cGen\u00f3mica funcional del sistema OXPHOS: GENOXPHOS\u201d, adscrita al \u00e1rea de Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular, se basa en la comprensi\u00f3n de los factores gen\u00e9ticos y ambientales que controlan la organizaci\u00f3n y remodelaci\u00f3n del sistema OXPHOS mitocondrial. M\u00e1s concretamente, queremos analizar y entender el efecto de variantes de ensamblaje de supercomplejos (SCs) y de mutaciones en el mtDNA sobre la funci\u00f3n OXPHOS y sobre procesos como la capacidad de tumorig\u00e9nesis o la respuesta a tratamientos con nanopart\u00edculas. As\u00ed, nuestras principales l\u00edneas de trabajo son las siguientes:<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<ul>\n<li>Evaluaci\u00f3n de los efectos de alteraciones en el factor de inducci\u00f3n de apoptosis sobre aspectos de la funci\u00f3n mitocondrial como la producci\u00f3n de especies reactivas de ox\u00edgeno, la organizaci\u00f3n de complejos y supercomplejos (SCs)respiratorios, la funci\u00f3n OXPHOS, la biog\u00e9nesis mitocondrial o la inducci\u00f3n de muerte celular por la v\u00eda de Parthanatos.<\/li>\n<li>Estudio del papel de la mitocondria en los procesos de tumorig\u00e9nesis y met\u00e1stasis, analizando la funci\u00f3n mitocondrial y la organizaci\u00f3n del sistema OXPHOS en l\u00edneas tumorales con distinta capacidad invasiva, as\u00ed como su respuesta al tratamiento con f\u00e1rmacos metab\u00f3licos como el dicloroacetato, la metformina o la desoxiglucosa, entre otros.<\/li>\n<li>An\u00e1lisis del efecto del incremento de la temperatura sobre el ensamblaje y estabilidad de SCs respiratorios y la funci\u00f3n OXPHOS.<\/li>\n<li>Generaci\u00f3n y an\u00e1lisis del funcionamiento de nanoterm\u00f3metros intracelulares<\/li>\n<li>Puesta a punto de un sistema de hipertermia magn\u00e9tica local intracelular como terapia antitumoral.<\/li>\n<li>Estudio molecular de mutaciones en genes codificados en el mtDNA o en el genoma nuclear que afectan al sistema OXPHOS.<\/li>\n<li>Obtenci\u00f3n de c\u00e9lulas reprogramadas (iPSCs) a partir de fibroblastos para diferenciarlas en los tejidos m\u00e1s com\u00fanmente afectados en pacientes.<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.-\u00a0<\/strong>Moreno-Loshuertos, R., Movilla, N., Marco-Brualla, J., Soler-Agesta, R., Ferreira, P., Enri\u0301quez, J. A., &amp; Ferna\u0301ndez-Silva, P. A <strong>Mutation in Mouse MT-ATP6 Gene Induces Respiration Defects and Opposed Effects on the Cell Tumorigenic Phenotype<\/strong>. International Journal of Molecular Sciences, (2023), 24(2), 1300. <a href=\"https:\/\/doi.org\/10.3390\/ijms24021300\">https:\/\/doi.org\/10.3390\/ijms24021300<\/a><\/p>\n<p><strong>2.<\/strong> Moreno-Loshuertos, R., Marco-Brualla, J., Meade, P., Soler-Agesta, R., Enriquez, J. A., &amp; Ferna\u0301ndez-Silva, P. <strong>How hot can mitochondria be? <\/strong><strong>Incubation at temperatures above 43 \u00b0C induces the degradation of respiratory complexes and supercomplexes in intact cells and isolated mitochondria<\/strong>. Mitochondrion, (2023), 69, 83\u201394. <a href=\"https:\/\/doi.org\/10.1016\/j.mito.2023.02.002\">https:\/\/doi.org\/10.1016\/j.mito.2023.02.002<\/a>.<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong> Ruth Soler-Agesta, Joaqui\u0301n Marco-Brualla, Patricio Ferna\u0301ndez-Silva, Pilar Mozas, Alberto Anel, Raquel Moreno Loshuertos. <strong>Transmitochondrial Cybrid Generation Using Cancer Cell Lines<\/strong>. (JoVe) J. Vis. Exp. (2023), (193), e65186, doi:10.3791\/65186 (2023). URL: jove.com\/video\/65186.<\/p>\n<p><strong>4.<\/strong> Y Gu, R. Pin\u0303ol, R. Moreno-Loshuertos, C. D. S. Brites, J. Zeler, A. Marti\u0301nez, G. Maurin- Pasturel, P. Ferna\u0301ndez-Silva, J. Marco-Brualla, P. Te\u0301llez, R. Cases, R. Navarro Belsue\u0301, D. Bonvin, L. D. Carlos*, and A. Milla\u0301n* <strong>Local Temperature Increments and Induced Cell Death in Intracellular Magnetic Hyperthermia<\/strong>. ACS Nano 2023, 17, 6822\u20136832. DOI: 10.1021\/acsnano.3c00388.<\/p>\n<p><strong>5.<\/strong> Soler-Agesta R, Marco-Brualla J, Minja\u0301rez-Sa\u0301enz M, Yim CY, Marti\u0301nez-Ju\u0301lvez M, Price MR, Moreno-Loshuertos R, Ames TD, Jimeno J, Anel A. <strong>PT-112 Induces Mitochondrial Stress and Immunogenic Cell Death, Targeting Tumor Cells with Mitochondrial Deficiencies<\/strong>. Cancers (Basel). (2022); 14(16), 3851. doi: 10.3390\/cancers14163851.<\/p>\n<p><strong>6.<\/strong> Novo N, Romero-Tamayo S, Marcuello C, Boneta S, Blasco-Machin I, Vela\u0301zquez- Campoy A, Villanueva R, Moreno-Loshuertos R, Lostao A, Medina M, Ferreira P. <strong>Beyond a platform protein for the degradosome assembly: The Apoptosis-Inducing Factor as an efficient nuclease involved in chromatinolysis<\/strong>. PNAS Nexus (2022), 2(2), 312. doi: 10.1093\/pnasnexus\/pgac312.<\/p>\n<p><strong>7.<\/strong> Jim\u00e9nez-Salvador I, Meade P, Iglesias E, Bayona-Bafaluy P, Ruiz-Pesini E <strong>Developmental origins of Parkinson disease: Improving the rodent models..Ageing<\/strong> Res Rev. 2023 Apr;86:101880. doi: 10.1016\/j.arr.2023.101880. Epub 2023 Feb 10.<\/p>\n<p><strong>8.<\/strong> Ruiz-Pesini E, Bayona-Bafaluy MP, Sanclemente T, Puzo J, Montoya J, Pacheu-Grau D. <strong>Mitochondrial Genetic Background May Impact Statins Side Effects and<\/strong> <strong>Atherosclerosis Development in Familial Hypercholesterolemia<\/strong>. Int J Mol Sci. 2022 Dec 28;24(1):471. doi: 10.3390\/ijms24010471.<\/p>\n<p><strong>9.<\/strong> Bayona-Bafaluy MP, L\u00f3pez-Gallardo E, Emperador S, Pacheu-Grau D, Montoya J, Ruiz-Pesini E. <strong>Is population frequency a useful criterion to assign pathogenicity to newly described mitochondrial DNA variants?<\/strong> Orphanet J Rare Dis. 2022 Aug 19;17(1):316. doi: 10.1186\/s13023-022-02428-0.<\/p>\n<p><strong>10.<\/strong> Bayona-Bafaluy MP, Montoya J, Ruiz-Pesini E. <strong>Oxidative phosphorylation system and cell culture media<\/strong>. Trends Cell Biol. 2021 Aug;31(8):618-620. doi: 10.1016\/j.tcb.2021.05.003. Epub 2021 May 26.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.<\/strong>\u201c<strong>Nanotermometro intracelular para el estudio termico de la fisiologia celular y terapia del cancer por hipertemia magnetica local<\/strong>:PID2021-124354NB-I00 :\u00a0Ministerio Ciencia Innovaci\u00f3n y Universidades; IPs\u00a0Angel Mill\u00e1n (CSIC\/)\/Raquel Moreno Loshuertos (Universidad de Zaragoza). 01\/09\/2022 al 31\/08\/2025. 700,00\u00a0Euros<\/p>\n<p><strong>2. PID2021-124354NB-I00<\/strong>. Plan Estatal de Investigacio\u0301n Cienti\u0301fica, Te\u0301cnica y de Innovacio\u0301n. Ministerio Ciencia Innovaci\u00f3n y Universidades; convocatoria 2021. IPs: M\u00aa Pilar Bayona Bafaluy y Eduardo Ruiz Pesini (Universidad de Zaragoza): 01\/09\/2022 al 31\/08\/2025<\/p>\n<p><strong>10.-\u00a0<\/strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\"><strong>EUMITOCOMBAT: rational treatment strategies combating mitocondrial oxidative phosphorilation (OXPHOS) disorders.<\/strong> Uni\u00f3n Europea (<\/span><\/span><span style=\"color: #000000;\"><span style=\"font-family: Arial, serif;\">LSHM-CT-2004-503116). Investigador principal: Jos\u00e9 Antonio Enr\u00edquez.<\/span><\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>Dr. Jos\u00e9 Antonio Enriquez. Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares (CNIC). Madrid-Spain<\/li>\n<li>Massimo Zeviani. MBU-MRC. Cambridge-UK<\/li>\n<li>Eva Monle\u00f3n. Dtpo. de Anatom\u00eda e Histolog\u00eda Humanas- UZ<\/li>\n<\/ul>\n[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab tab_id=\u00bb1477994206-1-76&#8243;][vc_column_text css=\u00bb.vc_custom_1696423299162{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb][\/vc_column_text][mk_padding_divider size=\u00bb70&#8243;][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbDescubrimiento y desarrollo de antimicrobianos y mecanismos de resistencia (D2AMR)\u00bb tab_id=\u00bb1477994206-2-50&#8243;][vc_column_text title=\u00bbDesarrollo de Antimicrobianos y Mecanismos de Resistencia\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1583834043758{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-4882 aligncenter\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/img_4150_ainsa.jpeg\" alt=\"\" width=\"640\" height=\"427\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/img_4150_ainsa.jpeg 640w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/img_4150_ainsa-300x200.jpeg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 640px) 100vw, 640px\" \/><\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Jos\u00e9 Antonio A\u00ednsa Claver<br \/>\nSantiago Ram\u00f3n-Garc\u00eda<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Jos\u00e9 Antonio A\u00ednsa Claver,\u00a0<em>PI<\/em><br \/>\nSantiago Ram\u00f3n-Garc\u00eda, PI<br \/>\nAinhoa Luc\u00eda Quintana,\u00a0Postdoc<br \/>\nClara Aguilar P\u00e9rez,\u00a0Doctorando<br \/>\nErnesto Anoz Carbonell,\u00a0Doctorando<br \/>\nAna Cristina Mill\u00e1n Placer, Doctorando<br \/>\nMarta Mar\u00eda G\u00f3mara Lomero, Doctorando<br \/>\nMar\u00eda Pilar Arenaz Callao, Doctorando<br \/>\nLara Mu\u00f1oz Mu\u00f1oz, Doctorando<br \/>\nBego\u00f1a Gracia D\u00edaz,\u00a0T\u00e9cnico de Laboratorio<em><br \/>\n<\/em><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>La l\u00ednea de investigaci\u00f3n Desarrollo de Antimicrobianos y Mecanismos de Resistencia tiene como objetivo estudiar los mecanismos de resistencia a antibi\u00f3ticos de diversos pat\u00f3genos microbianos y utilizar esta informaci\u00f3n para identificar nuevas mol\u00e9culas con actividad antimicrobiana y caracterizar sus mecanismos de acci\u00f3n y resistencia. Este trabajo se financia con fondos p\u00fablicos conseguidos en convocatorias competitivas nacionales e internacionales.<\/p>\n<p>En los \u00faltimos a\u00f1os hemos caracterizado diversas bombas de eflujo de <em>Mycobacterium tuberculosis<\/em> y hemos contribuido a la identificaci\u00f3n de compuestos que evaden el mecanismo de resistencia mediado por las bombas de eflujo y por lo tanto presentan mayor actividad antimicrobiana. Estamos caracterizando nuevas dianas para antimicrobianos, tanto en <em>Mycobacterium<\/em> como en otros pat\u00f3genos bacterianos, y explorando nuevas mol\u00e9culas (p\u00e9ptidos, etc.) como alternativas a los antibi\u00f3ticos convencionales.<\/p>\n<p>Durante los \u00faltimos 7 a\u00f1os, hemos publicado 15 art\u00edculos, hemos obtenido una patente relacionada con la utilidad diagn\u00f3stica de un gen de resistencia, y hemos realizado diversas comunicaciones a congresos nacionales e internacionales.<\/p>\n<p>Nuestra investigaci\u00f3n tambi\u00e9n est\u00e1 incorporando nuevas perspectivas, como lo es la utilizaci\u00f3n de nanopart\u00edculas para administrar antimicrobianos, o las combinaciones de mol\u00e9culas con actividad antimicrobiana.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-980\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb.jpg\" alt=\"mtt_assayb\" width=\"812\" height=\"371\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb.jpg 2958w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-300x137.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-768x351.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-1024x468.jpg 1024w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-330x151.jpg 330w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-1920x877.jpg 1920w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-736x336.jpg 736w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-1280x585.jpg 1280w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/mtt_assayb-414x189.jpg 414w\" sizes=\"auto, (max-width: 812px) 100vw, 812px\" \/><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.- Discovery of antimicrobial compounds targeting bacterial type FAD synthetases. <\/strong>Sebasti\u00e1n M, Anoz-Carbonell E, Gracia B, Cossio P, A\u00ednsa JA, Lans I, Medina M. J Enzyme Inhib Med Chem. 2018 Dec;33(1):241-254. doi: 10.1080\/14756366.2017.1411910. PMID: 29258359<\/p>\n<p><strong>2.- The EU approved antimalarial pyronaridine shows antitubercular activity and synergy with rifampicin, targeting RNA polymerase. <\/strong>Mori G, Orena BS, Franch C, Mitchenall LA, Godbole AA, Rodrigues L, Aguilar-P\u00e9rez C, Zemanov\u00e1 J, Husz\u00e1r S, Forbak M, Lane TR, Sabbah M, Deboosere N, Frita R, Vandeputte A, Hoffmann E, Russo R, Connell N, Veilleux C, Jha RK, Kumar P, Freundlich JS, Brodin P, A\u00ednsa JA, Nagaraja V, Maxwell A, Miku\u0161ov\u00e1 K, Pasca MR, Ekins S. Tuberculosis (Edinb). 2018 Sep;112:98-109. doi: 10.1016\/j.tube.2018.08.004. PMID: 30205975<\/p>\n<p><strong>3.- Synergy between Circular Bacteriocin AS-48 and Ethambutol against Mycobacterium tuberculosis. <\/strong>Aguilar-P\u00e9rez C, Gracia B, Rodrigues L, Vitoria A, Cebri\u00e1n R, Deboos\u00e8re N, Song OR, Brodin P, Maqueda M, A\u00ednsa JA. Antimicrob Agents Chemother. 2018 Aug 27;62(9). pii: e00359-18. doi: 10.1128\/AAC.00359-18. PMID: 29987141<\/p>\n<p><strong>4.- Boldine-Derived Alkaloids Inhibit the Activity of DNA Topoisomerase I and Growth of Mycobacterium tuberculosis. <\/strong>Garc\u00eda MT, Carre\u00f1o D, Tirado-V\u00e9lez JM, Ferr\u00e1ndiz MJ, Rodrigues L, Gracia B, Amblar M, Ainsa JA, de la Campa AG. Front Microbiol. 2018 Jul 24;9:1659. doi: 10.3389\/fmicb.2018.01659. PMID: 30087665<\/p>\n<p><strong>5.- Total Synthesis of Ripostatin B and Structure-Activity Relationship Studies on Ripostatin Analogs. <\/strong>Glaus F, Dedi\u0107 D, Tare P, Nagaraja V, Rodrigues L, A\u00ednsa JA, Kunze J, Schneider G, Hartkoorn RC, Cole ST, Altmann KH. J Org Chem. 2018 Jul 6;83(13):7150-7172. doi: 10.1021\/acs.joc.8b00193. PMID: 29542926<\/p>\n<p><strong>6.- New active formulations against M. tuberculosis: Bedaquiline encapsulation in lipid nanoparticles and chitosan nanocapsules.<\/strong> L.De Matteis, D.Jary, A.Luc\u00eda, S.Garc\u00eda-Embid, I.Serrano-Sevilla, D.P\u00e9rez, J.A.Ainsa, F.P.Navarro, J.M. de la Fuente. Chemical Engineering Journal. Volume 340, 15 May 2018, Pages 181-191.<\/p>\n<p><strong>7.- Structure Guided Lead Generation toward Nonchiral M. tuberculosis Thymidylate Kinase Inhibitors. <\/strong>Song L, Merceron R, Gracia B, Quintana AL, Risseeuw MDP, Hulpia F, Cos P, A\u00ednsa JA, Munier-Lehmann H, Savvides SN, Van Calenbergh S. J Med Chem. 2018 Apr 12;61(7):2753-2775. doi: 10.1021\/acs.jmedchem.7b01570. PMID: 29510037<\/p>\n<p><strong>8.- Ionophore A23187 shows anti-tuberculosis activity and synergy with tebipenem. <\/strong>Huang W, Briffotaux J, Wang X, Liu L, Hao P, Cimino M, Buchieri MV, Namouchi A, Ainsa JA, Gicquel B. Tuberculosis (Edinb). 2017 Dec;107:111-118. doi: 10.1016\/j.tube.2017.09.001. PMID: 29050757<\/p>\n<p><strong>9.- How can nanoparticles contribute to antituberculosis therapy? <\/strong>Costa-Gouveia J, A\u00ednsa JA, Brodin P, Luc\u00eda A. Drug Discov Today. 2017 Mar;22(3):600-607. doi: 10.1016\/j.drudis.2017.01.011. PMID: 28137645<\/p>\n<p><strong>10.- Antituberculosis drugs: reducing efflux=increasing activity. <\/strong>Rodrigues L, Parish T, Balganesh M, Ainsa JA. Drug Discov Today. 2017 Mar;22(3):592-599. doi: 10.1016\/j.drudis.2017.01.002. PMID: 28089787<\/p>\n<p><strong>11.- Structure-Activity Relationships of Spectinamide Antituberculosis Agents: A Dissection of Ribosomal Inhibition and Native Efflux Avoidance Contributions.<\/strong> Liu J, Bruhn DF, Lee RB, Zheng Z, Janusic T, Scherbakov D, Scherman MS, Boshoff HI, Das S, Rakesh, Waidyarachchi SL, Brewer TA, Gracia B, Yang L, Bollinger J, Robertson GT, Meibohm B, Lenaerts AJ, Ainsa J, B\u00f6ttger EC, Lee RE. ACS Infect Dis. 2017 Jan 13;3(1):72-88. doi: 10.1021\/acsinfecdis.6b00158. PMID: 28081607<\/p>\n<p><strong>12.- Identification of Aminopyrimidine-Sulfonamides as Potent Modulators of Wag31-mediated Cell Elongation in Mycobacteria.<\/strong>\u00a0Vinayak Singh, Neeraj Dhar, Ja\u0301nos Pato\u0301, Gae\u0308lle S. Kolly, Jana Kordula\u0301kova\u0301, Martin Forbak, Joanna C. Evans, Rita Sze\u0301kely, Jan Rybniker, Zuzana Palc\u030cekova\u0301, Ju\u0301lia Zemanova\u0301, Isabella Santi, Franc\u0327ois Signorino-Gelo, Liliana Rodrigues, Anthony Vocat, Adrian S. Covarrubias, Monica G. Rengifo, Kai Johnsson, Sherry Mowbray, Joseph Buechler, Vincent Delorme, Priscille Brodin, Graham W. Knott, Jose\u0301 A. Ai\u0301nsa, Digby F. Warner, Gyo\u0308rgy Ke\u0301ri, Katari\u0301na Mikus\u030cova\u0301, John D. McKinney, Stewart T. Cole, Valerie Mizrahi, Ruben C. Hartkoorn. Mol Microbiol. 2017 Jan;103(1):13-25. doi: 10.1111\/mmi.13535. PMID: 27677649<\/p>\n<p><strong>13.- Lipid transport in Mycobacterium tuberculosis and its implications in virulence and drug development.<\/strong>\u00a0Bailo R, Bhatt A, A\u00ednsa JA. Biochem Pharmacol. 2015 Aug 1;96(3):159-67. doi: 10.1016\/j.bcp.2015.05.001. PMID: 25986884.<\/p>\n<p><strong>14.- Measuring efflux and permeability in mycobacteria.<\/strong>\u00a0Rodrigues L, Viveiros M, A\u00ednsa JA. Methods Mol Biol. 2015;1285:227-39. doi: 10.1007\/978-1-4939-2450-9_13. PMID: 25779319.<\/p>\n<p><strong>15.- Spectinamides: a new class of semisynthetic antituberculosis agents that overcome native drug efflux.<\/strong>\u00a0Lee RE, Hurdle JG, Liu J, Bruhn DF, Matt T, Scherman MS, Vaddady PK, Zheng Z, Qi J, Akbergenov R, Das S, Madhura DB, Rathi C, Trivedi A, Villellas C, Lee RB, Rakesh, Waidyarachchi SL, Sun D, McNeil MR, Ainsa JA, Boshoff HI, Gonzalez-Juarrero M, Meibohm B, B\u00f6ttger EC, Lenaerts AJ. Nat Med. 2014 Feb;20(2):152-8. doi: 10.1038\/nm.3458. PMID: 24464186.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.- El fenotipo silente de Mycobacterium tuberculosis: persistencia y latencia. <\/strong>Ministerio de Econom\u00eda y Competitividad. Universidad de Zaragoza. SAF2017-84839-C2-1-R. 01\/01\/2018 &#8211; 31\/12\/2020. IP\u00a0 Jos\u00e9 Antonio A\u00ednsa Claver.<\/p>\n<p><strong>2.- Identification of novel therapies for difficult to treat cystic fibrosis pulmonary infections caused by mycobacteria using an innovative technology: synergy screens of clinically approved drugs. <\/strong>Uni\u00f3n Europea. Universidad de Zaragoza. 01\/04\/2018 &#8211; 31\/03\/2019. IP: Santiago Ramon Garcia.<\/p>\n<p><strong>3.- NAREB \u2013 Nanotherapeutics for antibiotic resistant emerging bacterial pathogens.<\/strong>\u00a0Uni\u00f3n Europea. Universidad de Zaragoza. 01\/02\/2014 \u2013 31\/07\/2018. IP: Jos\u00e9 Antonio A\u00ednsa Claver.<\/p>\n<p><strong>4.- SAF-2013-48971-C2-2-R: Aplicaciones biom\u00e9dicas de AS-48: una prote\u00edna con amplio espectro de actividad antimicrobiana.<\/strong><strong>\u00a0<\/strong>MINECO \u2013 Ministerio de Economia y Competitividad. Universidad de Zaragoza. 01\/01\/2014 \u2013 31\/07\/2018. IP: Jos\u00e9 Antonio A\u00ednsa Claver.<\/p>\n<p><strong>5.- MM4TB \u2013 More medicines for tuberculosis.<\/strong>\u00a0Uni\u00f3n Europea. Universidad de Zaragoza. 01\/02\/2011 \u2013 31\/01\/2016. IP: Jos\u00e9 Antonio A\u00ednsa Claver.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>Adela G. De la Campa, Centro Nacional de Microbiolog\u00eda, Instituto de Salud Carlos III (Majadahonda, Madrid, Spain). Desarrollo de inhibidores frente a la topoisomerasa de\u00a0<em> tuberculosis<\/em>.<\/li>\n<li>Mercedes Maqueda, Universidad de Granada (Granada, Spain). Estudio de actividad antimicrobiana de la bacteriocina AS-48.<\/li>\n<li>Serge van Calenbergh, Universidad de Gent (Gent, Belgium). Nuevos inhibidores de timidilato kinasa de <em> tuberculosis<\/em>.<\/li>\n<li>Concepci\u00f3n Gonz\u00e1lez-Bello (Universidad de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain). Inhibidores de dehidroquinasas en <em> tuberculosis<\/em>.<\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/genmico.unizar.es\">http:\/\/genmico.unizar.es<\/a>[\/vc_column_text][mk_padding_divider size=\u00bb70&#8243;][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbApoptosis y metabolismo \u00bb tab_id=\u00bb1478115817701-6-4&#8243;][vc_column_text title=\u00bbApoptosis y metabolismo \u00bb css=\u00bb.vc_custom_1616507815550{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<div class=\"gmail_default\">Diego de la Fuente Herreruela\/CPIF<br \/>\nBeatriz S\u00e1enz de Buruaga\/Est. predoc<br \/>\nLaura Bueno Mart\u00ednez\/Est. TFG<br \/>\nSara Garc\u00eda Gadea\/Est. TFG<\/div>\n<div class=\"gmail_default\">Carlos Matute Lamana\/Est. TFM<\/div>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>Nuestro trabajo se ha centrado, durante los \u00faltimos a\u00f1os, en varios campos, que se indican a continuaci\u00f3n:<\/p>\n<p><strong>1.- Estudio de la funci\u00f3n de PSAP\/Mtch1<\/strong> (Presenilin 1-associated protein\/mitochondrial carrier homolog 1). PSAP interacciona con la presenilina 1, la cual forma parte del complejo gamma secretasa, implicado en la enfermedad de Alzheimer. PSAP tambi\u00e9n se conoce como mitochondrial carrier homolog 1 (Mtch1), porque contiene un dominio proteico conservado en transportadores de la membrana interna mitocondrial, aunque se localiza en la membrana externa. Mtch1 induce muerte celular cuando se sobreexpresa en c\u00e9lulas en cultivo.<\/p>\n<p>Hemos identificado dos isoformas proapopt\u00f3ticas generadas por splicing alternativo, que se dirigen a la membrana externa mitocondrial mediante varias se\u00f1ales de localizaci\u00f3n internas y que contienen dos dominios proapopt\u00f3ticos. Mtch1 puede inducir apoptosis en ausencia de Bax y Bak, miembros proapopt\u00f3ticos de la familia de Bcl-2. No parece que tenga una funci\u00f3n transportadora, pero podr\u00eda funcionar como un receptor de ligandos todav\u00eda desconocidos en la superficie de la mitocondria.<\/p>\n<p>Hemos analizado el knockout de Mtch1 en Drosophila y estamos preparando su publicaci\u00f3n, en colaboraci\u00f3n con investigadores del Instituto de Investigaciones Biom\u00e9dicas, CSIC-UAM, en Madrid.<\/p>\n<p><strong>2.-<\/strong> <strong>Prote\u00ednas Bcl-2.<\/strong> Las prote\u00ednas de la familia de Bcl-2 son esenciales en el inicio de la muerte celular, integrando varias se\u00f1ales celulares. Sus funciones principales conocidas dependen de interacciones prote\u00edna-prote\u00edna para la inducci\u00f3n o la inhibici\u00f3n de los pasos iniciales de la muerte celular. Sin embargo cada vez hay m\u00e1s evidencias de que pueden tener funciones alternativas relacionadas con la regulaci\u00f3n del metabolismo. En esta l\u00ednea, hemos descrito la implicaci\u00f3n del dominio transmembrana de Bcl-XL en la dimerizaci\u00f3n de esta prote\u00edna.<\/p>\n<p><strong>3.-<\/strong> <strong>PEPCK<\/strong>. Junto con el Dr. Pascual L\u00f3pez Buesa, hemos estudiado varios polimorfismos gen\u00e9ticos que afectan a la calidad de la carne de cerdo, habi\u00e9ndonos centrado en los \u00faltimos a\u00f1os en ambas isoformas de la fosfoenolpiruvato carboxikinasa, la citos\u00f3lica y la mitocondrial. Este trabajo ha evolucionado para estudiar la regulaci\u00f3n post-traduccional de esta enzima, esencial para la gluconeog\u00e9nesis e implicada en patolog\u00edas como la diabetes o el c\u00e1ncer. En un trabajo reciente, en colaboraci\u00f3n con el Dr. John Denu, del Wisconsin Institute for Discovery, de la Universidad de Wisconsin-Madison y con investigadores de Australia, La Rioja y Harvard, hemos descubierto nuevos mecanismos de regulaci\u00f3n posttraduccional de la PEPCK de mam\u00edferos. Este trabajo ha sido publicado recientemente en la revista Molecular Cell.<\/p>\n<p>Estamos concluyendo otra serie de experimentos en esta misma l\u00ednea.<\/p>\n<p><strong>4.-<\/strong> <strong>Enfermedad de Parkinson.<\/strong> Junto con la Dra. Nunilo Cremades. del BIFI, estamos comenzando un proyecto de investigaci\u00f3n sobre Parkinson que utiliza un abordaje multidisciplinar, biof\u00edsico (Dr. Cremades) y celular (Dr. Carrodeguas), para desarrollar nuevos modelos celulares y utilizar t\u00e9cnicas biof\u00edsicas de \u00faltima generaci\u00f3n con el fin de determinar los mecanismos iniciales que producen la agregaci\u00f3n de la prote\u00edna a-sinucle\u00edna en esta patolog\u00eda.<\/p>\n<p><strong>5.- C\u00e9lulas madre.<\/strong> Hemos trabajado tambi\u00e9n en diferenciaci\u00f3n y muerte de c\u00e9lulas madre y vamos a aplicar estos conocimientos en el desarrollo de modelos para Parkinson.<\/p>\n<p>Colaboramos tambi\u00e9n con otros investigadores del BIFI en distintas l\u00edneas de investigaci\u00f3n.<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<ol>\n<li>Latorre-Muro P, Baeza J, Armstrong, EA, Hurtado-Guerrero R, Corzana F, Wus LE, Sinclair DA, L\u00f3pez-Buesa P, Carrodeguas JA, Denu JM (2018).<strong> Dynamic acetylation of cytosolic phosphoenolpyruvate carboxykinase toggles enzyme activity between gluconeogenic and anaplerotic reactions.<\/strong> <em>Mol. Cell.<\/em> 71: 718-732. doi: 10.1016\/j.molcel.2018.07.031.<\/li>\n<li>Latorre P, Varona L, Burgos C, Carrodeguas JA, L\u00f3pez-Buesa P. (2017). <strong><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/28644880\">O-GlcNAcylation mediates the control of cytosolic phosphoenolpyruvate carboxykinase activity via Pgc1\u03b1.<\/a> <\/strong><em>PLoS One<\/em> 12: e0179988. doi: 10.1371\/journal.pone.0179988.<\/li>\n<li>Hidalgo J, Latorre P, Carrodeguas JA, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Sancho J, L\u00f3pez-Buesa P. (2016).<strong> <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/27391465\">Inhibition of Pig Phosphoenolpyruvate Carboxykinase Isoenzymes by 3-Mercaptopicolinic Acid and Novel Inhibitors.<\/a><\/strong> <em>PLoS One<\/em>. 11: e0159002. doi: 10.1371\/journal.pone.0159002.<\/li>\n<li>Esc\u00f3s M, Latorre P, Hidalgo J, Hurtado-Guerrero R, Carrodeguas JA, L\u00f3pez-Buesa P. (2016). <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/28955899\"><strong>Kinetic and functional properties of human mitochondrial phosphoenolpyruvate carboxykinase<\/strong>.<\/a> <em>Biochem Biophys Rep.<\/em> 7: 124-129. doi: 10.1016\/j.bbrep.2016.06.007. Co-corresponding author.<\/li>\n<li>Latorre P, Burgos C, Hidalgo J, Varona L, Carrodeguas JA, L\u00f3pez-Buesa P. (2016). <strong><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/26792594\">c.A2456C-substitution in Pck1 changes the enzyme kinetic and functional properties modifying fat distribution in pigs.<\/a><\/strong> <em>Sci Rep.<\/em> 6: 19617. doi: 10.1038\/srep19617. Co-corresponding author.<\/li>\n<li>Nelo-Baz\u00e1n MA, Latorre P, Bolado-Carrancio A, P\u00e9rez-Campo FM, Echenique-Robba P, Rodr\u00edguez-Rey JC, Carrodeguas JA. (2015). <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/26692143\"><strong>Early growth response 1 (EGR-1) is a transcriptional regulator of mitochondrial carrier homolog 1 (MTCH 1)\/presenilin 1-associated protein (PSAP).<\/strong><\/a> <em>Gene<\/em> 578:52-62. doi: 10.1016\/j.gene.2015.12.014.<\/li>\n<li>Echenique-Robba P, Nelo-Baz\u00e1n MA, Carrodeguas JA. (2013). <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/24205158\"><strong>Reducing the standard deviation in multiple-assay experiments where the variation matters but the absolute value does not.<\/strong><\/a> <em>PLoS One<\/em> 8: e78205. doi: 10.1371\/journal.pone.0078205.<\/li>\n<li>Ospina A, Lagunas-Mart\u00ednez A, Pardo J, Carrodeguas JA (2011). <strong>Protein oligomerization mediated by the transmembrane carboxyl terminal domain of Bcl-XL<\/strong>. <em>FEBS Lett.<\/em> 585: 2935-42. doi: 10.1016\/j.febslet.2011.08.012.<\/li>\n<li>Conesa C, Doss MX, Antzelevitch C, Sachinidis A, Sancho J, Carrodeguas JA (2012). <strong>Identification of specific pluripotent stem cell death\u2013inducing small molecules by chemical screening.<\/strong> <em>Stem. Cell Rev.<\/em> 2012 Mar;8(1):116-27. doi: 10.1007\/s12015-011-9248-4.<\/li>\n<li>Lamarca V, Marzo I, Sanz-Clemente A, Carrodeguas JA (2008). <strong>Exposure of any of two proapoptotic domains of presenilin 1-associated protein\/mitochondrial carrier homolog 1 on the surface of mitochondria is sufficient for induction of apoptosis in a Bax\/Bak-independent manner<\/strong>. <em>Eur. J. Cell. Biol.<\/em> 87: 325-34. doi: 10.1016\/j.ejcb.2008.02.004.<\/li>\n<\/ol>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p>1.-\u00a0<strong>Modulaci\u00f3n de las caracter\u00edsticas del m\u00fasculo esquel\u00e9tico por la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa.<\/strong> Facultad de Veterinaria \u2013 Universidad de Zaragoza. Pascual L\u00f3pez Buesa y Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. CICYT. 2016-1018.<\/p>\n<p>2.-<strong>\u00a0Modulaci\u00f3n de las caracter\u00edsticas del m\u00fasculo esquel\u00e9tico por la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa.<\/strong> Instituto Universitario De Investigaci\u00f3n De Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica De Sistemas Complejos \u2013 Universidad de Zaragoza.\u00a0Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. VIC. INV. \u2013 APOYO INV. 2016.<\/p>\n<p>3.-\u00a0<strong>PEPCK y sus efectos sobre el metabolismo, los caracteres productivos y la calidad de la carne y la canal del ganado porcino.<\/strong> Facultad De Veterinaria \u2013 Universidad de Zaragoza. Pascual Luis L\u00f3pez Buesa. VIC. INV. \u2013 APOYO INV. 2015.<\/p>\n<p>4.-\u00a0<strong>Identificaci\u00f3n de mol\u00e9culas bioactivas en c\u00e9lulas troncales mediante cribado funcional de quimiotecas: herramientas para terapias seguras.<\/strong> Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. Universidad de Zaragoza\/Ibercaja.\u00a02012-2013.<\/p>\n<p>5.-\u00a0<strong>Prote\u00ednas Mtch: regulaci\u00f3n transcripcional en humanos y efectos fenot\u00edpicos del mutante en Drosophila.<\/strong> Instituto Universitario De Investigaci\u00f3n De Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica De Sistemas Complejos. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. Universidad de Zaragoza. 2011.<\/p>\n<p>6.-\u00a0<strong>Gen\u00e9tica qu\u00edmica para la identificaci\u00f3n de compuestos bioactivos que promueven diferenciaci\u00f3n espec\u00edfica, proliferaci\u00f3n o apoptosis en c\u00e9lulas madre.<\/strong> Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos. Departamento de Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular y Celular. Facultad de Ciencias. Universidad de Zaragoza. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. Instituto Aragon\u00e9s de Ciencias de la Salud. 2011.<\/p>\n<p>7.-\u00a0<strong>Regulaci\u00f3n de la actividad de prote\u00ednas proapopt\u00f3ticas mitocondriales.<\/strong> Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos. Departamento de Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular y Celular. Facultad de Ciencias. Universidad de Zaragoza. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. 2010.<\/p>\n<p>8.-\u00a0<strong>Identificaci\u00f3n de compuestos qu\u00edmicos que inducen diferenciaci\u00f3n celular espec\u00edfica o muerte celular apopt\u00f3tica en c\u00e9lulas madre embrionarias de rat\u00f3n (continuaci\u00f3n)<\/strong>. Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos. Departamento de Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular y Celular. Facultad de Ciencias. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. Instituto Aragon\u00e9s de Ciencias de la Salud. 2009-2010.<\/p>\n<p>9.-\u00a0<strong>Identificaci\u00f3n de compuestos qu\u00edmicos que inducen diferenciaci\u00f3n celular espec\u00edfica o muerte celular apopt\u00f3tica en c\u00e9lulas madre embrionarias de rat\u00f3n (continuaci\u00f3n)<\/strong>. Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos. Departamento de Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular y Celular. Facultad de Ciencias. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. Instituto Aragon\u00e9s de Ciencias de la Salud. 2008-2010.<\/p>\n<p>10.-\u00a0<strong>Mecanismos moleculares de prote\u00ednas de la membrana externa mitocondrial similares a transportadores implicadas en apoptosis. Papel en enfermedades degenerativas y en c\u00e1nce<\/strong>r. Facultad de Veterinaria. Universidad de Zaragoza. Jos\u00e9 Alberto Carrodeguas Villar. MEC. 2006-2009.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>Miguel Fern\u00e1ndez Moreno and Juan Jos\u00e9 Arredondo. Instituto de Investigaciones Biom\u00e9dicas. CSIC-UAM. Madrid.<\/li>\n<li>Javier Sancho, Milagros Medina, Adri\u00e1n Vel\u00e1zquez Campoy, Ram\u00f3n Hurtado-Guerrero, Patricio Fern\u00e1ndez Silva, Raquel Moreno Loshuertos. Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos. Departamento de Bioqu\u00edmica y Biolog\u00eda Molecular y Celular. Facultad de Ciencias. Universidad de Zaragoza.<\/li>\n<li>Jos\u00e9 Carlos Rodr\u00edguez-Rey. Department of Molecular Biology, University of Cantabria, IDIVAL, Santander, Cantabria, Spain.<\/li>\n<li>Flor P\u00e9rez Campo. Department of Internal Medicine, Hospital U. Marqu\u00e9s de Valdecilla-IDIVAL University of Cantabria, 39008 Santander, Cantabria, Spain.<\/li>\n<li>John M. . Wisconsin Institute for Discovery, Morgridge Institute for Research, and the Department of 12 Biomolecular Chemistry, University of Wisconsin School of Medicine and Public Health, USA.<\/li>\n<li>Francisco Corzana. Departamento de Qu\u00edmica, Centro de Investigaci\u00f3n en S\u00edntesis Qu\u00edmica, Universidad de La Rioja.<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><\/h3>\n[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab tab_id=\u00bb1477995669247-3-3&#8243; title=\u00bbGen\u00f3mica computacional y Bio-medicina de sistemas\u00bb][vc_column_text title=\u00bbGen\u00f3mica computacional y Bio-medicina de sistemas\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1617290343681{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Joaqu\u00edn Sanz<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>PhD students:<br \/>\nMario Tovar<br \/>\nJorge C\u00e1rdenas<\/p>\n<p>Master students:<br \/>\nIgnacio Marchante<\/p>\n<p>Undergrad students:<br \/>\nSantiago Royo<br \/>\nPablo P\u00e9rez<br \/>\nPilar Cobos.<\/p>\n<p>Alumni<strong>:<\/strong><br \/>\nJessica Moreira Batista Da Silva<br \/>\nRegina Santesteban Azanza<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>RESUMEN<\/strong><\/p>\n<p>En nuestro grupo utilizamos modelos matem\u00e1ticos para describir enfermedades infecciosas a diferentes escalas de complejidad: desde c\u00e9lulas y genes hasta individuos y poblaciones. Nuestro principal objetivo es identificar los factores causales, tanto gen\u00e9ticos como ambientales, que configuran la variaci\u00f3n en las respuestas inmunitarias a pat\u00f3genos, as\u00ed como caracterizar los factores que definen el car\u00e1cter patol\u00f3gico o funcional de dichas respuestas y estudiar c\u00f3mo se relacionan con observaciones epidemiol\u00f3gicas.<\/p>\n<p>Para ello, nuestra principal materia prima son datos de secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica. Eso incluye datos de variaci\u00f3n gen\u00e9tica en grandes cohortes humanas, as\u00ed como transcriptomas y epigenomas de hospedadores y pat\u00f3genos, tanto en modelos humanos como animales, a menudo a resoluci\u00f3n de c\u00e9lula \u00fanica. En el aspecto epidemiol\u00f3gico, desarrollamos modelos de transmisi\u00f3n de enfermedades comunicables, para interpretar datos tales como registros de incidencia transnacionales, encuestas de prevalencia y resultados de ensayos cl\u00ednicos. Para lograr estos objetivos, nuestros m\u00e9todos integran herramientas de gen\u00f3mica computacional, biomedicina de sistemas, bioestad\u00edstica, ciencia de datos y redes, inferencia bayesiana, epidemiolog\u00eda matem\u00e1tica y f\u00edsica de sistemas complejos.<\/p>\n<p>En la actualidad, hay tres l\u00edneas principales de investigaci\u00f3n abiertas en el grupo. Estas incluyen la Biolog\u00eda de Sistemas de las interacciones hu\u00e9sped-pat\u00f3geno en tuberculosis; el desarrollo de herramientas bioinform\u00e1ticas para el an\u00e1lisis de datos -\u00f3micos a resoluci\u00f3n single-cell y el desarrollo de aplicaciones computacionales para el estudio de la gen\u00f3mica del sistema inmunol\u00f3gico.<\/p>\n<p><strong>Biologia de sistemas de tuberculosis<\/strong><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-6323 alignleft\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1-2-653x1024.png\" alt=\"\" width=\"478\" height=\"1001\" \/>La tuberculosis (TB) es una de las enfermedades infecciosas humanas m\u00e1s antiguas y, con un n\u00famero estimado de 1,4 millones de muertes en 2019, todav\u00eda hoy una de las m\u00e1s mort\u00edferas. Su agente causal, el bacilo <em>Mycobacterium tuberculosis<\/em>, es posiblemente el m\u00e1s exitoso entre todos los pat\u00f3genos humanos, considerando su sorprendente capacidad para coexistir con su hu\u00e9sped (se estima que alrededor del 24% de los humanos contempor\u00e1neos est\u00e1n infectados con <em>M.tb<\/em>.) sin comprometer su salud. Entre todas las posibles intervenciones epidemiol\u00f3gicas que se est\u00e1n considerando en la lucha contra la tuberculosis, la introducci\u00f3n de una nueva vacuna capaz de complementar o superar a la vacuna actual del Bacillus Calmette-Guerin (BCG), promete un mayor impacto contra la enfermedad.<\/p>\n<p>En nuestro grupo, combinamos enfoques de biolog\u00eda de sistemas, bioinform\u00e1tica y epidemiolog\u00eda matem\u00e1tica para modelar diferentes aspectos asociados a la infecci\u00f3n por M.tb. que operan a diferentes niveles de complejidad. Algunos ejemplos incluyen desde la caracterizaci\u00f3n gen\u00f3mica de la memoria inmune innata inducida por micobacterias hasta el modelado epidemiol\u00f3gico de la transmisi\u00f3n de la TB a nivel transnacional, para interpretar los resultados de ensayos cl\u00ednicos y evaluar el impacto de intervenciones epidemiol\u00f3gicas tales como la introducci\u00f3n de nuevas y mejores vacunas.<\/p>\n<p>Fig. 1: Biolog\u00eda de sistemas de la TB. La actividad reciente del grupo en este tema incluye la caracterizaci\u00f3n de redes reguladoras transcripcionales, a nivel de bacteria individual (un pat\u00f3geno); el estudio de la inmunidad entrenada innata en colaboraci\u00f3n con <a href=\"about:blank\">M. Divangahi<\/a> (McGill) y su equipo (un hu\u00e9sped); la caracterizaci\u00f3n de la arquitectura gen\u00e9tica de la respuesta de los macr\u00f3fagos humanos a <em>M.tb.<\/em> (una poblaci\u00f3n), y el desarrollo de modelos matem\u00e1ticos de transmisi\u00f3n de la TB, a escala supranacional (muchas poblaciones).<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Single-cell -omics: modelizaci\u00f3n y an\u00e1lisis de datos.<\/strong><\/p>\n<p>En 2009, Fuchou Tang y sus colaboradores fueron los primeros en utilizar RNA-seq a resoluci\u00f3n single-cell, de un blast\u00f3mero de rat\u00f3n. Desde entonces, el campo ha experimentado un progreso espectacular en t\u00e9cnicas de microfluidos, automatizaci\u00f3n de la preparaci\u00f3n de librer\u00edas y multiplexaci\u00f3n, hasta el punto que ahora es posible, y relativamente asequible, compilar datasets que contienen los transcriptomas de cientos de miles de c\u00e9lulas. Estas mejoras experimentales abren la posibilidad de abordar problemas biol\u00f3gicos m\u00e1s profundos mediante el uso de dise\u00f1os experimentales complejos.<\/p>\n<p>En el grupo combinamos ciencia de datos, modelado estad\u00edstico y m\u00e9todos de redes complejas para proponer pipelines mejorados para el an\u00e1lisis de datos transcript\u00f3micos a resoluci\u00f3n single-cell, prestando especial atenci\u00f3n al desarrollo de aplicaciones para la caracterizaci\u00f3n de respuestas a infecci\u00f3n, entrenamiento inmunol\u00f3gico, y vacunaci\u00f3n en c\u00e9lulas inmunes y sus precursores hematopoy\u00e9ticos.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Gen\u00f3mica computacional del sistema inmunitario<\/strong><\/p>\n<p>Las respuestas inmunitarias a las agresiones externas son complejas y variables entre individuos. La idoneidad de la respuesta inmune a una infecci\u00f3n a menudo depende de su intensidad, rapidez y especificidad; y todas estas son caracter\u00edsticas din\u00e1micas que <em>emergen<\/em> de una interacci\u00f3n compleja entre numerosos factores causales distintos. Estos factores provienen a su vez de la gen\u00e9tica del hu\u00e9sped y del pat\u00f3geno, as\u00ed como del contexto ambiental en el que se produce su contacto.<\/p>\n<p>En el laboratorio estudiamos los v\u00ednculos de causalidad que conectan los genotipos y las variables ambientales con las respuestas inmunitarias a la infecci\u00f3n. Nuestro principal objetivo es la identificaci\u00f3n de los componentes de tales respuestas que se ven m\u00e1s fuertemente afectados por dichos factores causales, as\u00ed como sus implicaciones evolutivas y cl\u00ednicas.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-large wp-image-6325\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2-1-1024x410.png\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"410\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2-1.png 1024w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2-1-300x120.png 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2-1-768x308.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/>Fig. 2. Gen\u00f3mica computacional del Sistema inmunitario. Esquema gr\u00e1fico de los enfoques experimentales implementados en algunos de los \u00faltimos proyectos en los que hemos trabajado recientemente, en colaboraci\u00f3n con <a href=\"about:blank\">L. Barreiro<\/a>\u00a0(U. Chicago), <a href=\"about:blank\">J. Tung<\/a>\u00a0(Duke), y sus equipos<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Publicaciones relevantes<\/strong><\/p>\n<ol>\n<li><strong>Primate innate immune responses to bacterial and viral pathogens reveals an evolutionary trade-off between strength and specificity<\/strong>. Hawash, M., Sanz, J, Grenier, J. C., Kohn, J., Yotova, V., Johnson, Z., \u2026 &amp; Barreiro, L. B. (2020). <em>Proceedings of the National Academy of Sciences, 2021.<\/em><\/li>\n<li><strong>tuberculosis Reprograms Hematopoietic Stem Cells to Limit Myelopoiesis and Impair Trained Immunity<\/strong>. Khan<sup>1<\/sup>, Downey, Sanz, J., Kaufmann, Blankenhaus, Pacis, \u2026 &amp; Divangahi (2020). Cell, 183(3), 752-770.<\/li>\n<li><strong>Social history and exposure to pathogen signals modulate social status effects on gene regulation in rhesus macaques.<\/strong> Sanz, J., Maurizio, P. L., Snyder-Mackler, N., Simons, N. D., Voyles, T., Kohn, J., \u2026 &amp; Barreiro, L. B. (2020). <em>Proceedings of the National Academy of Sciences<\/em>,\u00a0<em>117<\/em>(38), 23317-23322.<\/li>\n<li><strong>Bridging the gap between efficacy trials and model-based impact evaluation for new tuberculosis vaccines.<\/strong> Tovar, M., Arregui, S., Marinova, D., Mart\u00edn, C., Sanz, J<strong>.<\/strong>, &amp; Moreno, Y. <em>Nature Communications<\/em>,\u00a0<em>10<\/em>(1), 1-10. (<sup>1\u00a0<\/sup>co-last author) (2019).<\/li>\n<li><strong>Natural selection contributed to immunological differences between hunter-gatherers and agriculturalists. <\/strong>Harrison, G.F., Sanz, J<strong>.<\/strong>, Boulais, J., Mina, M.J., Grenier, J.C., Leng, Y., Dumaine, A., Yotova, V., Bergey, C. M., Nsobya, S.L., Elledge, S.J., Schurr, E., Quintana-Murci, L., Perry, G.H., Barreiro, L.B.\u00a0<em>Nature Ecology and Evolution 1253-1264 3(8) (2019).<\/em><\/li>\n<li><strong>Spotting the old foe\u2014revisiting the case definition for TB.<\/strong> Houben, R.M., Esmail, H., Emery, J.C., Joslyn, L.R., McQuaid, C.F., Menzies, N.A., Sanz, J., Shrestha, S., White, R.G., Yang, C. and Cobelens, F., 2019. <em>The Lancet Respiratory Medicine<\/em>,\u00a0<em>7<\/em>(3), pp.199-201.<\/li>\n<li><strong>Social status alters chromatin accessibility and the gene regulatory response to glucocorticoid stimulation in rhesus macaques<\/strong>. Snyder-Mackler, N., Sanz, J., Kohn, J. N., Voyles, T., Pique-Regi, R., Wilson, M. E., \u2026 &amp; Tung, J. (2019). <em>Proceedings of the National Academy of Sciences<\/em>,\u00a0<em>116<\/em>(4), 1219-1228.<\/li>\n<li><strong>Genetic and evolutionary determinants of human population variation in immune responses. <\/strong>Sanz, J., Randolph, H. E., &amp; Barreiro, L. B. (2018).\u00a0<em>Current opinion in genetics &amp; development<\/em>,\u00a0<em>53<\/em>, 28-35.<\/li>\n<li><strong>Data-driven model for the assessment of Mycobacterium tuberculosis transmission in evolving demographic structures.<\/strong> Arregui, S., Iglesias, M. J., Samper, S., Marinova, D., Martin, C., Sanz, J<strong>.<\/strong><sup>\u00a0<\/sup>, &amp; Moreno, Y.<sup>\u00a01<\/sup>\u00a0. (<sup>1\u00a0<\/sup>co-last author). (2018). <em>Proceedings of the National Academy of Sciences<\/em>,\u00a0<em>115<\/em>(14), E3238-E3245.<\/li>\n<li><strong>BCG educates hematopoietic stem cells to generate protective innate immunity against tuberculosis.<\/strong>\u00a0Kaufmann, E.<sup>\u00a01<\/sup>, Sanz, J<strong>.<\/strong><sup>\u00a01<\/sup>, Dunn, J. L.<sup>\u00a01<\/sup>, Khan, N., Mendon\u00e7a, L. E., Pacis, A., \u2026 &amp; Mailhot-L\u00e9onard, F. (<sup>1\u00a0<\/sup>co-first author). (2018). <em>Cell<\/em>,\u00a0<em>172<\/em>(1-2), 176-190.<\/li>\n<li><strong>Social status alters immune regulation and response to infection in macaques.<\/strong> N. Snyder-Mackler<sup>1<\/sup>, J. Sanz<sup>1<\/sup>, J.N. Kohn, J.F. Brinkworth, S. Morrow, A.O. Shaver, J.C. Grenier, R. Pique-Regi, Z.P. Johnson, M.E. Wilson, L.B. Barreiro<sup>2<\/sup>\u00a0&amp; J. Tung<sup>2<\/sup>\u00a0(<sup>1\u00a0<\/sup>co-first author;\u00a0<sup>2\u00a0<\/sup>co-last author); Science, 354 (6315), 1041-1045.<\/li>\n<li><strong>Genetic ancestry and natural selection drive population differences in immune responses to pathogens. <\/strong>Y. N\u00e9d\u00e9l\u00e9c<sup>1<\/sup>, J. Sanz<sup>1<\/sup>, G. Baharian<sup>1<\/sup>, Z.A. Szpiech, A. Pacis, A. Dumaine, J.C. Grenier, A. Freiman, J. Sams, S. Hebert, A. Pag\u00e9-Sabourin, F. Luca, R. Blekhman, R.D. Hern\u00e1ndez, R. Piqu\u00e9-Regi, J. Tung, V. Yotova &amp; L.B.B. Barreiro, (<sup>1\u00a0<\/sup>co-first author). <em>Cell<\/em>\u00a0167-3, p657\u2013669.e21 (2016) (The paper was selected for the Issue cover).<\/li>\n<\/ol>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Principales proyectos<\/strong><\/p>\n<ol>\n<li>PID2019-106859GA-I00: <strong>Enfoques sist\u00e9micos a los mecanismos de defensa del hospedador ante enfermedad e infecci\u00f3n en M. tuberculosis: causas gen\u00e9ticas y evaluaci\u00f3n de impacto en nuevas vacunas<\/strong>, 2020-2023 Spanish Ministry of Science and Innovation (MICINN), Principal Investigator: Joaqu\u00edn Sanz.<\/li>\n<li><strong>Bio-computational approaches applied to the development of TB vaccines: epidemiological modeling, efficacy simulations and immunogenetics analyses<\/strong>. Government of Aragon, Spain. Grant LMP117-18. 2019-2020. PI: Yamir Moreno.<\/li>\n<li><strong>Multi-scale approaches to Tuberculosis infection: mathematical epidemiology and functional genomics<\/strong>. National Programme for Recruitment and Incorporation of Human Resources 2018, subprogramme \u201cRam\u00f3n y Cajal\u201d. RYC-2017-23560. 2019-2024. Principal Investigator: Joaqu\u00edn Sanz.<\/li>\n<li><strong>Stress and the Genome: Testing the Impact of Social Effects on Gene Regulation<\/strong>. National Institute of Health NIH (USA) Project # 1R01GM102562-01. (2012-2022). Principal Investigator: Dr. Jenny Tung. (Duke University)<\/li>\n<\/ol>\n<p><strong>\u00a0<\/strong><\/p>\n<p><strong>Colaboradores<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>Maziar Divangahi, McGill University, Canada.<\/li>\n<li>Eva Kaufmann, McGill University, Canada.<\/li>\n<li>Luis Barreiro, University of Chicago, USA.<\/li>\n<li>Genelle Harrison, University of Colorado, USA.<\/li>\n<li>Jenny Tung, Duke University, Durham, USA.<\/li>\n<li>Bana Jabri, University of Chicago, USA.<\/li>\n<li>Valentina Discepolo, Universit\u00e1 Federico II, Naples, Italy.<\/li>\n<li>Carlos Mart\u00edn, unizar.<\/li>\n<li>Nacho Aguil\u00f3, unizar.<\/li>\n<li>Jes\u00fas Gonzalo-Asensio, unizar.<\/li>\n<li>Yamir Moreno, unizar.<\/li>\n<li>Pierpaolo Bruscolini, unizar.<\/li>\n<li>Mario Flor\u00eda, unizar.<\/li>\n<li>Jes\u00fas G\u00f3mez-Garde\u00f1es, unizar.<\/li>\n<li>Sandro Meloni, IFISC, Palma de Mallorca.<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Contacto<\/strong><\/p>\n<p>Jsanz@bifi.es<br \/>\n<a href=\"https:\/\/sanzlab.wordpress.com\/\">https:\/\/sanzlab.wordpress.com\/<\/a>[\/vc_column_text][\/vc_tab][\/vc_tabs][vc_column_text css=\u00bb.vc_custom_1616594800381{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb][\/vc_column_text][mk_padding_divider][\/vc_column][\/vc_row]\n<\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>[mk_page_section bg_image=\u00bbhttps:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/research_investigacion_bifi-bn-2.jpg\u00bb bg_position=\u00bbcenter top\u00bb bg_repeat=\u00bbno-repeat\u00bb bg_stretch=\u00bbtrue\u00bb enable_3d=\u00bbtrue\u00bb video_opacity=\u00bb0.7&#8243; min_height=\u00bb400&#8243; js_vertical_centered=\u00bbtrue\u00bb padding_top=\u00bb0&#8243; top_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb bottom_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb sidebar=\u00bbsidebar-1&#8243;][vc_column][mk_fancy_title tag_name=\u00bbh1&#8243; color=\u00bb#ffffff\u00bb size=\u00bb60&#8243; force_font_size=\u00bbtrue\u00bb size_tablet=\u00bb40&#8243; size_phone=\u00bb28&#8243; font_weight=\u00bb300&#8243; txt_transform=\u00bbuppercase\u00bb letter_spacing=\u00bb2&#8243; font_family=\u00bbLato\u00bb font_type=\u00bbgoogle\u00bb align=\u00bbcenter\u00bb]Bioqu\u00edmica y BMC.[\/mk_fancy_title][\/vc_column][\/mk_page_section][vc_row fullwidth=\u00bbtrue\u00bb][vc_column][mk_divider style=\u00bbthin_solid\u00bb [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":8,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-2215","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2215","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2215"}],"version-history":[{"count":57,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2215\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10216,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2215\/revisions\/10216"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2215"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}