{"id":2216,"date":"2016-11-03T09:08:54","date_gmt":"2016-11-03T08:08:54","guid":{"rendered":"http:\/\/new.bifi.es\/es\/biophysics\/"},"modified":"2025-10-23T12:43:47","modified_gmt":"2025-10-23T10:43:47","slug":"biofisica","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bifi.es\/es\/biofisica\/","title":{"rendered":"Biof\u00edsica"},"content":{"rendered":"<div class=\"wpb-content-wrapper\">[mk_page_section bg_image=\u00bbhttps:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/research_investigacion_bifi-bn-2.jpg\u00bb bg_position=\u00bbcenter top\u00bb bg_repeat=\u00bbno-repeat\u00bb bg_stretch=\u00bbtrue\u00bb enable_3d=\u00bbtrue\u00bb video_opacity=\u00bb0.7&#8243; min_height=\u00bb400&#8243; js_vertical_centered=\u00bbtrue\u00bb padding_top=\u00bb0&#8243; top_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb bottom_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb sidebar=\u00bbsidebar-1&#8243;][vc_column][mk_fancy_title tag_name=\u00bbh1&#8243; color=\u00bb#ffffff\u00bb size=\u00bb60&#8243; force_font_size=\u00bbtrue\u00bb size_tablet=\u00bb40&#8243; size_phone=\u00bb28&#8243; font_weight=\u00bb300&#8243; txt_transform=\u00bbuppercase\u00bb letter_spacing=\u00bb2&#8243; font_family=\u00bbLato\u00bb font_type=\u00bbgoogle\u00bb align=\u00bbcenter\u00bb]Biof\u00edsica<span style=\"color: #ef5142;\">.<\/span>[\/mk_fancy_title][\/vc_column][\/mk_page_section][vc_row fullwidth=\u00bbtrue\u00bb][vc_column][mk_divider style=\u00bbthin_solid\u00bb thin_color_style=\u00bbgradient_color\u00bb thin_grandient_color_from=\u00bb#da391a\u00bb thin_grandient_color_to=\u00bb#fcd404&#8243; thin_gradient_color_angle=\u00bbhorizontal\u00bb thin_grandient_color_fallback=\u00bb#da391a\u00bb thickness=\u00bb10&#8243; margin_top=\u00bb0&#8243; margin_bottom=\u00bb160&#8243;][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css=\u00bb.vc_custom_1477994415462{padding-bottom: 100px !important;}\u00bb][vc_column width=\u00bb1\/3&#8243;][vc_single_image image=\u00bb1473&#8243; img_size=\u00bbfull\u00bb][\/vc_column][vc_column width=\u00bb1\/3&#8243;][vc_column_text]<span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Los investigadores en el <strong>\u00e1rea de Biof\u00edsica en el BIFI<\/strong> usan t\u00e9cnicas experimentales y computacionales en un ambiente interdisciplinario para comprender el comportamiento de los sistemas biol\u00f3gicos. El estudio en esta \u00e1rea abarca desde mol\u00e9culas (prote\u00ednas, \u00e1cidos nucleicos, mol\u00e9culas peque\u00f1as, etc.) a los organismos y ecosistemas enteros, desde un punto de vista cuantitativo. Las prote\u00ednas y los organismos con relevancia biotecnol\u00f3gica y\/o biom\u00e9dica son de especial inter\u00e9s. La investigaci\u00f3n en esta \u00e1rea tiene muchas aplicaciones en diferentes campos:<\/span><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\"><strong>Biotecnolog\u00eda<\/strong> (estabilizaci\u00f3n de prote\u00ednas y el modelado de las mismas, dise\u00f1o de la funci\u00f3n de prote\u00ednas, m\u00e1quinas moleculares, nanoestructuras, modelado molecular, transporte electr\u00f3nico, cat\u00e1lisis, la interacci\u00f3n electromagn\u00e9tica con la materia y la involucraci\u00f3n de glicosilaci\u00f3n de prote\u00ednas en se\u00f1alizaci\u00f3n)<\/span><\/span>[\/vc_column_text][\/vc_column][vc_column width=\u00bb1\/3&#8243;][vc_column_text css=\u00bb.vc_custom_1666781218578{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<span style=\"font-family: Arial, serif;\"><strong>Biomedicina<\/strong> (el dise\u00f1o y descubrimiento de f\u00e1rmacos, la identificaci\u00f3n y validaci\u00f3n de dianas farmacol\u00f3gicsa, y la interacci\u00f3n prote\u00edna-ADN)<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><strong>Biolog\u00eda<\/strong> (epidemiolog\u00eda, evoluci\u00f3n y las redes complejas)<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">El \u00e1rea de Biof\u00edsica en BIFI abarca 9 l\u00edneas de investigaci\u00f3n:<\/span><\/span><\/p>\n<ul>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Plegamiento de prote\u00ednas y dise\u00f1o molecular<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Interacciones biomoleculares<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">La glicosilaci\u00f3n de prote\u00ednas y su papel en enfermedad<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Flavoenzimas: mecanismos de acci\u00f3n y biotecnolog\u00eda<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Malplegamiento y agregaci\u00f3n amiloide de prote\u00ednas<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Diagn\u00f3stico cl\u00ednico y drug delivery<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Transducci\u00f3n de se\u00f1ales y terapias en prote\u00ednas de membrana<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Biolog\u00eda estructural de receptores de membrana neuronales<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<li><strong><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span lang=\"en-GB\">Modulaci\u00f3n enzim\u00e1tica y mecanismos de reacci\u00f3n<\/span><\/span><\/strong><\/li>\n<\/ul>\n[\/vc_column_text][\/vc_column][\/vc_row][vc_row fullwidth=\u00bbtrue\u00bb][vc_column][mk_divider style=\u00bbthin_solid\u00bb thin_color_style=\u00bbgradient_color\u00bb thin_grandient_color_from=\u00bb#da391a\u00bb thin_grandient_color_to=\u00bb#fcd404&#8243; thin_gradient_color_angle=\u00bbhorizontal\u00bb thin_grandient_color_fallback=\u00bb#da391a\u00bb thickness=\u00bb10&#8243; margin_top=\u00bb0&#8243; margin_bottom=\u00bb160&#8243;][\/vc_column][\/vc_row][vc_row][vc_column][vc_tabs orientation=\u00bbvertical\u00bb responsive=\u00bbfalse\u00bb container_bg_color=\u00bb#ffffff\u00bb][vc_tab title=\u00bbPlegamiento de prote\u00ednas y dise\u00f1o molecular\u00bb tab_id=\u00bb1477994206-2-50&#8243;][vc_column_text title=\u00bbPlegamiento de Prote\u00ednas y Dise\u00f1o Molecular\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1698671472785{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Javier Sancho<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Juan Jos\u00e9 Galano Frutos<br \/>\nDr. Helena Garc\u00eda Cebollada<br \/>\nRitwik Maity<br \/>\nPatricia Bru\u00f1en Fau<br \/>\nDr. Ver\u00f3nica Iguarbe Montalb\u00e1n<br \/>\nDar\u00edo Bazco Marco<br \/>\nAntonio Hidalgo Toledo<br \/>\nAlfonso L\u00f3pez<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p><strong>ESTABILIZACI\u00d3N, INGENIER\u00cdA Y SIMULACI\u00d3N DE PROTE\u00cdNAS<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-medium wp-image-7595 alignleft\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1-linea-jss-226x300.jpg\" alt=\"\" width=\"226\" height=\"300\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1-linea-jss-226x300.jpg 226w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1-linea-jss-768x1021.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1-linea-jss-770x1024.jpg 770w\" sizes=\"auto, (max-width: 226px) 100vw, 226px\" \/>Buscamos una comprensi\u00f3n cuantitativa de la termodin\u00e1mica de las prote\u00ednas que nos permita gobernar la composici\u00f3n de los conjuntos proteicos.\u00a0 Mediante diversas t\u00e9cnicas biof\u00edsicas, determinamos las magnitudes termodin\u00e1micas esenciales del equilibrio de plegamiento de prote\u00ednas (\u0394G, \u0394H, \u0394S y \u0394Cp) en prote\u00ednas silvestres y en variantes obtenidas mediante t\u00e9cnicas de ingenier\u00eda de prote\u00ednas.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Analizamos simulaciones de Din\u00e1mica Molecular para aumentar nuestra comprensi\u00f3n de los principios b\u00e1sicos. Intentamos comprender la contribuci\u00f3n de las interacciones fundamentales (por ejemplo, diferentes tipos de interacciones electrost\u00e1ticas), pero tambi\u00e9n de las entidades qu\u00edmicas (cadenas laterales de residuos de amino\u00e1cidos) a la estabilidad de las prote\u00ednas. Aspiramos a proporcionar herramientas conceptuales y computacionales que hagan posible un dise\u00f1o verdaderamente cuantitativo de la estabilidad de las prote\u00ednas.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>HTS, ANTIMICROBIANOS, CHAPERONAS FARMACOL\u00d3GICAS, QU\u00cdMICA M\u00c9DICA<\/strong><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-medium wp-image-7601 alignright\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2-linea-jss-1-300x203.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"203\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2-linea-jss-1-300x203.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2-linea-jss-1-768x519.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2-linea-jss-1.jpg 864w\" sizes=\"auto, (max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/>Utilizamos nuestros conocimientos para desarrollar f\u00e1rmacos dirigidos a prote\u00ednas, ya sean humanas o de otro tipo. Podemos partir de una diana prote\u00ednica definida, identificar los \u00abhits\u00bb y convertirlos en \u00ableads\u00bb utilizando un enfoque completo de qu\u00edmica m\u00e9dica.<\/p>\n<p>Nuestros proyectos m\u00e1s avanzados est\u00e1n relacionados con nuevos antimicrobianos espec\u00edficos contra\u00a0 <em>Helicobacter pylor<\/em>i, chaperonas\u00a0farmacol\u00f3gicas personalizadas para la fenilcetonuria y nuevos inhibidores de la agregaci\u00f3n para la enfermedad de Parkinson.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>BIOINFORM\u00c1TICA, PREDICTORES, SIMULACIONES MD, VARIOMA HUMANO<\/strong><\/p>\n<p>Estamos desarrollando t\u00e9cnicas para aumentar la precisi\u00f3n de la interpretaci\u00f3n fenot\u00edpica de las variantes gen\u00e9ticas de un solo nucle\u00f3tido. Intentamos potenciar el uso de t\u00e9cnicas de MD para clasificar con precisi\u00f3n las variantes gen\u00e9ticas en benignas y delet\u00e9reas.\u00a0 Nos centramos en las variantes sin sentido que afectan a regiones que codifican prote\u00ednas con una funci\u00f3n bien definida.<\/p>\n<p>Entre otros, trabajamos en la interpretaci\u00f3n de variantes en genes relacionados con enfermedades detectadas en el reci\u00e9n nacido.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-7599 size-large\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-linea-jss-1024x535.jpg\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"535\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-linea-jss-1024x535.jpg 1024w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-linea-jss-300x157.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-linea-jss-768x401.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-linea-jss.jpg 1299w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.-<\/strong>Galano-Frutos, Juan Jos\u00e9; Ner\u00edn-Fonz, Francho; Sancho, Javier. 2023. <strong>Calculation of Protein Folding Thermodynamics usin<\/strong>g Molecular Dynamics Simulations. J. Chem. Inf. Model. In Press<\/p>\n<p><strong>2.<\/strong> Galano-Frutos, Juan Jos\u00e9, Torreblanca Renzo, Garc\u00eda-Cebollada Helena, Sancho Javier. 2022. <strong>A look at the face of the molten globule: structural model of the Helicobacter pylori apoflavodoxin ensemble at acidic pH<\/strong>. Protein Science 2022,31:e4445<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong> Galano-Frutos, Juan Jos\u00e9; Garc\u00eda-Cebollada, Helena; Sancho, Javier. 2021. <strong>Molecular Dynamics Simulations for Genetic Interpretation in Protein Coding Regions: Where we Are, Where to Go and When<\/strong>. Briefings in bioinformatics. 22:3\u2013192.<\/p>\n<p><strong>4.<\/strong> Pujols, J.; et al. (18\/14) 2018. <strong>Small molecule inhibits alpha-synuclein aggregation, disrupts amyloid fibrils, and prevents degeneration of dopaminergic neurons. <\/strong>Proceedings of the national academy of sciences. 115-41, pp.10481-10486. ISSN 0027-8424.<\/p>\n<p><strong>5.<\/strong> Espinosa Angarica, Vladimir; Orozco, Modesto; Sancho, Javier. 2016. <strong>Exploring the complete mutational space of the LDL receptor LA5 domain using molecular dynamics: Linking snps with disease phenotypes in familial hypercholesterolemia.<\/strong> Human molecular genetics. 25-6, pp.1233-1246. ISSN 0964-6906.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.MOlecular-Scale Biophysics Research Infrastructure\u00a0 MOSBRI.<\/strong> UE (H2020-INFRAIA-2020-1). 2021-2025. IP: Javier Sancho (Coordinator: Patrick England, Institute Pasteur, France)<\/p>\n<p><strong>2. Estabilizador autom\u00e1tico de prote\u00ednas para biotecnolog\u00eda y biomedicina<\/strong>. Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. 2021-2024. IP: Javier Sancho<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong> <strong>La estabilidad de prote\u00ednas: an\u00e1lisis en profundidad, nuevas herramientas de predicci\u00f3n y aplicaciones en biomedicina y biotecnolog\u00eda<\/strong>. PID2022-141068NB-I00. Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n. 2023-2026. IP: Javier Sancho<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<p>Mantenemos colaboraciones activas con muchos grupos nacionales e internacionales y redes: \u00a0<a href=\"https:\/\/www.inpec.science\/\">INPEC<\/a>. Ver publicaciones.\u00a0Ver, as\u00ed mismo, las webs de proyectos:\u00a0<a href=\"https:\/\/redmut.wordpress.com\/\">RedMut<\/a>, <a href=\"https:\/\/pirepred.com\/\">Pirepred<\/a><\/p>\n<p><strong>CONTACTO<\/strong><\/p>\n<p><a href=\"mailto:jasncho@unizar.es\">jasncho@unizar.es<\/a><br \/>\n<a href=\"https:\/\/javiersancholab.bifi.es\/\">https:\/\/javiersancholab.bifi.es\/<\/a>[\/vc_column_text][mk_padding_divider size=\u00bb70&#8243;][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbInteracciones biomoleculares\u00bb tab_id=\u00bb1477994206-1-76&#8243;][vc_column_text title=\u00bbInteracciones Biomoleculares\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1697620048874{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Adrian Velazquez-Campoy<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Jos\u00e9 Luis Neira (Universidad Miguel Hern\u00e1ndez, Elche)<br \/>\nBruno Rizzuti (Institute of Nanotechnology, CNR, Italia)<br \/>\nDavid Ortega Alarc\u00f3n<br \/>\nAna Jim\u00e9nez Alesanco<br \/>\nPaula Garc\u00eda Franco<br \/>\nAna Jim\u00e9nez Alesanco<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>Todos los procesos biol\u00f3gicos se pueden describir como una secuencia de procesos de interacci\u00f3n entre biomol\u00e9culas y cambios conformacionales acoplados. Nosotros trabajamos en tres cuestiones fundamentales, desde una perspectiva tanto b\u00e1sica como aplicada, relacionadas con interacciones en mol\u00e9culas biol\u00f3gicas:<\/p>\n<ul>\n<li>Caracterizaci\u00f3n biof\u00edsica de prote\u00ednas de relevancia biotecnol\u00f3gica y\/o biom\u00e9dica: paisaje conformacional y funcional, interacciones con otras biomol\u00e9culas, cambios conformacionales, diagramas de fase, fen\u00f3menos cooperativos\u2026<\/li>\n<li>Desarrollo de metodolog\u00edas experimentales para el estudio de interacciones biomoleculares, fen\u00f3menos cooperativos y regulaci\u00f3n funcional en sistemas biol\u00f3gicos.<\/li>\n<li>Desarrollo e implementaci\u00f3n de procedimientos de cribado de alto rendimiento para la identificaci\u00f3n de compuestos bioactivos capaces de modular la funci\u00f3n de dianas proteicas farmacol\u00f3gicas.<\/li>\n<\/ul>\n<p><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-linea-adrian-4-e1697619678568.jpg\" \/><\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1<\/strong>.\u00a0N. Losada-Garcia, A. Vazquez-Calvo, D. Ortega-Alarcon, O. Abian, A. Velazquez-Campoy, P. Domingo-Calap, A. Alcami, J.M. Palomo. <strong>Nanostructured biohybrid material with wide-ranging antiviral action. <\/strong>Nano Research 2023, 16:11455-11463<\/p>\n<p><strong>2<\/strong>.- S. Araujo-Abad, B. Rizzuti, A. Villamarin-Ortiz, D. Pantoja-Uceda, C.M. Moreno-Gonzalez, O. Abian, A. Velazquez-Campoy, J.L. Neira, C. de Juan Romero. <strong>New insights into cancer: MDM2 binds to the citrullinating enzyme PADI4.<\/strong> Protein Science 2023, 32:e4723<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong>&#8211; S. Araujo-Abad, M. Fuentes-Baile, B. Rizzuti, J.F. Bazan, A. Villamarin-Ortiz, M. Saceda, E. Fernandez, M. Vidal, O. Abian, A. Velazquez-Campoy, C. de Juan Romero, J.L. Neira. <strong>The intrinsically disordered, epigenetic factor RYBP binds to the citrullinating enzyme PADI4 in cancer cells.<\/strong> International Journal of Biological Macromolecules 2023, 246:125632<\/p>\n<p><strong>4.<\/strong>&#8211; M. Bastos, O. Abian, C.M. Johnson, F. Ferreira-da-Silva, S. Vega, A. Jimenez-Alesanco, D. Ortega-Alarcon, A. Velazquez-Campoy. <strong>Isothermal titration calorimetry.<\/strong> Nature Reviews Methods Primers 2023, 3:17<\/p>\n<p><strong>5.<\/strong>&#8211; D. Ortega-Alarcon, R. Claveria-Gimeno, S. Vega, O.C. Jorge-Torres, M. Esteller, O. Abian, A. Velazquez-Campoy. <strong>Unexpected thermodynamic signature for the interaction of hydroxymethylated DNA with MeCP2.<\/strong> International Journal of Biological Macromolecules 2023, 232:123373<\/p>\n<p><strong>6.<\/strong>&#8211; K. Gonzalez-Arzola, A. Diaz-Quintana, N. Bernardo-Garcia, J. Martinez-Fabregas, F. Rivero-Rodriguez, M.A. Casado-Combreras, C. Elena-Real, A. Velazquez-Cruz, S. Gil-Caballero, A. Velazquez-Campoy, E. Szulc, M.P. Gavilan, I. Ayala, R. Arranz, R.M. Rios, X. Salvatella, J.M. Valpuesta, J. Hermoso, M.A. De la Rosa, I. Diaz-Moreno. <strong>Nucleus-translocated mitochondrial cytochrome c liberates nucleophosmin-sequestered ARF tumor suppressor by changing nucleolar liquid-liquid phase separation.<\/strong> Nature Structural &amp; Molecular Biology 2022, 29:1024-1036<\/p>\n<p><strong>7.<\/strong>&#8211; A. Jimenez-Alesanco, U. Eckhard, M. Asencio del Rio, S. Vega, T. Guevara, A. Velazquez-Campoy, F.X. Gomis-R\u00fcth, O. Abian. <strong>Repositioning small molecule drugs as allosteric inhibitors of the BFT-3 toxin from enterotoxigenic Bacteroides fragilis.<\/strong> Protein Science 2022, 31:e4427<\/p>\n<p><strong>8.<\/strong>&#8211; D. Ortega-Alarcon, R. Claveria-Gimeno, S. Vega, O.C. Jorge-Torres, M. Esteller, O. Abian, A. Velazquez-Campoy. <strong>Stabilization effect of intrinsically disordered regions on multidomain proteins: The case of the methyl-CpG protein 2, MeCP2.<\/strong> Biomolecules 2021, 11:1216<\/p>\n<p><strong>9.<\/strong>&#8211; D. Ortega-Alarcon, R. Claveria-Gimeno, S. Vega, O.C. Jorge-Torres, M. Esteller, O. Abian, A. Velazquez-Campoy. <strong>Influence of the disordered domain structure of MeCP2 on its structural stability and dsDNA interaction.<\/strong> International Journal of Biological Macromolecules 2021, 175:58-66<\/p>\n<p><strong>10.<\/strong>&#8211; B. Rizzuti, L. Ceballos-Laita, D. Ortega-Alarcon, A. Jimenez-Alesanco, S. Vega, F. Grande, F. Conforti, O. Abian, A. Velazquez-Campoy. <strong>Sub-micromolar inhibition of SARS-CoV-2 3CLpro by natural compounds.<\/strong> Pharmaceuticals 2021, 14:892<\/p>\n<p><strong>11<\/strong>. O. Abian, D. Ortega-Alarcon, A. Jimenez-Alesanco, L. Ceballos-Laita, S. Vega, H.T. Reyburn, B. Rizzuti, A. Velazquez-Campoy. <strong>Structural stability of SARS-CoV-2 3CLpro and identification of quercetin as an inhibitor by experimental screening.<\/strong> International Journal of Biological Macromolecules 2020, 164:1693-1703<\/p>\n<p><strong>12.<\/strong>&#8211; J. Felix, K. Weinh\u00e4upl, C. Chipot, F. Dehez, A. Hessel, D.F. Gauto, C. Morlot, O. Abian, I. Gutsche, A. Velazquez-Campoy, P. Schanda, H. Fraga. <strong>Mechanism of the allosteric activation of the ClpP protease machinery by substrates and active-site inhibitors. <\/strong>Science Advances 2019, 5:eaaw3818<\/p>\n<p><strong>13.<\/strong>&#8211; P. SaNtofimia\u2010Casta\u00f1o, Y. Xia, W. Lan, Z. Zhou, C. Huang, L. Peng, P. Soubeyran, A. Velazquez\u2010Campoy, O. Abian, B. Rizzuti, J.L. Neira, J. Iovanna. <strong>Ligand\u2010based design of a potent inhibitor of NUPR1 exerting anticancer activity via necroptosis.<\/strong> Journal of Clinical Investigation 2019, 129:2500-2513<\/p>\n<p><strong>14.<\/strong>&#8211; J.L. Neira, J. Bintz, M. Arruebo, B. Rizzuti, T. Bonacci, S. Vega, A. Lanas, A. Velazquez-Campoy, J.L. Iovanna, O. Abian. <strong>Identification of a drug targeting an intrinsically disordered protein involved in pancreatic adenocarcinoma.<\/strong> Scientific Reports 2017 7:39732<\/p>\n<p><strong>15.<\/strong>&#8211; R. Claveria-Gimeno, P.M. Lanuza, I. Morales-Chueca, O.C. Jorge, S. Vega, O. Abian, M. Esteller, A. Velazquez-Campoy. <strong>The intervening domain from MeCP2 enhances the DNA affinity of the methyl binding domain and provides an independent DNA interaction site.<\/strong> Scientific Reports 2017 7:41635<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1<\/strong>.\u00a0<strong>New pharmacological strategy against zinc-dependent target proteins: Allosteric inhibitors of deacetylases HDAC8 and LpxC.\u00a0<\/strong>Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n (PID2021-127296OB-I00). Entidades participantes: Universidad de Zaragoza. 2022-2025. IP: Adri\u00e1n Vel\u00e1zquez Campoy (Universidad de Zaragoza \u2013 BIFI)<\/p>\n<p><strong>2.Nuevas estrategias contra el c\u00e1ncer: Inhibici\u00f3n de las interacciones moleculares de las prote\u00ednas deiminasas de arginina (InterPATh).\u00a0<\/strong>Generalitat Valenciana (CIAICO\/2021\/135). 2022-2024. Entidades participantes: Universidad Miguel Hern\u00e1ndez. IP: Meuri del Camino de Juan Romero \u2013 Jos\u00e9 L. Neira (Universidad Miguel Hern\u00e1ndez<\/p>\n<p><strong>3.MOlecular-Scale Biophysics Research Infrastructure (MOSBRI).\u00a0<\/strong>Horizon 2020 &#8211; Research and Innovation Framework Programme (H2020-INFRAIA-2020-1, 101004806, RIA). Entidades participantes: Institut Pasteur, Aarhus Universitet, Universite Libre de Bruxelles, Universita Degli Studi di Genova, Rijksuniversiteit Groningen, European Molecular Biology Laboratory, Linkopings Universitet, Kemijski Institut, Birkbeck College &#8211; University of London, Centre National de la Recherche Scientifique, Biotechnologicky Ustav AV CR, Universita degli Studi di Roma La Sapienza, Universidad de Zaragoza, Malvern Panalytical, Software 4 Science Developments. 2021-2025. IP: Patrick England (Main Proposer, Institut Pasteur), Adrian Velazquez Campoy (Proposer, Universidad de Zaragoza \u2013 BIFI)<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>Olga Abian (Instituto Aragones de Ciencias de la Salud and BIFI, Spain)<\/li>\n<li>Juan Ausio (University of Victoria, Canada)<\/li>\n<li>Rui Brito (Universidade de Coimbra, Portugal)<\/li>\n<li>Pierpaolo Bruscolini (Universidad de Zaragoza and BIFI, Spain)<\/li>\n<li>Jose A. Carrodeguas (Universidad de Zaragoza and BIFI, Spain)<\/li>\n<li>Irene Diaz-Moreno (Instituto de Bioquimica Vegetal y Fotosintesis &#8211; CSIC, Spain)<\/li>\n<li>Maria Fillat (Universidad de Zaragoza and BIFI, Spain)<\/li>\n<li>Marcos R. Fontes (S\u00e3o Paulo State University, Brazil)<\/li>\n<li>Ernesto Freire (The Johns Hopkins University, USA)<\/li>\n<li>Enrique Garcia-Hernandez (Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico)<\/li>\n<li>Ruben Martinez-Buey (Universidad de Salamanca, Spain)<\/li>\n<li>Milagros Medina (Universidad de Zaragoza and BIFI, Spain)<\/li>\n<li>Maria Jo\u00e3o Moreno (Universidade de Coimbra, Portugal)<\/li>\n<li>Arturo Muga (Universidad del Pais Vasco, Spain)<\/li>\n<li>Jose A. Navarro (Instituto de Bioquimica Vegetal y Fotosintesis &#8211; CSIC, Spain)<\/li>\n<li>Julian Pardo (Universidad de Zaragoza and IIS-Aragon, Spain)<\/li>\n<li>Santiago Ramon-Maiques (CNIO, Spain)<\/li>\n<li>David Reverter (Universidad Autonoma de Barcelona, Spain)<\/li>\n<li>Javier Sancho (Universidad de Zaragoza and BIFI, Spain)<\/li>\n<li>Jayaraman Sivaraman (National University of Singapore, Singapore)<\/li>\n<li>Maria A. Urbaneja (Universidad del Pais Vasco, Spain)<\/li>\n<li>Salvador Ventura (Universidad Autonoma de Barcelona, Spain)<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>CONTACTO<\/strong><\/p>\n<p>Adrian Velazquez-Campoy, adrianvc@unizar.es[\/vc_column_text][mk_padding_divider size=\u00bb70&#8243;][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbLa glicosilaci\u00f3n de prote\u00ednas y su papel en enfermedad\u00bb tab_id=\u00bb1477995689892-5-2&#8243;][vc_column_text title=\u00bbLa Glicosilaci\u00f3n de Prote\u00ednas y su Papel en Enfermedad\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1749111999566{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Ram\u00f3n Hurtado Guerrero<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>V\u00edctor Taleb<br \/>\nBilly Veloz<br \/>\nIrene Gin\u00e9s<br \/>\nMar\u00eda Bort<br \/>\nAlejandro P\u00e9rez<br \/>\nMattia Ghirardello<br \/>\nKhanh Nguy\u1ec5n<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>Nuestro grupo est\u00e1 interesado en el estudio de las glicosiltransferasas, glicosilhidrolasas y prote\u00ednas\/m\u00f3dulos de uni\u00f3n a carbohidratos implicados en enfermedades humanas. Para ello, utilizamos la cristalograf\u00eda de prote\u00ednas como la principal herramienta complementada con enzimolog\u00eda, estudios de inhibici\u00f3n, etc, con el fin de estudiar los mecanismos moleculares de las enzimas que est\u00e1n implicadas en la s\u00edntesis, modificaci\u00f3n y degradaci\u00f3n de los glicoconjugados, oligo y polisac\u00e1ridos (ver las publicaciones m\u00e1s relevantes del grupo a continuaci\u00f3n).<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\" align=\"JUSTIFY\">\u00a0Principalmente trabajamos actualmente en la <em>O<\/em>-glicosilaci\u00f3n de prote\u00ednas y en las glicosiltransferasas responsables de esta modificaci\u00f3n postraduccional.<\/p>\n<p>En particular, actualmente estamos trabajando en varias glicosiltransferasas como las Prote\u00ednas O-fucosiltransferasas 1 y 2 (POFUT1 y 2), FUT8 y la gran familia de GalNAc-Ts. Mientras que POFUT1 y 2 fucosilatan dominios plegados como los dominios EFG y TSR, respectivamente, GalNAc-Ts glicosilan principalmente regiones no estructuradas presentes en un gran n\u00famero de prote\u00ednas como las mucinas. FUT8 es responsable de la llamada fucosilaci\u00f3n del n\u00facleo (Figura 1).<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-5889\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/ramon_figure1.jpg\" alt=\"\" width=\"960\" height=\"720\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/ramon_figure1.jpg 960w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/ramon_figure1-300x225.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/ramon_figure1-768x576.jpg 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 960px) 100vw, 960px\" \/><\/p>\n<p style=\"text-align: center;\"><span style=\"font-family: Arial, serif;\"><span style=\"font-size: small;\">Figure 1. Scheme summarizing the structure of FUT8 complexed to GDP and a biantennary N-glycan..<\/span><\/span><\/p>\n<p>Adem\u00e1s estamos interesados \u200b\u200ben la elucidaci\u00f3n de las coordenadas de reacci\u00f3n y el mecanismo catal\u00edtico mediante el uso de an\u00e1logos de estado de transici\u00f3n o complejos de Michaelis. Finalmente estos estudios ser\u00e1n importantes para el dise\u00f1o de nuevos f\u00e1rmacos con futuras aplicaciones terap\u00e9uticas frente a diversas enfermedades.<\/p>\n<p>Por ultimo y aunque no relacionado con el campo de la glicobiolog\u00eda, tenemos una estrecha colaboraci\u00f3n con el Prof. Dr. Guadix y Conejo-Garc\u00eda, de la Universidad de Granada, en el desarrollo de nuevos inhibidores contra la colina quinasa a1 humana para el tratamiento del c\u00e1ncer.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1. Substrate-guided front-face reaction revealed by combined structural snapshots and metadynamics for the polypeptide GalNAc-T2<\/strong>. Lira-Navarrete E, Iglesias-Fern\u00e1ndez J, Zandberg WF, Compa\u00f1\u00f3n I, Kong Y, Corzana F, Pinto BM, Clausen H, Peregrina JM, Vocadlo DJ, Rovira C*, Hurtado-Guerrero R*. (2014) Angew Chem Int Ed Engl 53(31):8206-10.\u00a0<em>(89 citations\/9 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>\u00a0First trapped experimental Michaelis complex for a retaining glycosyltransferase probing the S<sub>N<\/sub>i mechanism<\/em><\/p>\n<p><strong>2. Dynamic interplay between catalytic and lectin domains of GalNAc-transferases modulates protein O-glycosylation<\/strong>. Lira-Navarrete E, de Las Rivas M, Compa\u00f1\u00f3n I, Pallar\u00e9s MC, Kong Y, Iglesias-Fern\u00e1ndez J, Bernardes GJ, Peregrina JM, Rovira C, Bernad\u00f3 P, Bruscolini P, Clausen H, Lostao A, Corzana F, Hurtado-Guerrero R*. (2015). Nat Commun 6:6937.\u00a0<em>(92 citations\/8 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>First work describing how the lectin domain of GalNAc-Ts modulates O-glycosylation <\/em><\/p>\n<p><strong>3. A proactive role of water molecules in acceptor recognition by protein O-fucosyltransferase 2.\u00a0<\/strong>Valero-Gonz\u00e1lez J, Leonhard-Melief C, Lira-Navarrete E, Jim\u00e9nez-Os\u00e9s G, Hern\u00e1ndez-Ruiz C, Pallar\u00e9s MC, Yruela I, Vasudevan D, Lostao A, Corzana F, Takeuchi H, Haltiwanger RS, Hurtado-Guerrero R*. (2016) Nat Chem Biol 12(4):240-6.\u00a0<em>(65 citations\/7 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>Describes the key role of water molecules in the binding of PoFUT2 to its various protein substrates<\/em><\/p>\n<p><strong>4. The interdomain flexible linker of the polypeptide GalNAc transferases dictates their long-range glycosylation preferences.\u00a0<\/strong>de Las Rivas M, Lira-Navarrete E, Daniel EJP, Compa\u00f1\u00f3n I, Coelho H, Diniz A, Jim\u00e9nez-Barbero J, Peregrina JM, Clausen H, Corzana F, Marcelo F, Jim\u00e9nez-Os\u00e9s G, Gerken TA, Hurtado-Guerrero R*. (2017) Nat Commun 8(1):1959.\u00a0<em>(35 citations\/6 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>First elucidation of the role of a small flexible linker dictating the long-glycosylation preference<\/em><\/p>\n<p><strong>5. Structural basis for arginine glycosylation of host substrates by bacterial effector proteins.\u00a0<\/strong>Park JB, Kim YH, Yoo Y, Kim J, Jun SH, Cho JW, El Qaidi S, Walpole S, Monaco S, Garc\u00eda-Garc\u00eda AA, Wu M, Hays MP, Hurtado-Guerrero R*, Angulo J*, Hardwidge PR, Shin JS*, Cho HS*. (2018) Nat Commun 9(1):4283.\u00a0<em>(52 citations\/5 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>Elucidation of how arginine-glycosyltransferases from entheropathogens glycosylate human proteins to regulate immunological activity<\/em><\/p>\n<p><strong>6. Mechanisms of redundancy and specificity of the Aspergillus fumigatus Crh transglycosylases<\/strong>. Fang W, Sanz AB, Bartual SG, Wang B, Ferenbach AT, Farka\u0161 V, Hurtado-Guerrero R, Arroyo J*, van Aalten DMF*. (2019). Nat Commun 10(1):1669.\u00a0<em>(21 citations\/4 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>Detailed study of the importance of the Crh transglycosylases in the biology of A. fumigatus<\/em><\/p>\n<p><strong>7. Structural basis for substrate specificity and catalysis of <\/strong><strong>\u03b1<\/strong><strong>1,6-fucosyltransferase.\u00a0<\/strong>Garc\u00eda-Garc\u00eda A, Ceballos-Laita L, Serna S, Artschwager R, Reichardt NC, Corzana F, Hurtado-Guerrero R*. (2020). Nat Commun 2020;11(1):973.\u00a0<em>(37 citations\/3 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>Structural basis of how the fucosyltransferase FUT8 achieves core-fucosylation on N-glycans<\/em><\/p>\n<p><strong>8. Molecular basis for fibroblast growth factor 23 O-glycosylation by GalNAc-T3. <\/strong>de Las Rivas M, Paul Daniel EJ, Narimatsu Y, Compa\u00f1\u00f3n I, Kato K, Hermosilla P, Thureau A, Ceballos-Laita L, Coelho H, Bernad\u00f3 P, Marcelo F, Hansen L, Maeda R, Lostao A, Corzana F, Clausen H, Gerken TA, Hurtado-Guerrero R*. (2020). Nat Chem Biol 16(3):351-360. <em>(42 citations\/3 yrs)<\/em><\/p>\n<p><em>Describes the molecular and cellular mechanisms underlying the regulation of FGF23 by GalNAc-T3 <\/em><\/p>\n<p><strong>9. Structural basis for the synthesis of the core 1 structure by C1GalT1.\u00a0<\/strong>Gonz\u00e1lez-Ram\u00edrez AM, Grosso AS, Yang Z, Compa\u00f1\u00f3n I, Coelho H, Narimatsu Y, Clausen H, Marcelo F, Corzana F*, Hurtado-Guerrero R*. (2022) Nat Commun 13(1):2398.\u00a0<em>(6 citations\/1 yr)<\/em><\/p>\n<p><em>Molecular insights into the synthesis of core1 by C1GalT1 <\/em><\/p>\n<p><strong>10. Structural and mechanistic insights into the cleavage of clustered O-glycan patches-containing glycoproteins by mucinases of the human gut.\u00a0<\/strong>Taleb V, Liao Q, Narimatsu Y, Garc\u00eda-Garc\u00eda A, Compa\u00f1\u00f3n I, Borges RJ, Gonz\u00e1lez-Ram\u00edrez AM, Corzana F, Clausen H, Rovira C*, Hurtado-Guerrero R*. (2022) Nat Commun 13(1):4324.\u00a0<em>(7 citations\/1 yr)<\/em><\/p>\n<p><em>Molecular insights into AM0627 function from X-ray crystallography and computer simulations<\/em><\/p>\n<p><strong>11. Molecular basis for bacterial N-glycosylation by a soluble HMW1C-like N-glycosyltransferase.<\/strong> Piniello B, Mac\u00edas-Le\u00f3n J, Miyazaki S, Garc\u00eda-Garc\u00eda A, Compa\u00f1\u00f3n I, Ghirardello M, Taleb V,\u00a0Veloz B, Corzana F, Miyagawa A, Rovira C*,\u00a0Hurtado-Guerrero R*. (2023)\u00a0\u00a0Nat Commun\u00a014(1):5785.<\/p>\n<p><em>Structural and Molecular insights into the N-glycosylation by a soluble N-glycosyltransferase<\/em><\/p>\n<p><strong>12. Identification of global inhibitors of cellular glycosylation<\/strong>. S\u00f8rensen DM, B\u00fcll C, Madsen TD, Lira-Navarrete E, Clausen TM, Clark AE, Garretson AF, Karlsson R, Pijnenborg JFA, Yin X, Miller RL, Chanda SK, Boltje TJ, Schjoldager KT, Vakhrushev SY, Halim A, Esko JD, Carlin AF,\u00a0Hurtado-Guerrero R, Weigert\u00a0R, Clausen H, Narimatsu Y. (2023)\u00a0<a href=\"https:\/\/pubmed.ncbi.nlm.nih.gov\/36804936\/\">.<\/a>\u00a0Nat Commun.\u00a014(1):948.<\/p>\n<p><em>Discovery of inhibitors affecting several pathways of glycosylation.\u00a0<\/em><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>ACTUALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1. PID2019-105451GB-I00.<\/strong><\/p>\n<ol>\n<li style=\"list-style-type: none;\">\n<ol>(AEI, Spain), 2020-2023. 266,200 euros plus extra funding for one PhD student. PI: Ram\u00f3n Hurtado-Guerrero<\/ol>\n<\/li>\n<\/ol>\n<p><strong>2. Desarrollo de nuevas inmunoterapias para el tratamiento del c\u00e1ncer y candidiasis.<\/strong> LMP10_21 (2021-2023). DGA. PI: Ram\u00f3n Hurtado-Guerrero. 54,500 euros.<\/p>\n<p><strong>3. Nuevos tratamientos de inmunoterapia (Nanobodies y c\u00e9lulas CAR) frente a infecciones f\u00fangicas invasivas en pacientes oncopedi\u00e1tricos.<\/strong> Convocatoria de Ayudas a la investigaci\u00f3n del c\u00e1ncer infantil. Aspanoa. 2022-2023. IP: Eva G\u00e1lvez and Maykel Arias. coIPs: Ram\u00f3n Hurtado-Guerrero and Juli\u00e1n Pardo. 60.000 euros<\/p>\n<p><strong>4. Targeting GALNT7 to develop new drugs for the personalised treatment of prostate cancer. Prostate Cancer UK<\/strong>. PIs: Jennifer Munkley and Ben Schumann. Collaborators: Ram\u00f3n Hurtado-Guerrero and others. 2022-2025.<\/p>\n<p><strong>5. GlyCanDrug<\/strong>. European Commission (ITN), HORIZON-MSCA-2022-DN-01. 251,971.20 to my group, 2024-2027. Total to the ITN = 2,696,457.60<\/p>\n<p><strong>6. PID2022-136362NB-I00 (AEI, Spain)<\/strong>, 2023-2026. 375,000 euros plus extra funding for one PhD student. PI: Ram\u00f3n Hurtado-Guerrero<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<ul>\n<li>Robert Haltiwanger, The University of Georgia<\/li>\n<li>Henrik Clausen, University of Copenhagen<\/li>\n<li>Daan van Aalten, University of Dundee<\/li>\n<li>Philip Hardwidge, Kansas State University<\/li>\n<li>Tom Gerken, Case Western Reserver University<\/li>\n<li>Pedro Merino, Universidad de Zaragoza<\/li>\n<li>Francisco Corzana, Universidad de La Rioja<\/li>\n<li>Carme Rovira, Universidad de Barcelona<\/li>\n<li>Filipa Marcelo, New University of Lisbon<\/li>\n<li>Juli\u00e1n Pardo, Universidad de Zaragoza<\/li>\n<li>Anabel Lostao, Universidad de Zaragoza<\/li>\n<\/ul>\n[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbFlavoenzimas: mecanismos de acci\u00f3n y biotecnolog\u00eda\u00bb tab_id=\u00bb1477995658098-2-10&#8243;][vc_column_text title=\u00bbFlavoenzimas: Mecanismos de Acci\u00f3n y Biotecnolog\u00eda\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1760619584686{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Patricia Ferreira Neila<br \/>\nDr. Marta Mart\u00ednez J\u00falvez<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Milagros Medina Trullenque<br \/>\nDr. Patricia Ferreira Neila<br \/>\nDr. Marta Mart\u00ednez J\u00falvez<br \/>\nSergio Boneta Martinez<br \/>\nOlga Arjona Soriano<br \/>\nMaribel Bernab\u00e9 Rivero<br \/>\nPaula Cinca Fernando<br \/>\nV\u00edctor Correa P\u00e9rez<br \/>\nCristina L\u00e1zaro Ruiz<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>Los cofactores mononucle\u00f3tido de flavina (FMN) y dinucle\u00f3tido de flavina y adenina (FAD) permiten que flavoprote\u00ednas y flavoenzimas exhiban una versatilidad redox significativa en una amplia gama de procesos fisiol\u00f3gicos catal\u00edticos, metabolismos primarios y secundarios, as\u00ed como interacci\u00f3n con otras biomol\u00e9culas. Adem\u00e1s, entre las aproximadamente 400 diferentes flavoprote\u00ednas identificadas, casi el 10% act\u00faan en reacciones no relacionadas con procesos redox, o act\u00faan como mol\u00e9culas de se\u00f1alizaci\u00f3n y detecci\u00f3n. Algunas flavoenzimas, pueden funcionar tambi\u00e9n como potentes biocatalizadores debido a la selectividad, el control y la eficiencia en las reacciones en las que participan, mientras que otras pueden servir como dianas terap\u00e9uticas en el tratamiento de enfermedades infecciosas y trastornos patol\u00f3gicos en mam\u00edferos. Sin embargo, la gran diversidad de estas prote\u00ednas y enzimas, sus caracter\u00edsticas espec\u00edficas de especies, as\u00ed como la interacci\u00f3n entre ellas, con otras prote\u00ednas y diversos metabolitos, muestran que todav\u00eda estamos lejos de comprender c\u00f3mo explotar todo su potencial.<\/p>\n<p>En este contexto, el objetivo principal de nuestro equipo es proporcionar una mejor comprensi\u00f3n de los mecanismos moleculares de enzimas metab\u00f3licas clave, con especial \u00e9nfasis en sistemas dependientes de flavoenzimas. Esto ayudar\u00e1 a clarificar sus funciones en los procesos metab\u00f3licos y redes de interacci\u00f3n en los que participan, as\u00ed como a establecer las bases moleculares para facilitar su aplicabilidad como dianas terap\u00e9uticas o biocatalizadores.<\/p>\n<p>Nuestros principales temas de investigaci\u00f3n incluyen:<\/p>\n<ul>\n<li>Desentra\u00f1ar las bases moleculares que determinan las funciones celulares de flavoenzimas humanas implicadas en la bioenerg\u00e9tica celular, la se\u00f1alizaci\u00f3n o la apoptosis tanto en escenarios que implican a c\u00e9lulas sanas como en situaciones que causan patolog\u00edas. Este conocimiento, permitir\u00e1 el desarrollo de nuevas estrategias terap\u00e9uticas para paliar el efecto de las mutaciones pat\u00f3genas.<\/li>\n<li>Identificar el flavoproteoma en especies relevantes e investigar el mecanismo de acci\u00f3n de sus sistemas dependientes de flavoprote\u00ednas y flavoenzimas, para permitir su uso como dianas en la b\u00fasqueda de antimicrobianos y\/o nuevas herramientas biotecnol\u00f3gicas.<\/li>\n<li>Comprender los mecanismos de incorporaci\u00f3n del cofactor flav\u00ednico en las apoprote\u00ednas-cliente y el impacto de las modificaciones end\u00f3genas de la flavina en la funcionalidad de las flavoprote\u00ednas.<\/li>\n<li>Desarrollo de un novedoso cat\u00e1logo de biocatalizadores para ser aplicados en qu\u00edmica sint\u00e9tica sostenible a la producci\u00f3n de compuestos de base biol\u00f3gica de inter\u00e9s.<\/li>\n<li>Desentra\u00f1ar la contribuci\u00f3n de los procesos de uni\u00f3n y din\u00e1mica durante los mecanismos de acci\u00f3n de los sistemas estudiados mediante la combinaci\u00f3n de enfoques estructurales, computacionales y experimentales.<\/li>\n<\/ul>\n<p>En nuestra investigaci\u00f3n, combinamos un gran n\u00famero de herramientas bioqu\u00edmicas, biof\u00edsicas, de biolog\u00eda molecular y biolog\u00eda estructural junto con enfoques computacionales para la expresi\u00f3n, purificaci\u00f3n, dise\u00f1o racional y caracterizaci\u00f3n estructural-funcional de prote\u00ednas y sus redes de interacci\u00f3n.<\/p>\n<p>Las principales metodolog\u00edas utilizadas en nuestra investigaci\u00f3n incluyen:<\/p>\n<ul>\n<li>Producci\u00f3n de prote\u00ednas nativas y mutantes mediante t\u00e9cnicas de ingenier\u00eda de prote\u00ednas.<\/li>\n<li>Expresi\u00f3n de prote\u00ednas hom\u00f3logas y heter\u00f3logas en diferentes microorganismos.<\/li>\n<li>Purificaci\u00f3n de prote\u00ednas y separaci\u00f3n de metabolitos (electroforesis, m\u00e9todos cromatogr\u00e1ficos por FPLC y HPLC, &#8230;).<\/li>\n<li>Espectrometr\u00eda de absorci\u00f3n: estudios cin\u00e9ticos en estado estacionario, espectroscopia diferencial, afinidad de uni\u00f3n, determinaci\u00f3n de potenciales de reducci\u00f3n de punto medio.<\/li>\n<li>Cin\u00e9tica transitoria mediante espectroscopia de flujo detenido multimezcla.<\/li>\n<li>Ensayos de interacci\u00f3n y cin\u00e9tica en condiciones anaer\u00f3bicas.<\/li>\n<li>Espectroscopia de fluorescencia y dicro\u00edsmo circular.<\/li>\n<li>Cristalizaci\u00f3n de prote\u00ednas, difracci\u00f3n de rayos X y cristalograf\u00eda de femtosegundos en serie (SFX) con resoluci\u00f3n temporal de inicio y l\u00e1seres de electrones libres de rayos X (XFEL).<\/li>\n<li>T\u00e9cnicas avanzadas de Resonancia Paramagn\u00e9tica Electr\u00f3nica (ESEEM, HYSCORE, ENDOR).<\/li>\n<li>Calorimetr\u00eda de titulaci\u00f3n isot\u00e9rmica y calorimetr\u00eda diferencial de barrido.<\/li>\n<li>Cribado de alto rendimiento de bibliotecas de compuestos qu\u00edmicos.<\/li>\n<li>M\u00e9todos de Biolog\u00eda Computacional: Acoplamiento molecular, Din\u00e1mica Molecular y simulaciones QM\/MM.<\/li>\n<li>Herramientas bioinform\u00e1ticas para la identificaci\u00f3n y selecci\u00f3n de dianas proteicas.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter wp-image-7581 size-large\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/web_bifi_fig_flavoenz_big-1-1024x735.png\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"735\" \/><br \/>\n<\/strong><\/p>\n<p><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/p>\n<p><strong>1.\u00a0<\/strong><strong>Increased demand for FAD synthesis in differentiated and stem pancreatic cancer cells is accomplished by modulating FLAD1 gene expression: the inhibitory effect of Chicago Sky Blue<\/strong>. Nisco A, Carvalho TMA, Tolomeo M, Di Molfetta D, Leone P, Galluccio M, Medina M, Indiveri C, Reshkin SJ, Cardone RA, Barile M. FEBS J. 2023 Oct;290(19):4679-4694. doi: 10.1111\/febs.16881<\/p>\n<p><strong>2. Beyond a platform protein for the degradosome assembly: The Apoptosis-Inducing Factor as an efficient nuclease involved in chromatinolysis. <\/strong>2023. Novo N, Romero-Tamayo S, Marcuello C, Boneta S, Blasco-Machin I, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Villanueva R, Moreno-Loshuertos R, Lostao A, Medina M, Ferreira P. PNAS Nexus. 2022 26;2(2):pgac312. doi: 10.1093\/pnasnexus\/pgac312. eCollection 2023 Feb.<\/p>\n<p><strong>3. Riboflavin kinase and pyridoxine 5&#8242;-phosphate oxidase complex formation envisages transient interactions for FMN cofactor delivery. <\/strong>2023. Rivero M, Boneta S, Novo N, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Polo V, Medina M. Front Mol Biosci. 10:1167348. doi: 10.3389\/fmolb.2023.1167348. eCollection 2023.<\/p>\n<p><strong>4. Expanding the Physiological Role of Aryl-Alcohol Flavooxidases as Quinone Reductases. <\/strong>2023. Ferreira P, Carro J. Balcells B, Martinez AT, Serrano A. Applied and Environmental Microbiology. May 31;89(5):e0184422. doi: 10.1128\/aem.01844-22.<\/p>\n<p><strong>5. Counterintuitive structural and functional effects due to naturally occurring mutations targeting the active site of the disease-associated NQO1 enzyme<\/strong>. 2023. Pacheco-Garc\u00eda JL, Anoz-Carbonell E, Loginov DS, Kavan D, Salido E, Man P, Medina M, Pey AL. FEBS J. 2023 Apr;290(7):1855-1873. doi: 10.1111\/febs.16677.<\/p>\n<p><strong>6. A global phylogenomic analysis of the shiitake genus <em>Lentinula<\/em>. <\/strong>Sierra-Patev S, Byoungnam M, Naranjo-Ortiz M, Looney B, Konkel Z, Slot JC, Sakamoto Y, Steenwyk JL, Rokas A, Carro J, Camarero S, Ferreira P, \u2026\u00a0 Hibbett D. 2023. PNAS. 120(10):e2214076120. doi: 10.1073\/pnas.2214076120.<\/p>\n<p><strong>7. Mining the Flavoproteome of <em>Brucella ovis<\/em>, the Brucellosis: Causing Agent in Ovis aries.<\/strong> 2022. Minj\u00e1rez-S\u00e1enz M, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Yruela I, Medina M. Microbiol Spectr. 10(2):e0229421. doi: 10.1128\/spectrum.02294-21.<\/p>\n<p><strong>8. Cofactors and pathogens: FMN and FAD biosynthesis by the FAD synthase from <em>Brucella ovis<\/em>.<\/strong> 2022. Moreno SA, Taleb V, Sebasti\u00e1n M, Anoz-Carbonell EA, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Medina M. IUBMB LIFE. 74:655-671. doi: 10.1002\/iub.2576.<\/p>\n<p><strong>9. Atomic Force Microscopy to Elicit Conformational Transitions of Ferredoxin-Dependent Flavin Thioredoxin Reductases.<\/strong> 2021. Marcuello C, Frempong GA, Balsera M, Medina M, Lostao A. Antioxidants 9;10(9):1437. doi: 10.3390\/antiox10091437.<\/p>\n<p><strong>10. Structural basis of the pleiotropic and specific phenotypic consequences of missense mutations in the multifunctional NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1 and their pharmacological rescue. <\/strong>2021. Pacheco-Garcia JL, Anoz-Carbonell E, Vankova P, Kannan A, Palomino-Morales R, Mesa-Torres N, Salido E, Man P, Medina M, Naganathan AN, Pey AL. Redox Biol. 46:102112. doi: 10.1016\/j.redox.2021.102112.<\/p>\n<p><strong>11. W196 and the <\/strong><strong>\u03b2<\/strong><strong>-Hairpin Motif Modulate the Redox Switch of conformation and the Biomolecular Interaction Network of the Apoptosis-Inducing Factor. <\/strong>2021. Romero-Tamayo S, Laplaza R, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Villanueva R, Medina M, P. Ferreira P. Oxid Med Cell Longev. 15;2021:6673661. doi: 10.1155\/2021\/6673661. eCollection 2021.<\/p>\n<p><strong>12. Unexpected diversity of ferredoxin-dependent thioredoxin reductases in cyanobacteria. <\/strong>Buey RM, Fern\u00e1ndez-Justel D, Gonz\u00e1lez-Holgado G, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Gonz\u00e1lez-L\u00f3pez A, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Medina M, Buchanan BB, Balsera M. Plant Physiol. 2021 May 27;186(1):285-296. doi: 10.1093\/plphys\/kiab072.<\/p>\n<p><strong>13. Anaerobic Stopped-Flow Spectrophotometry with Photodiode Array Detection in the Presteady State: An Application to Elucidate Oxidoreduction Mechanisms in Flavoproteins<\/strong> Ferreira P.; Medina M. 2021. METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY. 2280: 135-155. doi: 10.1007\/978-1-0716-1286-6_9<\/p>\n<p><strong>14. The Catalytic Cycle of the Antioxidant and Cancer-Associated Human NQO1 Enzyme: Hydride Transfer, Conformational Dynamics and Functional Cooperativity. <\/strong>\u00a0Anoz-Carbonell E, Timson DJ, Pey AL, Medina M. Antioxidants (Basel). 2020 Aug 20;9(9):772. doi: 10.3390\/antiox9090772<\/p>\n<p><strong>15. Redox-and ligand binding-dependent conformational ensembles in the human apoptosis-inducing factor regulate its pro-life and cell death functions<\/strong>. Villanueva R.; Romero-Tamayo S.; Laplaza R.; Martinez-Olivan J.; Velazquez-Campoy A.; Sancho J.; Ferreira P*; Medina M*.. 2019. ANTIOXIDANTS &amp; REDOX SIGNALING. 30 (18): 2013-2029. doi: 10.1089\/ars.2018.7658.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>PRINCIPALES PROYECTOS<\/strong><\/p>\n<p><strong>1.Flavin dependent systems: multitasking roles from versatile redox<\/strong> <strong>catalysis to cell signaling and sensing molecules.<\/strong> PID2022-136369NB-I00. 2023-2026. Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n. IP1\/2: Milagros Medina\/Patricia Ferreira.<\/p>\n<p><strong>2. Grupo Referencia Biolog\u00eda Estructural. E35_23R. 2023-2025<\/strong>. Gobierno de Arag\u00f3n. IP1\/2: Marta Mart\u00ednez J\u00falvez\/Teresa Bes Fustero.<\/p>\n<p><strong>3. Identification and synthetic applications of novel oxidative biocatalysts in industrial biotechnology<\/strong>. TED2021-130803B-I00. 2022-2024. Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n.\u00a0 IP1\/2: Patricia Ferreira\/Juan Mangas.<\/p>\n<p><strong>4. Flavoenzymes in health, disease and drug discovery<\/strong>. PID2019-103901GB-I00. 2020-2023. Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n. IP1\/2: Milagros Medina\/Patricia Ferreira.<\/p>\n<p><strong>5. Sistemas Enfermedades mitocondriales asociadas al mecanismo de importaci\u00f3n y plegamiento oxidativo de prote\u00ednas en el espacio intermembrana de la mitocondria. Mecanismos moleculares y desarrollo de nuevas estrategias terap\u00e9uticas (EMPLOXPRO)<\/strong>. LMP27_21. Direcci\u00f3n General de Investigaci\u00f3n, Gobierno de Arag\u00f3n. PI: P. Ferreira. 2021-2023. IP: Ferreira P<\/p>\n<p><strong>6. El flavoproteoma de <em>Brucella<\/em>: una herramienta para dianas terap\u00e9uticas y diagn\u00f3sticas<\/strong>. LMP13_21. Direcci\u00f3n General de Investigaci\u00f3n, Gobierno de Arag\u00f3n. 2021-2023. IP: Medina M.<\/p>\n<p><strong>7. Paramagnetic Species in Catalysis Research. A Unified Approach Towards Heterogeneous; Homogeneous and Enzyme Catalysis<\/strong> (H2020 GA Number-813209). Uni\u00f3n Europea. Enero 2019- Diciembre 2023. IP: Dra. Garc\u00eda I.<\/p>\n<p><strong>8. Flavoenzimas: mecanismos y dianas moleculares; patolog\u00edas y aplicaciones biotecnol\u00f3gicas<\/strong>. Ministerio de Econom\u00eda y Competitividad. BIO2016-75183-P. Diciembre 2016-Diciembre 2019. IP: Dra. Medina M.<\/p>\n<p><strong>PATENTS<\/strong><\/p>\n<p><strong>Enzymatic Composition and Enzymatic process for the production of 2,5-furandicarboxylic acid from 5-methoxymethylfurfural using said enzymatic composition.<\/strong>\u00a0J. Carro, E. Fern\u00e1ndez-Fueyo, M. Alcalde,\u00a0P. Ferreira, R. Ullrich, M. Hofrichter, AT. Martinez. CSIC, University of Zaragoza and Technical University of Dresden. 2017.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>COLABORADORES<\/strong><\/p>\n<p><strong>Del BIFI<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Jos\u00e9 Antonio Ainsa.<br \/>\nDr. Patricio Fern\u00e1ndez-Silva<br \/>\nDra. Raquel Moreno Loshuertos.<br \/>\nDr. Victor Polo.<br \/>\nDr. Adri\u00e1n Vel\u00e1zquez-Campoy.<br \/>\nDr. Javier Sancho<\/p>\n<p><strong>De otras instituciones<\/strong><\/p>\n<p><em>Instituto de Nanociencia y Materiales de Arag\u00f3n (INMA), Zaragoza<\/em><br \/>\nDr. Jes\u00fas I. Mart\u00ednez, Dra. In\u00e9s Garc\u00eda-R\u00fabio, Dra Anabel Gracia Lostao.<br \/>\n<em>Centro de Investigaciones Biol\u00f3gicas, CSIC, Madrid<\/em><br \/>\nDr. \u00c1ngel Mart\u00ednez. <span style=\"text-decoration: line-through;\">\u00a0<\/span><br \/>\n<em>Universitat degli Studi di Bari, Bari, Italia <\/em><br \/>\nDra. Maria Barile.<br \/>\n<em>Universidad de Granada, Granada <\/em><br \/>\nDr. \u00c1ngel Pey.<br \/>\n<strong>I<\/strong><em>nstituto de Recursos Naturales y Agrobiolog\u00eda de Salamanca, CSIC, Salamanca<\/em><br \/>\nDra. M\u00f3nica Balsera.<br \/>\n<em>Hospital Universitario Miguel Servet, Zaragoza.<\/em><br \/>\nDr. M. Dolores Miramar, Dr. Jos\u00e9 Luis Caplabo.<br \/>\n<em>Estaci\u00f3n Experimental de Aula Dei<\/em><br \/>\nDr. Manuel Becana, Dra. Inmaculada Yruela.<br \/>\n<em>Centro de Investigaci\u00f3n y Tecnolog\u00eda Agroalimentaria de Arag\u00f3n<\/em><br \/>\nDr. Pilar Mar\u00eda Mu\u00f1oz \u00c1lvaro.<br \/>\n<em>Universitat Jaume I, Castell\u00f3n<\/em><br \/>\nDr. Vicent Moliner.<br \/>\n<em>Universidad de Oviedo, Oviedo<\/em><br \/>\nDr. Juan Mangas-Sanchez.<br \/>\n<em>IIS Hospital 12 de Octubre, Madrid<\/em><br \/>\n<em>Dr. Mar\u00eda Mor\u00e1n<\/em><br \/>\n<em>Universita degli Studi di Milano, Italia<\/em><br \/>\nDr. Alessandro Aliverti.<br \/>\n<em>Mitchell Cancer Institute, University of South Alabama, USA<\/em><br \/>\nDra. Marie Migaud.<br \/>\n<em>Instituto Qu\u00edmica-F\u00edsica Blas Cabrera, Madrid<\/em><br \/>\nDr. Jos\u00e9 Manuel Martin.<br \/>\n<em>Universita degli Studi di Torino, Tur\u00edn, Italia<\/em><br \/>\nDr. Salvatore Adinolfi, Dra. Sheila Sadeghi.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>CONTACTO<\/strong><\/p>\n<p>Patricia Ferreira, <a href=\"mailto:ferreira@unizar.es\">ferreira@unizar.es<\/a>, <a href=\"https:\/\/orcid.org\/0000-0003-4076-6118\">https:\/\/orcid.org\/0000-0003-4076-6118<\/a><br \/>\nMarta Mart\u00ednez J\u00falvez, <a href=\"mailto:mmartine@unizar.es\">mmartine@unizar.es<\/a>, <a href=\"https:\/\/orcid.org\/0000-0001-9047-0046\">https:\/\/orcid.org\/0000-0001-9047-0046<\/a><br \/>\nMilagros Medina, <a href=\"mailto:mmedina@unizar.es\">mmedina@unizar.es<\/a>, <a href=\"https:\/\/orcid.org\/0000-0001-8743-0182\">https:\/\/orcid.org\/0000-0001-8743-0182<\/a>[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbMalplegamiento y agregaci\u00f3n amiloide de prote\u00ednas\u00bb tab_id=\u00bb1477995669247-3-3&#8243;][vc_column_text title=\u00bbMalplegamiento y Agregaci\u00f3n Amiloide de Prote\u00ednas\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1698753581419{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Nunilo Cremades<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Nunilo Cremades<br \/>\nJos\u00e9 Daniel Camino Camino<br \/>\nDavid Polanco Irisarri<br \/>\nAlejandra Carrancho Arroyo<br \/>\nMar\u00eda Mart\u00ednez Monge<br \/>\nBlanca Viguri Lamata<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>El fen\u00f3meno de malplegamiento y agregaci\u00f3n amiloide de prote\u00ednas ha emergido en los \u00faltimos a\u00f1os como un tema de relevancia fundamental en un amplio rango de disciplinas cient\u00edficas como la f\u00edsica, qu\u00edmica, biolog\u00eda y medicina. Esta explosi\u00f3n de inter\u00e9s ha surgido tras el reconocimiento de que aproximadamente 50 enfermedades y desordenes humanos est\u00e1n asociados con el proceso de agregaci\u00f3n amiloide de prote\u00ednas, algunos de los cuales se encuentran entre las condiciones m\u00e9dicas m\u00e1s comunes y debilitantes del mundo moderno, incluyendo la enfermedad de Alzheimer, de Parkinson y la diabetes tipo II.<\/p>\n<p>A pesar del impacto social y econ\u00f3mico de algunas de estas enfermedades, se desconocen los or\u00edgenes moleculares y mecanismos de la agregaci\u00f3n amiloide de prote\u00ednas, as\u00ed como de su toxicidad asociada. En los \u00faltimos a\u00f1os, se ha propuesto que procesos aberrantes de separaci\u00f3n de fases l\u00edquido-l\u00edquido y l\u00edquid-s\u00f3lido de prote\u00ednas puedan estar implicados en los eventos iniciales de la formaci\u00f3n de agregados amiloides en muchas de estas enfermedades. La investigaci\u00f3n desarrollada en el grupo liderado por la Dra. Nunilo Cremades aspira a resolver estas cuestiones fundamentales mediante la combinaci\u00f3n de un amplio rango de t\u00e9cnicas biof\u00edsicas, incluyendo fluorescencia de part\u00edcula \u00fanica, con experimentos de biolog\u00eda celular. Se pretende, adem\u00e1s, identificar nuevas dianas proteicas para el desarrollo de herramientas de diagn\u00f3stico precoz y de tratamientos m\u00e1s efectivos para este tipo de enfermedades.<\/p>\n<p><strong><em><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter wp-image-7633 size-full\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1.jpg\" alt=\"\" width=\"925\" height=\"443\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1.jpg 925w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1-300x144.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-1-768x368.jpg 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 925px) 100vw, 925px\" \/><\/em><\/strong><\/p>\n<p><strong><em>Figura 1. <\/em><\/strong><em>El desarrollo y la aplicaci\u00f3n de t\u00e9cnicas de fluorescencia de part\u00edcula \u00fanica nos ha permitido investigar el proceso de agregaci\u00f3n amiloide con un nivel de detalle sin precedente e identificar nuevas posibles dianas terap\u00e9uticas. <\/em><strong><em>Cremades N. et al. Cell 2012.<\/em><\/strong><\/p>\n<h3><strong><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-7635 size-full aligncenter\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2.jpg\" alt=\"\" width=\"568\" height=\"444\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2.jpg 568w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-2-300x235.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 568px) 100vw, 568px\" \/><\/strong><\/h3>\n<p><strong><em>Figura 2.<\/em><\/strong><em> Hemos sido capaces de purificar especies oligom\u00e9ricas muy estables de alfa-synucleina, prote\u00edna cuya agregaci\u00f3n y deposici\u00f3n est\u00e1 asociada al desarrollo de la enfermedad de Parkinson, y hemos mostrado que estas especies son altamente t\u00f3xicas y tienen propiedades generales comunes con otras especies oligom\u00e9ricas generadas por otras prote\u00ednas amiloidog\u00e9nicas. Mediante la combinaci\u00f3n de un amplio rango de m\u00e9todos biof\u00edsicos con t\u00e9cnicas de reconstrucci\u00f3n de im\u00e1genes de criomicroscop\u00eda electr\u00f3nica hemos sido capaces de obtener modelos estructural tridimensionales y revelar la arquitectura estructural cuaternaria de estos oligom\u00e9ros t\u00f3xicos de alfa-synucleina.<strong> Chen SW. et al. PNAS USA 2015; Fusco G et al. <\/strong><\/em><strong><em>Science 2017; Cascella R et al. Nat. Commun. 2021<\/em><\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong><em><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter wp-image-7637 size-large\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-1024x381.jpg\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"381\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-1024x381.jpg 1024w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-300x112.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3-768x286.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/imagen-3.jpg 1172w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/em><\/strong><\/p>\n<p><strong><em>Figura 3.<\/em><\/strong><em> Hemos identificado que las prote\u00ednas alfa-sinucleina (<\/em><em>a<\/em><em>S) y Tau son capaces de formar condensados l\u00edquidos por un proceso de separaci\u00f3n de fases l\u00edquido-l\u00edquido (LLPS) y que con el tiempo se forman agregados amiloides que contienen ambas prote\u00ednas en su interior. Este proceso podr\u00eda estar involucrado en la formaci\u00f3n de hetero-agregados amiloides de ambas prote\u00ednas encontrados en el cerebro de pacientes de Parkinson. Hemos puesto a punto una bater\u00eda de t\u00e9cnicas de fluorescencia para estudiar procesos de LLPS y LSPT (liquid-to-solid phase transitions) como FLIM, FCCS, smFRET. <\/em><strong><em>Gracia P. and Polanco D. et al. Nat. Commun. 2022<\/em><\/strong><\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1. <\/strong>Gracia P and Polanco D, Taranc\u00f3n-D\u00edez J, Serra I, Bracci M, Oroz J, Laurents DV, Grac\u00eda I, Cremades N<strong>*.\u00a0 Molecular mechanism for the synchronized electrostatic coacervation and co-aggregation of alpha-synuclein and Tau.<\/strong> <em>Nat. <\/em><em>Commun. <\/em>(2022). Aug 6;13(1):4586. doi: 10.1038\/s41467-022-32350-9.<\/p>\n<p><strong>2.<\/strong> Santos J, Gracia P, Navarro S, Pe\u00f1a-D\u00edaz S, Pujols J, Cremades N*, Pallar\u00e9s I*, Ventura S*. <strong>Alpha-helical peptidic scaffolds to target alpha-synuclein toxic species with nanomolar affinity.<\/strong> <em>Nat. Commun. <\/em>(2021) Jun 18; 12(1):3752. doi: 10.1038\/s41467-021-24039-2.<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong> Cascella R, Chen SW, Bigi A, Camino JD, Xu CK, Dobson CM, Chiti F, Cremades N*, Cecchi C*. <strong>The release of toxic oligomers from alpha-synuclein fibrils induces dysfunction in neuronal cells.<\/strong> <em>Nat. Commun. <\/em>(2021) Mar 22; 12(1):1814. doi: 10.1038\/s41467-021-21937-3.<\/p>\n<p><strong>4.<\/strong> Camino JD, Gracia P, Chen SW, Sot J, de la Arada I, Sebasti\u00e1n V, Arrondo JLR, Go\u00f1i FM, Dobson CM, Cremades N*. <strong>The extent of protein hydration dictates the preference for heterogeneous or homogeneous nucleation generating either parallel or antiparallel beta-sheet alpha-synuclein aggregates<\/strong>. <em>Chem. Sci. <\/em>(2020) Oct 15; 11(43):11902-11914. doi: 10.1039\/d0sc05297c.<\/p>\n<p><strong>5.<\/strong> Froula JM, Castellana-Cruz M, Anabtawi NM, Camino JD, Chen SW, Thrasher DR, Freire J, Yazdi AA, Fleming S, Dobson CM, Kumita JR,\u00a0Cremades N*, Volpicelli-Daley LA*. <strong>Defining alpha-synuclein species responsible for Parkinson\u00b4s disease phenotypes in mice.<\/strong> <em>J. Biol. Chem<\/em>. (2019) Jul 5; 294(27):10392-10406.<\/p>\n<p><strong>6.<\/strong> Fusco G, Chen S., Williamson PTF, Cascella R, Perni M, Jarvis JA, Cecchi C, Vendruscolo M, Chiti F, Cremades N*, Ying L, Donson CM*, De Simone A*.\u00a0 <strong>Structural basis of membrane disruption and cellular toxicity by alpha-synuclein oligomers.<\/strong> <em>Science<\/em> (2017) Dec 15;358(6369):1440-1443.<\/p>\n<p><strong>7.<\/strong> Chen SW, Drakulic S, Deas E, Ouberai M, Aprile FA, Arranz R, Ness S, Roodveldt C, Guilliams T, De-Genst EJ, Klenerman D, Wood NW, Knowles TPJ, Alfonso C, Rivas G, Abramov AY, Valpuesta JM, Dobson CM*, Cremades N*. <strong>Structural characterization of toxic oligomers that are kinetically trapped during \u03b1-synuclein fibril formation.<\/strong> <em>Proc. Natl. Acad. Sci U.S.A.<\/em> (2015) Apr 21;112(16):E1994-2003.<\/p>\n<p><strong>8.<\/strong> Cremades N, Cohen SI, Deas E, Abramov AY, Chen AY, Orte A, Sandal M, Clarke RW, Dunne P, Aprile FA, Bertoncini CW, Wood NW, Knowles TPJ, Dobson CM*, Klenerman D<strong>*<\/strong><strong>. Direct observation of the interconversion of normal and toxic forms of alpha-synuclein.<\/strong> <em>Cell <\/em>(2012) 149(5): 1048-59.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1. GAP-101098989.<\/strong> <strong>IVBM-4PAP: Development of an In-Vivo Brillouin Microscope (with application to Protein Aggregation-based Pathologies). <\/strong>Sponsor: European Union -HORIZON-EIC-2022-PATHFINDEROPEN-01. 2023-2026. Total granted: 3.333.513 \u20ac. To the Univ. Zaragoza: 530.198,75 \u20ac. PI: N. Cremades<\/p>\n<p><strong>2. PID2022-136997NB-I00:<\/strong> <strong>Understanding liquid-liquid phase separation and liquid-to-solid phase transitions in amyloidogenic proteins:<\/strong> New paradigms in Alzheimer\u00b4s and Parkinson\u00b4s disease. Sponsor: Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n. 2023-2026. 250.000 \u20ac. PI: N. Cremades<\/p>\n<p><strong>3. LMP17_21: Development and validation of biomarker assays for the early diagnosis of Parkinson\u00b4s disease.<\/strong> Sponsor: Gobierno de Arag\u00f3n. 2021-2023. 99.948,8\u20ac. PI: N. Cremades<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<p>Laura Volpicelli-Daley (University of Alabama, USA)<br \/>\nFabrizio Chiti (University of Florence, Italy)<br \/>\nJanet Kumita (University of Cambridge, UK)<br \/>\nDouglas V. Laurents (IQFR-CSIC, Spain)<br \/>\nFelix Go\u00f1i (Basque Centre for Biophysics, Spain)<br \/>\nArturo Muga (Basque Centre for Biophysics, Spain)<br \/>\nPaola Picotti (ETH Zurich, Switzerland)<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Contacto<\/strong><\/h3>\n<p>Dra. Nunilo Cremades<\/p>\n<p>Instituto de Biocomputaci\u00f3n y F\u00edsica de Sistemas Complejos<br \/>\nUniversidad de Zaragoza<br \/>\nMariano Esquillor S\/N. Edificio I+D+i<br \/>\nZaragoza 50018, Spain<br \/>\nTel\u00e9fono: +34-876555417<br \/>\nEmail: \u00a0<a href=\"mailto:ncc@unizar.es\">ncc@unizar.es<\/a><br \/>\nWeb del grupo<br \/>\n<a href=\"https:\/\/sites.google.com\/view\/neuromol\/p%C3%A1gina-principal\">https:\/\/sites.google.com\/view\/neuromol\/p%C3%A1gina-principal<\/a>[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbDiagn\u00f3stico cl\u00ednico y drug delivery\u00bb tab_id=\u00bb1477995679810-4-3&#8243;][vc_column_text title=\u00bbDiagn\u00f3stico Cl\u00ednico y Drug Delivery\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1583840179231{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Olga Abian Franco<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Rafael Claver\u00eda, Predoctoral Student<br \/>\nMar\u00eda Arruebo, Predoctoral Student<br \/>\nAlberto Rodrigo, Predoctoral Student<br \/>\nArturo Vinuesa, Predoctoral Student<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p><u><b>Diagn\u00f3stico cl\u00ednico<\/b><\/u><\/p>\n<p>La Calorimetr\u00eda diferencial de barrido (DSC) ha surgido recientemente como una t\u00e9cnica prometedora que proporciona informaci\u00f3n \u00fatil sobre interact\u00f3mica de suero \/ plasma (composici\u00f3n en prote\u00ednas y metabolitos, as\u00ed como sus interacciones).<\/p>\n<p>Como resultado de la enfermedad, la composici\u00f3n de suero \/ plasma se altera y es posible discriminar entre individuos sanos y los pacientes con ciertas enfermedades.<\/p>\n<p>Un estudio previo realizado en nuestro grupo (25 sujetos sanos y 60 pacientes con adenocarcinoma g\u00e1strico) mostr\u00f3 que hab\u00eda diferencias significativas en las variables obtenidas a partir de los perfiles calorim\u00e9tricos de pacientes con adenocarcinoma g\u00e1strico y sanos y tambi\u00e9n entre pacientes con diferentes estadios de la enfermedad.<\/p>\n<p>En esta l\u00ednea de investigaci\u00f3n se propone la validaci\u00f3n y la aplicaci\u00f3n de una metodolog\u00eda (DIGCAL) como una herramienta \u00fatil en el diagn\u00f3stico y seguimiento de patolog\u00edas tumorales (adenocarcinoma ductal pancre\u00e1tico, lesiones qu\u00edsticas pancre\u00e1ticas preneopl\u00e1sicas y c\u00e1ncer de est\u00f3mago), as\u00ed como en el aislamiento y la identificaci\u00f3n de biomarcadores potenciales tumorales.<\/p>\n<p>Los perfiles calorim\u00e9tricos de suero de sujetos sanos y pacientes con los tres tipos de c\u00e1ncer en diferentes etapas se obtendr\u00e1n antes y despu\u00e9s de 6 meses de tratamiento cl\u00ednico. El an\u00e1lisis multiparam\u00e9trico de los perfiles t\u00e9rmicos nos permitir\u00e1 establecer un protocolo cl\u00ednico para: 1 \/ cribado de un determinado proceso tumoral; 2 \/ pacientes que clasifican de acuerdo a su estadio tumoral; 3 \/ control de la progresi\u00f3n o el control de la enfermedad; 4 \/ identificaci\u00f3n de biomarcadores espec\u00edficos para cada tipo de enfermedad.<\/p>\n<p>DIGCAL podr\u00eda llegar el nivel cl\u00ednico no s\u00f3lo como una herramienta de diagn\u00f3stica, sino tambi\u00e9n como un sistema de monitorizaci\u00f3n y seguimiento de los pacientes durante el tratamiento terap\u00e9utico, la adici\u00f3n de valor en las decisiones de pron\u00f3stico o farmacol\u00f3gicos. Al mismo tiempo, los biomarcadores potenciales identificados podr\u00edan ser parte de un kit de diagn\u00f3stico f\u00e1cil de usar para los puntos de atenci\u00f3n primaria.<\/p>\n<p><u><b>Drug Delivery<\/b><\/u><\/p>\n<p>Drug delivery es el m\u00e9todo o proceso de administraci\u00f3n de un compuesto farmacol\u00f3gico para alcanzar un efecto terap\u00e9utico en humanos o animales. Las tecnolog\u00edas de drug delivery modifican el perfil de liberaci\u00f3n del f\u00e1rmaco (absorci\u00f3n, distribuci\u00f3n, y eliminaci\u00f3n) en beneficio de la mejora de su eficacia y seguridad, adem\u00e1s de evitar inconvenientes a los pacientes y hacer m\u00e1s c\u00f3modo su utilizaci\u00f3n. La liberaci\u00f3n de las drogas puede basarse en difusi\u00f3n, degradaci\u00f3n, y mecanismos de afinidad. Las rutas de administraci\u00f3n m\u00e1s comunes incluyen preferentemente las v\u00edas no invasivas como peroral (a trav\u00e9s de la boca), t\u00f3pica (piel), transmucosal (nasal, bucal\/sublingual, vaginal, ocular y rectal) y rutas de inhalaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Muchos medicamentos como p\u00e9ptidos, prote\u00ednas, anticuerpos, vacunas y drogas basadas en genes, generalmente no pueden ser utilizados utilizando estas rutas ya que pueden ser susceptibles de degradaci\u00f3n enzim\u00e1tica o puede que no sean incorporadas al sistema circulatorio a una concentraci\u00f3n terap\u00e9uticamente efectiva debido a su tama\u00f1o molecular y carga. Por esta raz\u00f3n muchos f\u00e1rmacos basados en prote\u00ednas y p\u00e9ptidos han de ser distribuidos mediante inyecci\u00f3n (por ejemplo, muchas inmunizaciones en las que han de liberarse prote\u00ednas).<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-1095\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/5.jpg\" alt=\"5\" width=\"200\" height=\"220\" \/>\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0<img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-1097\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/6.jpg\" alt=\"6\" width=\"220\" height=\"220\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/6.jpg 250w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/6-150x150.jpg 150w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/6-225x225.jpg 225w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/6-200x200.jpg 200w\" sizes=\"auto, (max-width: 220px) 100vw, 220px\" \/><\/p>\n<p>Los esfuerzos actuales en el \u00e1rea de drug delivery incluyen el desarrollo de liberaci\u00f3n dirigida en el que el f\u00e1rmaco s\u00f3lo es activo en una zona concreta del cuerpo (por ejemplo, tejido cancer\u00edgeno) y las formulaciones son de liberaci\u00f3n sostenida en las que el f\u00e1rmaco se libera durante un cierto periodo de tiempo de manera controlada. Para alcanzar una eficiente liberaci\u00f3n dirigida, el sistema dise\u00f1ado debe evitar los mecanismos de sistema de defensa del paciente y llegar a su pretendido sitio de acci\u00f3n. Tipos de formulaciones de liberaci\u00f3n sostenida incluyen liposomas, microesferas cargadas biodegradables y pol\u00edmeros conjugados con f\u00e1rmacos. En este sentido, las nanopart\u00edculas (NP) en biomedicina representan una tecnolog\u00eda prometedora para el transporte y liberaci\u00f3n de f\u00e1rmacos. Hay muchas posibilidades de funcionalizaci\u00f3n de la superficie de las NP y gracias a esta versatilidad, se pueden desarrollar diferentes estrategias para incluir f\u00e1rmacos en ellas (permitiendo a las NP ir mayoritariamente al lugar de acci\u00f3n).<\/p>\n<p>Esta l\u00ednea de investigaci\u00f3n representa una nueva estrategia para la inclusi\u00f3n de algunos compuestos antivirales activos contra el virus de la hepatitis C (VHC), que se desarrollaron previamente en este grupo.<\/p>\n<p>Se han utilizado varios materiales:<\/p>\n<p><i><b>1\/ Ciclodextrinas: <\/b><\/i><\/p>\n<p>La estructura qu\u00edmica de las CD, oligosac\u00e1ridos c\u00edclicos compuestos de residuos alfa-1,4-glucos\u00eddicos, les confieren propiedades estructurales y propiedades f\u00edsico-qu\u00edmicas \u00f3ptimas que permiten su uso como portadores moleculares.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-1099 aligncenter\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8.jpg\" alt=\"8\" width=\"719\" height=\"206\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8.jpg 914w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8-300x86.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8-768x219.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8-330x94.jpg 330w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8-736x210.jpg 736w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/8-414x118.jpg 414w\" sizes=\"auto, (max-width: 719px) 100vw, 719px\" \/><br \/>\nEn su cavidad hidrof\u00f3bica pueden ser atrapados una amplia gama de compuestos que van desde los iones a las prote\u00ednas. Adem\u00e1s, presentan baja citotoxicidad e inmunogenicidad.<br \/>\nLos complejos CD-droga se han utilizado en el campo farmac\u00e9utico con el fin de mejorar las propiedades de absorci\u00f3n, distribuci\u00f3n, metabolismo, excreci\u00f3n y toxicidad (ADMET) relacionados con la PI de un f\u00e1rmaco (por ejemplo, solubilidad, la estabilidad, la entrega y la liberaci\u00f3n, la permeabilidad de la membrana y la absorci\u00f3n, la toxicidad). En la actualidad, m\u00e1s de 30 productos que se pueden encontrar en el mercado basados en complejos de CD.<\/p>\n<p><i><b>2\/ Shell Cross-Linked Polymeric Micelles<\/b><\/i><\/p>\n<p>Las micelas polim\u00e9ricas reticuladas (CLPM), formadas por copol\u00edmeros de bloques anfif\u00edlicos, han tenido \u00e9xito para aplicaciones biom\u00e9dicas. Primero, puedan cumplir con esos requisitos generales para los sistemas de administraci\u00f3n de f\u00e1rmacos: solubilidad en agua, de baja toxicidad, para aumentar la estabilidad del f\u00e1rmaco dentro de los organismos vivos, para facilitar la captaci\u00f3n celular en comparaci\u00f3n con el f\u00e1rmaco libre, y para producir su liberaci\u00f3n controlada en un lugar espec\u00edfico. En segundo lugar, la naturaleza anfif\u00edlica de los resultados de pol\u00edmeros constituyentes en un n\u00facleo hidr\u00f3fobo y una cubierta hidr\u00f3fila que permite la encapsulaci\u00f3n de los dos tipos de drogas. En tercer lugar, estas nanopart\u00edculas ofrecen a\u00fan m\u00e1s la estabilidad en condiciones de alta diluci\u00f3n, debajo de la concentraci\u00f3n micelar cr\u00edtica, en comparaci\u00f3n con otras micelas polim\u00e9ricas.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-1101 aligncenter\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9.jpg\" alt=\"9\" width=\"720\" height=\"180\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9.jpg 2048w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-300x75.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-768x192.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-1024x256.jpg 1024w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-330x82.jpg 330w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-1200x300.jpg 1200w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-736x184.jpg 736w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-1920x479.jpg 1920w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-1280x319.jpg 1280w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/9-414x103.jpg 414w\" sizes=\"auto, (max-width: 720px) 100vw, 720px\" \/><\/p>\n<p>En efecto, la reticulaci\u00f3n evita su desintegraci\u00f3n en el torrente sangu\u00edneo y la liberaci\u00f3n de la droga antes de llegar a la c\u00e9lula diana. En particular, la fijaci\u00f3n de la estructura de micelas por reticulaci\u00f3n covalente inducida por la luz, sobre todo el empleo de grupos reactivos de acrilato, representa un procedimiento limpio y eficaz para preparar micelas polim\u00e9ricas estables que pueden contener cualquiera de las mol\u00e9culas solubles en agua y no solubles en agua y el transporte a trav\u00e9s de el torrente sangu\u00edneo.<\/p>\n<p><i><b>3\/ Block Copolymers Micelles<\/b><\/i><\/p>\n<p>Los veh\u00edculizadores de f\u00e1rmacos polim\u00e9ricos son uno de los retos actuales de la nanomedicina. Desde que se introdujo el concepto de encapsulaci\u00f3n de f\u00e1rmacos f\u00edsica dentro de los agregados polim\u00e9ricos, se han identificado un n\u00famero significativo de ellos. En particular, la construcci\u00f3n de veh\u00edculos de f\u00e1rmacos basados en copol\u00edmero de bloques anfif\u00edlicos es un tema de gran inter\u00e9s y estimulante desde el punto de vista de la investigaci\u00f3n interdisciplinaria en qu\u00edmica, biolog\u00eda y ciencia de los materiales. En medio acuoso, el autoensamblaje de copol\u00edmeros en bloque anfif\u00edlicos (BCS) sirve para minimizar las interacciones hidr\u00f3fobas energ\u00e9ticamente desfavorables en agua y pueden conducir a una gran variedad de nanoestructuras polim\u00e9ricas incluyendo especialmente micelas esf\u00e9ricas y ves\u00edculas atractivas.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.- Polymeric micelles from block copolymers containing 2,6-diacylaminopyridine units for encapsulation of hydrophobic drugs.<\/strong><br \/>\nConcell\u00f3n A, Claver\u00eda-Gimeno E, Vel\u00e1zquez-Campoy A,\u00a0Abian O, Pi\u00f1ol M, Oriol L.RSC Advances, 2016, 6, 24066\u201324075.<\/p>\n<p><strong>2.- Biophysical Screening for Identifying Pharmacological Chaperones and Inhibitors against Conformational and Infectious Diseases.<\/strong> Velazquez-Campoy A, Sancho J,\u00a0Abian O, Vega S. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/26844568\">Curr Drug Targets. 2016 Jan 31. [Epub ahead of print]<\/a><\/p>\n<p><strong>3.- Cysteine Mutational Studies Provide Insight into a Thiol-Based Redox Switch Mechanism of Metal and DNA Binding in FurA from Anabaena sp. PCC 7120.<\/strong> Botello-Morte L, Pellicer S, Sein-Echaluce VC, Contreras LM, Neira JL,\u00a0Abian O, Vel\u00e1zquez-Campoy A, Peleato ML, Fillat MF, Bes MT. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/26414804\">Antioxid Redox Signal. 2016, 24, 173-185.<\/a><\/p>\n<p><strong>4.- On the link between conformational changes, ligand binding and heat capacity.<\/strong> Vega S,\u00a0Abian O, Velazquez-Campoy A. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/26476135\">Biochim Biophys Acta. 2015 Oct 14. pii: S0304-4165(15)00274-3.<\/a><\/p>\n<p><strong>5.- Shell Cross-Linked Polymeric Micelles as Camptothecin Nanocarriers for anti-HCV Therapy.<\/strong> Jim\u00e9nez-Pardo I, Gonz\u00e1lez-Pastor R, Lancelot A, Claveria-Gimeno R, Vel\u00e1zquez-Campoy A,\u00a0Abian O, Ros MB, and Sierra T. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/26045353\">Macromol. Biosci. 2015, 15, 1381\u20131391.<\/a><\/p>\n<p><strong>6.- Su1990 A New Technology for the Classification of Patients With Gastric Adenocarcinoma Based on Differential Scanning Calorimetry Serum Thermograms.<\/strong> Vega S, Garcia-Gonzalez MA, Lanas A, Velazquez-Campoy A,\u00a0Abian O.*. <a href=\"http:\/\/www.gastrojournal.org\/article\/S0016-5085(15)31919-3\/abstract\">Gastroenterology 148(4): S-569 \u00b7 April 2015<\/a><\/p>\n<p><strong>7.- Rescuing compound bioactivity in a secondary cell-based screening by using \u03b3-cyclodextrin as a molecular carrier<\/strong>. Claver\u00eda-Gimeno R, Vega S, Grazu V, De la Fuente JM, Lanas A, Velazquez-Campoy A,\u00a0Abian O.*. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/25834436\">International Journal of Nanomedicine 2015, 10: 2249-2259.<\/a><\/p>\n<p><strong>8.- Deconvolution Analysis for Classifying Gastric Adenocarcinoma Patients Based on Differential Scanning Calorimetry Serum Thermograms.<\/strong> Vega S, Garcia-Gonzalez MA, Lanas A, Velazquez-Campoy A,\u00a0Abian O.*. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/25614381\">Scientific reports, 5:7988 (2015).<\/a><\/p>\n<p><strong>9.- Ionic liquids in water: a green and simple approach to improve activity and selectivity of lipases<\/strong>.<br \/>\nFilice M, Romero O,\u00a0\u00a0Abian O, De las Rivas B and Palomo J.M. <a href=\"http:\/\/pubs.rsc.org\/EN\/content\/articlepdf\/2014\/ra\/c4ra07625g\">RSC Advances 4: 49115- 49122 (2014).<\/a><\/p>\n<p><strong>10.- A unified framework based on the binding polynomial for characterizing biological systems by isothermal titration calorimetry<\/strong>. Vega S.,\u00a0Abian O.*and Velazquez-Campoy A. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/25305413\">Methods. 2014 pp: S1046-2023(14) 00316-8.<\/a><\/p>\n<p><strong>11.- Allosteric Inhibitors of the NS3 Protease From the Hepatitis C Virus.<\/strong> Abian O.*, Vega S., Sancho J., Velazquez-Campoy A.\u00a0<a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/23936097\">PLOSone 2013, 8 (7): 69773.<\/a><\/p>\n<p><strong>12.- NS3 protease from hepatitis C virus: Biophysical studies on an intrinsically disordered protein domain.<\/strong> Vega S., Neira J.L., Marcuello C.,\u00a0 Lostao A.,\u00a0Abian O. *\u00a0and Velazquez-Campoy A. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/23803659\">International Journal of Molecular Sciences 2013, 14: 13282-13306.<\/a><\/p>\n<p><strong>13.- Experimental Validation of In Silico Target Predictions on Synergistic Protein Targets.<\/strong> Cortes-Ciriano I, Koutsoukas A,\u00a0Abian O, Velazquez-Campoy A and Bender A. MedChemComm 2013, 4, 278\u2013288.<\/p>\n<p><strong>14.- Altering the interfacial activation mechanism of a lipase by solid-phase selective chemical modification.<\/strong> L\u00f3pez-Gallego F,\u00a0Abian O, Guis\u00e1n JM. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/22876885\">Biochemistry. 2012 Sep 4;51(35):7028-36.<\/a><\/p>\n<p><strong>15.- Semisynthetic peptide-lipase conjugates for improved biotransformations.<\/strong> Romero O, Filice M, de las Rivas B, Carrasco-Lopez C, Klett J, Morreale A, Hermoso JA, Guisan JM,\u00a0Abian O, Palomo JM. <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/22858661\">Chem Commun (Camb). 2012 Sep 18;48(72):9053-5.<\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>Proyectos Actuales:<\/strong><\/p>\n<p><strong>1.- Analysis of protein\/metabolites interactions in plasma serum using calorimetry: application as a quick and noninvasive diagnostic method for early detection and monitoring of tumoral digestive diseases (DIGCAL).<\/strong> Funding Institution: Health Institute Carlos III. From:\u00a0January 2016 To:\u00a0December 2018. Principal Investigator (PI):\u00a0Olga Abian Franco.<\/p>\n<p><strong>2.- Validaci\u00f3n de un nuevo m\u00e9todo diagn\u00f3stico en suero, r\u00e1pido no invasivo para detecci\u00f3n precoz de c\u00e1ncer de p\u00e1ncreas (PANCal).<\/strong> Funding Institution: Asociaci\u00f3n Espa\u00f1ola de Gastroenterolog\u00eda (AEG). From:\u00a02015 To:\u00a02016. Principal Investigator (PI):\u00a0Olga Abian Franco.<\/p>\n<p><strong>Proyectos Anteriores:<\/strong><\/p>\n<p><strong>3.- Adapted Nanoparticles for transport and specific release of drugs against hepatitis C virus (VHC).<\/strong><br \/>\nFunding Institution: Health Institute Carlos III. From:\u00a02011 To:\u00a02013. Principal Investigator (PI):\u00a0Olga Abian Franco.<\/p>\n<p><strong>4.- Implementation of\u00a0<em>in vitro<\/em>\u00a0e\u00a0<em>in vivo<\/em>\u00a0studies of anti-infectious compounds effective against\u00a0<em>Helicobacter pylori<\/em>\u00a0y el HCV (hepatitis C virus).<\/strong> Funding Institution: Health Institute Carlos III. From:\u00a02008 To:\u00a02011. Principal Investigator (PI):\u00a0Olga Abian Franco.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<p><strong>Colaboradores del BIFI<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Adri\u00e1n Vel\u00e1zquez-Campoy<br \/>\nProf. Javier Sancho<br \/>\nDr. Jose Luis Neira<\/p>\n<p><strong>Colaboradores de otras Instituciones<\/strong><\/p>\n<p><em>James Graham Brown Cancer Center, University of Louisville, Louisville, KY, EEUU<\/em><br \/>\nPhD. Nichola Garbett<\/p>\n<p><em>Instituto Aragon\u00e9s de Ciencias de la Salud (I+CS), Zaragoza<\/em><br \/>\nProf. Angel Lanas<br \/>\nDra. Trinidad Serrano<br \/>\nDra. Estela Solanas<\/p>\n<p><em>Instituto de Ciencia de Materiales de Arag\u00f3n (ICMA). Qu\u00edmica Org\u00e1nica. Facultad de Ciencias.<\/em><br \/>\nDra. Teresa Sierra<br \/>\nProf. Luis Oriol<br \/>\nProf. Milagros Pi\u00f1ol<\/p>\n<p><em>Instituto de Nanociencia (INA), Universidad de Zaragoza, Zaragoza<\/em><br \/>\nDr. Jes\u00fas Mart\u00ednez de Lafuente<br \/>\nDra. Valeria Graz\u00fa<br \/>\nDra. Berta Saez<\/p>\n<p><em>Universidad de San Jorge (USJ)<\/em><br \/>\nProf. Victor L\u00f3pez<br \/>\nProf. Elisa Langa<\/p>\n<p><em>Instituto de Cat\u00e1lisis y Petroleoqu\u00edmica, CSIC, Madrid.<\/em><br \/>\nDr. Jose Miguel Palomo<br \/>\nDr. Fernando L\u00f3pez Gallego<br \/>\nDr. Jose Manuel Guisan<\/p>\n<p><em>Universidad de Zaragoza<\/em><br \/>\nDr. Jose Antonio Ainsa<\/p>\n<p><em>Unidad de Investigaci\u00f3n Traslacional, Hospital Universitario Miguel Servet, Zaragoza<\/em><br \/>\nDra. Pilar Alfonso<br \/>\nDra. Pilar Giraldo<br \/>\nDr. Miguel Pocovi<\/p>\n<p><em>Servicio de Microbiolog\u00eda-INIBIC. Complejo Hospitalario Universitario A Coru\u00f1a, La Coru\u00f1a<\/em><br \/>\nDr. Francisco Jos\u00e9 P\u00e9rez-Llarena[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab tab_id=\u00bb1479459026705-7-7&#8243; title=\u00bbBiolog\u00eda estructural de receptores de membrana neuronales\u00bb][vc_column_text title=\u00bbBiolog\u00eda estructural de receptores de membrana neuronales\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1705055218983{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Beatriz Herguedas Franc\u00e9s<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Carlos Vega Guti\u00e9rrez (PhD student)<br \/>\nIrene S\u00e1nchez Valls (PhD student)<br \/>\nVictoria del Pilar Rib\u00f3n Fuster (TFM student)<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p>Los receptores de glutamato tipo AMPA (AMPAR) son canales i\u00f3nicos regulados que median la neurotransmisi\u00f3n r\u00e1pida excitatoria en el sistema nervioso central y est\u00e1n involucrados en la plasticidad neuronal. Su disfunci\u00f3n se asocia con varias enfermedades, como la esclerosis lateral amiotr\u00f3fica, la epilepsia y el infarto cerebral. Los receptores AMPAR son un grupo diverso de complejos proteicos con diferentes propiedades cin\u00e9ticas, de tr\u00e1fico celular y farmacol\u00f3gica. Esta diversidad se alcanza a diferentes niveles. Por un lado, el receptor tetram\u00e9rico contiene un n\u00facleo compuesto por 4 subunidades, (GluA1-4) que se ensamblan con diferentes estequiometr\u00edas (Herguedas et al 2013). Esta composici\u00f3n var\u00eda en diferentes regiones cerebrales y etapas del desarrollo (Schwenk et al 2014). El splicing alternativo y la edici\u00f3n de RNA aumentan todav\u00eda m\u00e1s la diversidad estructural y funcional de las subunidades GluA (Traynellis et al 2010). Finalmente, esta heterogenidad estructural se expande gracias a la interacci\u00f3n con m\u00e1s de 30 prote\u00ednas que interaccionan tanto de manera estable como transitoria con el n\u00facleo tetram\u00e9rico de GluA. El objetivo de nuestra l\u00ednea de investigaci\u00f3n es indagar en la diversidad estructural de los diferentes complejos AMPARs, utilizando la cr\u00edo-microscop\u00eda electr\u00f3nica, con el fin de determinar los mecanismos de acci\u00f3n de los receptores. Adem\u00e1s, estamos interesados en explorar el efecto de l\u00edpidos y peque\u00f1as mol\u00e9culas el mecanismo de acci\u00f3n del receptor as\u00ed como en aplicar t\u00e9cnicas de mol\u00e9cula \u00fanica para explorar su din\u00e1mica.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-6298\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1-1.png\" alt=\"\" width=\"943\" height=\"497\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1-1.png 943w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1-1-300x158.png 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1-1-768x405.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 943px) 100vw, 943px\" \/><\/p>\n<p>El grupo liderado por Beatriz Herguedas forma parte del grupo DGA Neuromol, junto a los IPs Jose A. Carrodeguas, Nunilo Cremades y Javier Garc\u00eda Nafr\u00eda. Este grupo tiene como objetivo caracterizar prote\u00ednas neuronales -receptores, canales i\u00f3nicos y prote\u00ednas intr\u00ednsecamente desordenadas- implicadas en neuropatolog\u00edas. Adem\u00e1s, somos parte grupo de Acci\u00f3n BioF-DTE (Implementaci\u00f3n y desarrollo de herramientas BIOF\u00edsicas en el estudio, Diagn\u00f3stico y Tratamiento de Enfermedades)\u201d del campus Iberus, un grupo de acci\u00f3n interuniversitario y transfronterizo con participaci\u00f3n de las Universidades de Zaragoza, Lleida, La Rioja, Navarra y Toulouse (CNRs).<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<ol>\n<li><strong>Mechanisms underlying TARP modulation of the GluA1\/2-\u03b38 AMPA receptor<\/strong>. Herguedas B, Kohegyi BK, Dohrke JN, Watson JF, Zhang D, Ho H, Shaikh SA, Lape R, Krieger JM, Greger IH. Nat Commun. 2022 Feb 8;13(1):734. doi: 10.1038\/s41467-022-28404-7.<\/li>\n<li><strong>Architecture of the heteromeric GluA1\/2 AMPA receptor in complex with the auxiliary subunit TARP y8<\/strong>. Herguedas B*; Watson JF, Ho H; Cais O; Garc\u00eda-Nafr\u00eda J; Greger H*. Science, 2019 (*corresponding author)<\/li>\n<li><strong>Druggability simulations of ionotropic glutamate receptors reveal a high-susceptibility binding site in the GluA3 AMPA receptor N-terminal domain<\/strong>. Lee* JY, Krieger J. *, Herguedas B. *, Garc\u00eda-Nafr\u00eda J. *, Dutta A., Shaikh S., Greger I.H., and Bahar I.. <strong>Structure<\/strong>, 2018. (*co-first author)<\/li>\n<li><strong>Structure and organization of heteromeric AMPA-type glutamate receptors<\/strong> Herguedas B<strong>*, <\/strong>Garc\u00eda-Nafr\u00eda J*, Cais O, Fern\u00e1ndez-Leiro R, Krieger J, Ho H, Greger IH.. Science. 2016. (*co-first author)<\/li>\n<li><strong>The dynamic AMPA receptor extracellular region: a platform for synaptic protein interactionS<\/strong>. Garc\u00eda-Nafr\u00eda J, Herguedas B, Watson JF, Greger IH. s<strong>. J Physiol. <\/strong>Review. 2016.<\/li>\n<li><strong>Structural insights into the synthesis of FMN in prokaryotic organisms. <\/strong>Herguedas B, Lans I, Sebasti\u00e1n M, Hermoso JA, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Medina M. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2015.<\/li>\n<li><strong>Mapping the interaction sites between AMPA receptors and TARPs reveals a role for the receptor N-terminal domain in channel gating.<\/strong> Cais O, Herguedas B, Krol K, Cull-Candy SG, Farrant M, Greger IH. Cell Reports, 2014.<\/li>\n<li><strong>A hydrogen bond network in the active site of <em>Anabaena<\/em> ferredoxin-NADP(+) reductase modulates its catalytic efficiency<\/strong>. S\u00e1nchez-Azqueta A, Herguedas B, Hurtado-Guerrero R, Herv\u00e1s M, Navarro JA, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Medina M. BBA bioenergetics. 2014.<\/li>\n<li><strong>Receptor heteromeric assembly-how it works and why it matters: the case of ionotropic glutamate receptors<\/strong>. Herguedas B, Krieger J, Greger IH<strong>. <\/strong>Prog Mol Biol Transl Sci. Review. 2013.<\/li>\n<li><strong>Oligomeric state in the crystal structure of modular FAD synthetase provides insights into its sequential catalysis in prokaryotes<\/strong> Herguedas B, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Frago S, Medina M and Hermoso JA.. J Mol Biol 2010.<\/li>\n<li><strong>Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of FAD synthetase from <em>Corynebacterium ammoniagenes<\/em><\/strong>. Herguedas B, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Frago S, Medina M and Hermoso JA. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2009.<\/li>\n<li><strong>Flavodoxin: a compromise between efficiency and versatility in the electron transfer from Photosystem I to Ferredoxin-NADP(+) reductase.<\/strong> Go\u00f1i G, Herguedas B, Herv\u00e1s M, Peregrina JR, De la Rosa MA, G\u00f3mez-Moreno C, Navarro JA, Hermoso JA, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Medina M. BBA Bioenergetics. 2009.<\/li>\n<li><strong>Protein motifs involved in coenzyme interaction and enzymatic efficiency in anabaena ferredoxin-NADP+ reductase. <\/strong>Peregrina JR*, Herguedas B*, Hermoso JA, Mart\u00ednez-J\u00falvez M, Medina M Biochemistry. 2009. (*co-first author)<\/li>\n<\/ol>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<ol>\n<li><strong>Structure and Dynamics of Calcium Permeable AMPA receptors<\/strong>. Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n. PID2019-106284GA-I00. (01\/06\/2020-31\/05\/2023). Principal Investigator.<\/li>\n<li><strong>Dotaci\u00f3n Adicional Programa Ram\u00f3n y Cajal<\/strong>. Agencia Estatal de Investigaci\u00f3n. RYC2018-025720-I. 01\/05\/2020-30\/06\/2025. Principal Investigator.<\/li>\n<li><strong>AMPA Glutamate Receptors: the role of the extracellular domains in receptor assembly and allosteric regulation<\/strong> MRC Centenary Early Career Award. P.I. Beatriz Herguedas. 01\/08\/2012-30\/09\/2013. Principal Investigator.<\/li>\n<\/ol>\n<h3><\/h3>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<p>Ingo Greger (MRC Laboratory of Molecular Biology)<br \/>\nJavier Garc\u00eda Nafr\u00eda (Universidad de Zaragoza)<br \/>\nDavid Soto del Cerro (Universidad de Barcelona)<br \/>\nRa\u00fal Est\u00e9vez (Universidad de Barcelona)<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>CONTACTO:\u00a0<\/strong><br \/>\nbherguedas@unizar.es<br \/>\n<a href=\"https:\/\/sites.google.com\/unizar.es\/herguedas-lab\/\">https:\/\/sites.google.com\/unizar.es\/herguedas-lab\/<\/a>[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbTransducci\u00f3n de se\u00f1ales y terapias en prote\u00ednas de membrana\u00bb tab_id=\u00bb1573043631978-10-9&#8243;][vc_column_text title=\u00bbTransducci\u00f3n de se\u00f1ales y terapias en prote\u00ednas de membrana\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1761216164012{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Javier Garc\u00eda Nafr\u00eda<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Dr. Daniel Mu\u00f1oz Reyes<br \/>\nDr. Josep Argerich<br \/>\nDra. Sandra Arroyo Urea<br \/>\n\u00c1ngela Carri\u00f3n Antol\u00ed<br \/>\nIris del Val Garc\u00eda<br \/>\nLaia Mata Rios<br \/>\n\u00c1ngel Garc\u00eda<br \/>\nDavid Mart\u00ednez<br \/>\nGuillermo Gil<br \/>\nJavier Castillo<br \/>\nMarina Sanz<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p><strong>Complejos proteicos de la membrana cerebral<\/strong><\/p>\n<p>Las prote\u00ednas de membrana representan el 30% del genoma humano, son responsables de la comunicaci\u00f3n intercelular y tienen una gran relevancia m\u00e9dica, con el 60% de los f\u00e1rmacos usando una prote\u00edna de membrana como diana. Las prote\u00ednas de membrana juegan un papel especialmente importante en el cerebro, donde la comunicaci\u00f3n intercelular es la base de su funci\u00f3n y da lugar a la formaci\u00f3n de memoria y la consciencia. El objetivo del grupo es entender como los receptores neuronales funcionan, diseccionando como detectan est\u00edmulos externos y los transducen al interior celular. Tenemos especial inter\u00e9s en entender la integraci\u00f3n de se\u00f1ales a trav\u00e9s de complejos de receptores, que vuelven muy compleja la interpretaci\u00f3n de se\u00f1ales, pero adem\u00e1s son una nueva ruta para desarrolar f\u00e1rmacos mas espec\u00edficos. Para llevar a cabo la investigaci\u00f3n usamos un enfoque integrado de biolog\u00eda estructural (crio-microscop\u00eda electr\u00f3nica y cristalograf\u00eda de rayos X), biof\u00edsica y ensayos bioqu\u00edmicos. La crio-microscop\u00eda electr\u00f3nica de alta resoluci\u00f3n juega un papel importante es nuestros estudios ya que podemos determinar estructuras de prote\u00ednas de membrana que antes eran inviables por cristalograf\u00eda de rayos X.<\/p>\n<p><strong><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-large wp-image-5401\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen1-de-web-926x1024.jpg\" alt=\"\" width=\"926\" height=\"1024\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen1-de-web-926x1024.jpg 926w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen1-de-web-271x300.jpg 271w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen1-de-web-768x850.jpg 768w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen1-de-web.jpg 959w\" sizes=\"auto, (max-width: 926px) 100vw, 926px\" \/>Herramientas de ingenier\u00eda de prote\u00ednas<\/strong><\/p>\n<p>Las prote\u00ednas de membrana son intr\u00ednsecamente inestables fuera del entorno de la membrana. Para solucionar este problema desarrollamos nuestras herramientas de ingenier\u00eda de prote\u00ednas que tienen como f\u00edn estabilizar el plegamiento y maximizar la expresi\u00f3n de prote\u00ednas. Recientemente hemos desarrollado un sistema de clonaje que simplifica todos los protocolos de modificaci\u00f3n de genes en pl\u00e1smidos (Garc\u00eda-Nafr\u00eda, <a href=\"https:\/\/www.google.com\/url?q=https%3A%2F%2Fwww.nature.com%2Farticles%2Fsrep27459&amp;sa=D&amp;sntz=1&amp;usg=AFQjCNHUyptgh-966aIPyRqtu1dxcikxGg\">Sci. Rep, 2016<\/a>\u00a0and Watson,\u00a0<a href=\"http:\/\/www.google.com\/url?q=http%3A%2F%2Fwww.jbc.org%2Fcontent%2F294%2F42%2F15271.abstract%3Fsid%3Dc09bdd04-f4a3-40c2-b875-8bd5ef0ac768&amp;sa=D&amp;sntz=1&amp;usg=AFQjCNENaCNEMczDEx6b6KLHawwFVL23iw\">JBC, 2019<\/a>). Esto permite crear, de manera simple y r\u00e1pida, crear librer\u00edas de cDNA de prote\u00ednas que se usan a posteriori para encontrar modificaciones estabilizantes. Este sistema se puede usar en cualquier laboratorio biom\u00e9dico y con cualquier tipo de prote\u00edna expresada.<\/p>\n<p><strong><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-large wp-image-5403\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen-2-1024x464.jpg\" alt=\"\" width=\"1024\" height=\"464\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen-2-1024x464.jpg 1024w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen-2-300x136.jpg 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2019\/11\/imagen-2-768x348.jpg 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/>Metodolog\u00edas utilizadas<br \/>\n<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>Clonaci\u00f3n de genes y t\u00e9cnicas de DNA recombinante.<\/li>\n<li>Ingenier\u00eda de prote\u00ednas.<\/li>\n<li>Producci\u00f3n de prote\u00ednas en bacteria, c\u00e9lulas de insecto y c\u00e9lulas de mam\u00edfero.<\/li>\n<li>Purificaci\u00f3n de prote\u00ednas.<\/li>\n<li>Resonancia de plasm\u00f3n superficial (Biacore).<\/li>\n<li>Microscale thermophoresis.<\/li>\n<li>Cristalograf\u00eda y difracci\u00f3n de rayos X de macromol\u00e9culas.<\/li>\n<li>Crio-microscop\u00eda electr\u00f3nica de part\u00edcula \u00fanica de alta resoluci\u00f3n.<\/li>\n<li>Ensayos bioqu\u00edmicos y funcionales en c\u00e9lulas.<\/li>\n<\/ul>\n<h3><\/h3>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Relevant publications<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1. IVA Prime: An Online Tool to Automate Primer Design for In Vivo Assembly Cloning. <\/strong>Radu Cristian Leonte, Patrick David Fischer, Beatriz Herguedas, Javier Garc\u00eda-Nafr\u00eda and Sebastian Hiller.\u00a0 Nucleic Acid. Research. 2025.<\/p>\n<p><strong>2 Structure of the dopamine D3 receptor bound to a bitopic agonist reveals a selectivity site. <\/strong>Arroyo-Urea S, Nazarova AL, Carri\u00f3n-Antol\u00ed A, Bonifazi A, Battiti FO, Lam JH, Newman AH, Katritch V, Garc\u00eda-Nafr\u00eda J.\u00a0 Nature Communications. 2024 Sep 5;15(1):7759. doi: 10.1038\/s41467-024-51993-4<\/p>\n<p><strong>3 Molecular determinants of <\/strong><strong>\u03b2<\/strong><strong>-arrestin coupling to formoterol-bound <\/strong><strong>\u03b2<\/strong><strong>1-adrenoceptor.<\/strong>Lee Y., Warne T., Nehme R., Pandey S., Chaturvedi M., Dwivedi-Agnihotri H., Edwards P., Garc\u00eda-Nafr\u00eda J., Leslie A., Shukla AK., Tate CG. Nature. 2020 Jun 17. doi: 10.1038\/s41586-020-2419-1.<\/p>\n<p><strong>4 Cryo-Electron Microscopy: Moving Beyond X-ray Crystal Structures for Drug receptors and Drug development. <\/strong>Garc\u00eda-Nafr\u00eda J.* and Tate CG*.\u00a0\u00a0<strong>Annual Reviews in Pharmacology and Toxicology<\/strong>. 2020. \u00a0Jan 6;60:51-71.<\/p>\n<p><strong>5.\u00a0<\/strong><strong>Architecture of the heteromeric GluA1\/2 AMPA receptor in complex with the auxiliary subunit TARP <\/strong><strong>\u03b3<\/strong><strong>8<\/strong>. Herguedas B, Watson JF, Ho H, Cais O, Garc\u00eda-Nafr\u00eda J, Greger IH.\u00a0<strong>Science<\/strong>. 2019 Mar 14. pii: eaav9011<\/p>\n<p><strong>6. Cryo-EM structure of the serotonin 5-HT1B receptor coupled to heterotrimeric Go. <\/strong>Garc\u00eda-Nafr\u00eda J., Nehme R., Edwards P., Tate CG.\u00a0<strong>Nature<\/strong><em><strong>.<\/strong><\/em>2018, 558 (7711). 620-62.<\/p>\n<p><strong>7. Cryo-EM structure of the adenosine A<sub>2A<\/sub>receptor coupled to an engineered heterotrimeric G protein. <\/strong>Garc\u00eda-Nafr\u00eda J., Lee Y., Bai X., Carpenter B. &amp; Tate CG.\u00a0<strong>Elife.<\/strong>2018, May 4;7. pii: e35946.<\/p>\n<p><strong>8. Structure and organization of heteromeric AMPA-type glutamate receptors. <\/strong>Herguedas B*, Garc\u00eda-Nafria J*, Cais O, Fernandez-Leiro R, Ho H, Krieger J, Greger IH.\u00a0<strong>Science.<\/strong>2016, Apr 29;352(6285):aad3873.<\/p>\n<p><strong>9. IVA cloning: A single-tube universal cloning system exploiting bacterial In Vivo Assembly. <\/strong>Garc\u00eda-Nafria J*, Watson JF, Greger IH.\u00a0<strong>Scientific Reports.<\/strong>2016, Jun 6;6:27459. (*corresponding author).<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Main research projects<\/strong><\/h3>\n<ol>\n<li><strong>ERC Consolidator Grant 2024. <\/strong>Mechanisms of Inflammation Resolution by Specialized Pro-resolving Mediators. European Commission. Program HORIZON, project 101170811. ReSolVer. 1,999,125 euros. 2025-2030.<\/li>\n<li><strong>Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n.<\/strong> In vitro de-orphanization of G protein-coupled receptors. MICINN. CNS2022-135877. 2023-2025.<\/li>\n<li><strong>Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades.<\/strong> New modulation mechanisms of GPCRs (DopDrug): a focus on the dopamine receptors. MICINN. PID2020-113359GA-I00. 2021-2024.<\/li>\n<li><strong>Sosei Heptares Therapeutics. <\/strong>Optimization of sample production geared towards cryo-EM structure pipeline: application to orphan GPCRs. 2023-2026<strong>. <\/strong>Heptares Therapeutics limited.<\/li>\n<li style=\"list-style-type: none;\">\n<ol>\n<li style=\"list-style-type: none;\">\n<ol>\n<li style=\"list-style-type: none;\"><\/li>\n<\/ol>\n<\/li>\n<\/ol>\n<\/li>\n<\/ol>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>Colaboradores<\/strong><\/h3>\n<p>Paula Morales, Nadine Jagerovic (IQM, CSIC, Spain)<br \/>\nAmy H. Newman, Alessandro Bonifazi (NIDA, NIH, USA)<br \/>\nMaria Jos\u00e9 Sanchez Barrena (CSIC, Madrid, Spain).<br \/>\nNunilo Cremades Casas\u00edn (BIFI, Zaragoza, Spain).<\/p>\n<p><strong>\u00a0<\/strong><\/p>\n<p><strong>CONTACTO<\/strong><\/p>\n<p><strong>Email<\/strong>: <a href=\"mailto:jgarcianafria@unizar.es\">jgarcianafria@unizar.es<\/a><\/p>\n<p><strong>Pagina web del grupo<\/strong>: https:\/\/sites.google.com\/view\/signal-transduction-lab\/[\/vc_column_text][\/vc_tab][vc_tab title=\u00bbModulaci\u00f3n enzim\u00e1tica y mecanismos de reacci\u00f3n\u00bb tab_id=\u00bb1493116927057-9-8&#8243;][vc_column_text title=\u00bbModulaci\u00f3n Enzim\u00e1tica &amp; Mecanismos de Reacci\u00f3n\u00bb css=\u00bb.vc_custom_1616075554071{margin-bottom: 0px !important;}\u00bb]<strong>Responsable de la L\u00ednea de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n<p>Pedro Merino Filella<\/p>\n<p><strong> Investigadores:<\/strong><\/p>\n<p>Manuel Pedr\u00f3n (contratado pre-doctoral Gobierno de Arag\u00f3n)<br \/>\nSara Orta (contratado pre-doctoral Gobierno de Arag\u00f3n)<br \/>\nSandra Pereira (contratado pre-doctoral FPI)<br \/>\nIgnacio Sanz (contratado pre-doctoral FPI)<\/p>\n<p>Colaboradores:<\/p>\n<p>Tomas Tejero Lopez (ISQCH)<br \/>\nI\u00f1aki Delso (ISQCH)<\/p>\n<h3><strong>RESUMEN<\/strong><\/h3>\n<p><strong>SUBLINEA 1: Modulaci\u00f3n y mecanismos de reacci\u00f3n enzim\u00e1ticos<\/strong><\/p>\n<p>Nuestro grupo centra su actividad en conseguir comprender los procesos biol\u00f3gicos relacionados con la salud. El grupo posee una dilatada experiencia en s\u00edntesis org\u00e1nica asim\u00e9trica y cuenta con laboratorios bien equipados en la Facultad de Ciencias. Dentro del campo de la Qu\u00edmica Biol\u00f3gica el grupo est\u00e1 interesado en el dise\u00f1o y s\u00edntesis de peque\u00f1as mol\u00e9culas -principalmente compuestos nitrogenados y glicomim\u00e9ticos- capaces de actuar como moduladores y\/o inhibidores de enzimas diana asociados con procesos biol\u00f3gicos espec\u00edficos. Entre otros enzimas, glicosiltransferasas y transglicosilasas son los principales objetivos. El desarrollo de estas actividades se lleva a cabo combinando una serie de t\u00e9cnicas multidisciplinares que incluyen metodolog\u00edas sint\u00e9ticas desarrolladas en nuestros laboratorios utilizando m\u00e9todos de cat\u00e1lisis asim\u00e9trica org\u00e1nica y met\u00e1lica, t\u00e9cnicas de biocomputaci\u00f3n (docking y din\u00e1mica molecular) y t\u00e9cnicas espectrosc\u00f3picas avanzadas como STD-NMR.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-6291\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1.png\" alt=\"\" width=\"660\" height=\"480\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1.png 660w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-1-300x218.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 660px) 100vw, 660px\" \/>Figura 1. Glicosiltransferasa GalNAc-T2: Estudio de din\u00e1mica molecular e interacciones con un ligando dise\u00f1ado en el grupo de investigaci\u00f3n.<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-6293\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2.png\" alt=\"\" width=\"824\" height=\"207\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2.png 824w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2-300x75.png 300w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-2-768x193.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 824px) 100vw, 824px\" \/>Figura 2. Glicosiltransferasa POFUT1: Mecanismo catal\u00edtico de tipo SN1 con formaci\u00f3n de un par i\u00f3nico en el estado de transici\u00f3n<\/p>\n<p><strong>SUBLINEA 2: Mecanismos de reacciones org\u00e1nicas.<\/strong><\/p>\n<p>El grupo est\u00e1 tambi\u00e9n interesado en estudiar mecanismos de reacci\u00f3n utilizando mec\u00e1nica cu\u00e1ntica y aproximaciones topol\u00f3gicas modernas como an\u00e1lisis ELF (funci\u00f3n de localizaci\u00f3n electr\u00f3nica) y NCI (interacciones no covalentes)<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-full wp-image-6295\" src=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-3.png\" alt=\"\" width=\"674\" height=\"309\" srcset=\"https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-3.png 674w, https:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2021\/03\/fig-3-300x138.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 674px) 100vw, 674px\" \/>Figura 3. Estudios QM y topol\u00f3gicos de mecanismos de reacci\u00f3n<\/p>\n<p>Los estudios incluyen la elucidaci\u00f3n de reacciones catal\u00edticas, tanto catalizadas por metales como organocatal\u00edtcas. En particular, el grupo se dedica a estudiar el rol de \u00e1cidos fosf\u00f3ricos quirales en reacciones organocatal\u00edticas en las que se forman carbocationes transientes.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3><strong>PUBLICACIONES RELEVANTES<\/strong><\/h3>\n<ol>\n<li><strong>Computational evidence of Glycosy Cations<\/strong>. Merino, P.; Delso, I.; Pereira, S.; Pedron, M.; Orta, S.; Tejero, T. <em>Org. <\/em><em>Biomol. Chem.<\/em> <strong>2021<\/strong>. doi:\u00a0 10.1039\/D0OB02373F<\/li>\n<li><strong>Enantio- and Diastereoselective Nucleophilic Addition of N-tert-Butyl Hydrazones to Isoquinolinium Ions through Anion-Binding Catalysis<\/strong>. Matador, E.; Iglesias-Sig\u00fcenza, J.; Monge, D.; Merino, P.; Fern\u00e1ndez, R.; Lassaletta, J. M. <em>Angew. <\/em><em>Chem. Int. Ed.<\/em> <strong>2021<\/strong><em>,133,<\/em> 5096-5101. doi:\u00a0 10.1002\/anie.202012861<\/li>\n<li><strong>Anomeric beta-triflate characterization enables the monitorization of glycosylation dynamics and suggests a non-canonical reinterpretation of the mechanism<\/strong>. Santana, A. G.; Montalvillo-Jim\u00e9nez, L.; D\u00edaz-Casado, L.; Corzana, F.; Jim\u00e9nez-Os\u00e9s, G.; Merino, P.; Ca\u00f1ada, F. J.; Jim\u00e9nez-Barbero, J.; G\u00f3mez, A. M.; Asensio, J. L. <em>J. Am. <\/em><em>Chem. Soc.<\/em> <strong>2020<\/strong>, <em>142<\/em>, 12501-12514. doi:\u00a0 10.1021\/jacs.0c05525<\/li>\n<li><strong>Enantioselective Synthesis of Tropanes through Br\u00f8nsted Acid-Catalyzed Pseudotransannular Desymmetrization.<\/strong> Rodriguez, S.; Uria, U.; Reyes, E.; Carrillo, L.; Tejero, T.; Merino, P.; Vicario, J. L. <em>Angew. <\/em><em>Chem. Int. Ed.<\/em> <strong>2020<\/strong>, <em>132<\/em>, 6846-6850. doi:\u00a0 10.1002\/anie.202000650<\/li>\n<li><strong>Dissecting the Structural and Chemical Determinants of the \u201cOpen-to-Closed\u201d Motion in the Mannosyltransferase PimA from Mycobacteria<\/strong>. Unzueta, A. R.; Ghirardello, M.; Urresti, S.; Delso, I.; Giganti, D.; Anso-Miqueleiz, I.; Trastoy, B.; Comino, N.; Tersa, M.; D\u2019Angelo, C.; Cifuente, J. O.; Marina, A.; Durana, A.; Chenal, A.; Svergun, D. I.; Alzari, P. M.; Albesa-Jov\u00e9, D.; Merino, P.; Guerin, M. E. <em>Biochemistry<\/em> <strong>2020<\/strong>, <em>59<\/em>, 2934-2945. doi:\u00a0 10.1021\/acs.biochem.0c00376<\/li>\n<li><strong>Enantioselective Synthesis, DFT Calculations and Preliminary Antineoplastic Activity of Dibenzo 1-Azaspiro[4.5]decanes on Drug Resistant Leukemias<\/strong>. Mendes, J. A.; Merino, P.; Soler, T.; Salustiano, E. J.; Costa, P. R. R.; Yus, M.; Foubelo, F.; Buarque, C. D. <em>J. Org. <\/em><em>Chem.<\/em> <strong>2019<\/strong>, <em>84<\/em>, 2219-2233. doi:\u00a0 10.1021\/acs.joc.8b03203<\/li>\n<li><strong>Sequential Metal-free Thermal 1,3-Dipolar Cycloaddition of Unactivated Azomethine Ylides<\/strong>. Selva, V.; Selva, E.; Merino, P.; N\u00e1jera, C.; Sansano, J. M. <em>Org. <\/em><em>Lett.<\/em> <strong>2018<\/strong>, <em>20<\/em>, 3522-3526. doi:\u00a0 10.1021\/acs.orglett.8b01292<\/li>\n<li><strong>Catalytic Enantioselective Cloke-Wilson Rearrangement. <\/strong>Ortega, A.; Manzano, R.; Uria, U.; Carrillo, L.; Reyes, E.; Tejero, T.; Merino, P.; Vicario, J. L. <em>Angew. <\/em><em>Chem. Int. Ed.<\/em> <strong>2018<\/strong>, <em>57<\/em>, 8225-8229. doi:\u00a0 10.1002\/anie.201804614<\/li>\n<li><strong>UDP-GlcNAc Analogs as Inhibitors of O-GlcNAc Transferase (OGT): Spectroscopic, Computational and Biological Studies<\/strong>. Ghirardello, M.; Perrone, D.; Chinaglia, N.; S\u00e1daba, D.; Delso, I.; Tejero, T.; Marchesi, E.; Fogagnolo, M.; Rafie, K.; Aalten, D. M. F. v.; Merino, P. <em>Chem. Eur. J.<\/em> <strong>2018<\/strong>, <em>24<\/em>, 7264-7272. doi:\u00a0 10.1002\/chem.201801083<\/li>\n<li><strong>Inhibitors against Fungal Cell Wall-remodelling Enzymes<\/strong>. Delso, I.; Valero-Gonzalez, J.; Gomoll\u00f3n-Bel, F.; Castro-L\u00f3pez, J.; Fang, W.; Navratilova, I.; Aalten, D. M. F. v.; Tejero, T.; Merino, P.; Hurtado-Guerrero, R. <em>ChemMedChem<\/em> <strong>2018<\/strong>, <em>13<\/em>, 128-132. doi:\u00a0 10.1002\/cmdc.201700720<\/li>\n<li><strong>(+)-Methyl (1R,2S)-2-{[4-(4-chlorophenyl)-4-hydroxypiperidin-1-yl]methyl}-1-phenylcyclopropanecarboxylate [(+)-MR200] Derivatives as Potent and Selective Sigma Receptor Ligands: Stereochemistry and Pharmacological Properties.<\/strong> Amata, E.; Rescifina, A.; Prezzavento, O.; Arena, E.; Dichiara, M.; Pittal\u00e0, V.; Montilla-Garc\u00eda, \u00c1.; Punzo, F.; Merino, P.; Cobos, E. J.; Marrazzo, A. <em>J. Med. <\/em><em>Chem.<\/em> <strong>2018<\/strong>, <em>61<\/em>, 372-384. doi:\u00a0 10.1021\/acs.jmedchem.7b01584<\/li>\n<li><strong>Regioselectivity Change in the Organocatalytic Enantioselective (3+2) Cycloaddition with Nitrones Through Cooperative H-Bonding Catalysis\/Iminium Activation<\/strong>. Prieto, L.; Juste-Navarro, V.; Uria, U.; Delso, I.; Reyes, E.; Tejero, T.; Carrillo, L.; Merino, P.; Vicario, J. L. <em>Chem. Eur. J.<\/em> <strong>2017<\/strong>, <em>23<\/em>, 2764-2768. doi:\u00a0 10.1002@chem.201605350<\/li>\n<li><strong>Racemic Hemiacetals as Oxygen-Centered Pronucleophiles Triggering Cascade 1,4-Addition\/Michael Reaction through Dynamic Kinetic Resolution under Iminium catalysis. Reaction Development and Mechanistic Insights<\/strong>. Orue, A.; Uria, U.; Roca-L\u00f3pez, D.; Delso, I.; Reyes, E.; Carrillo, L.; Merino, P.; Vicario, J. L. <em>Chem. Sci.<\/em> <strong>2017<\/strong>, <em>8<\/em>, 2904-2913. doi:\u00a0 10.1039\/C7SC00009J<\/li>\n<li><strong>The small molecule luteolin inhibits N-acetyl-<\/strong><strong>\uf061<\/strong><strong>-galactosaminyltransferases and reduces mucin-type O-glycosylation of amyloid precursor protein <\/strong>Liu, F.; X, K.; Xu, Z.; Rivas, M. d. l.; Li, X.; Lu, J.; Delso, I.; Merino, P.; Hurtado-Guerrero, R.; Zhang, Y. <em>Journal of Biological Chemistry<\/em> <strong>2017<\/strong>, <em>292<\/em>, 21304-21319. doi:\u00a0 10.1074\/jbc.M117.814202<\/li>\n<\/ol>\n<h3><\/h3>\n<h3><strong>PRINCIPALES PROYECTOS DE INVESTIGACI\u00d3N<\/strong><\/h3>\n<p><strong>1.- Dise\u00f1o racional y s\u00edntesis estereoselectiva de glicomim\u00e9ticos<\/strong>. MINECO, 2014-2016 CTQ2013-44367-C2-1-P. 151.200 EURO. PI: Pedro Merino<\/p>\n<p><strong>2.- Dise\u00f1o racional de glicomim\u00e9ticos inhibidores de glicosiltransferasas<\/strong>. MINECO, 2017-2019 CTQ2016-76155-R. 172.800 EURO. PI: Pedro Merino<\/p>\n<p><strong>3.<\/strong>\u00a0<strong>Estudios mecan\u00edsticos de reacciones de glicosilaci\u00f3n y su aplicaci\u00f3n al dise\u00f1o de inhibidores de glicosiltransferasas<\/strong>. Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades. PID2019-104090RB-100. 2020-2023. 163.350 EUROS PI: Pedro Merino Filella<\/p>\n<h3><strong>COLABORADORES<\/strong><\/h3>\n<p>Dr. Loredana Maiuolo. Universit\u00e0 della Calabria. Cosenza. Italy<br \/>\nProf. Jose Luis Vicario. Universidad del Pais Vasco. Bilbao. Spain<br \/>\nProf. Jose M.\u00a0 Lassaaletta. IIQ-CSIC. Sevilla. Spain.<br \/>\nDr. Francesca Cardona. Universit\u00e1 di Firenze. Italy<br \/>\nProf. Dan van Aalten. University of Dundee. United Kingdom.<br \/>\nProf. Sonsoles Martin-Santamar\u00eda. CIB-CSIC. Madrid. Spain.<br \/>\nProf. Juan Luis Asensio. IQO-CSIC, Madrid. Spain<br \/>\nProf. Eric Oldfield. University of Illinois, USA<br \/>\nDr. Francisco Corzana. Universidad de La Rioja. Spain<br \/>\nDr. Marcelo Guerin. CIC-Biogune. Bilbao. Spain<br \/>\nProf. Pedro Gois. Universidade de Coimbra. Portugal.<br \/>\nDr. Ramon Hurtado. Universidad de Zaragoza. BIFI. Spain<\/p>\n<p><strong>CONTACTO<\/strong> (opcional email, web personal o grupo, etc)<br \/>\n<a href=\"about:blank\">pmerino@unizar.es<\/a><br \/>\n<a href=\"about:blank\">bioorganica@unizar.es<\/a><\/p>\n<p>web: <a href=\"about:blank\">http:\/\/bioorganica.unizar.es<\/a>[\/vc_column_text][\/vc_tab][\/vc_tabs][vc_column_text][\/vc_column_text][\/vc_column][\/vc_row]\n<\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>[mk_page_section bg_image=\u00bbhttps:\/\/bifi.es\/wp-content\/uploads\/2016\/11\/research_investigacion_bifi-bn-2.jpg\u00bb bg_position=\u00bbcenter top\u00bb bg_repeat=\u00bbno-repeat\u00bb bg_stretch=\u00bbtrue\u00bb enable_3d=\u00bbtrue\u00bb video_opacity=\u00bb0.7&#8243; min_height=\u00bb400&#8243; js_vertical_centered=\u00bbtrue\u00bb padding_top=\u00bb0&#8243; top_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb bottom_shape_color=\u00bb#ffffff\u00bb sidebar=\u00bbsidebar-1&#8243;][vc_column][mk_fancy_title tag_name=\u00bbh1&#8243; color=\u00bb#ffffff\u00bb size=\u00bb60&#8243; force_font_size=\u00bbtrue\u00bb size_tablet=\u00bb40&#8243; size_phone=\u00bb28&#8243; font_weight=\u00bb300&#8243; txt_transform=\u00bbuppercase\u00bb letter_spacing=\u00bb2&#8243; font_family=\u00bbLato\u00bb font_type=\u00bbgoogle\u00bb align=\u00bbcenter\u00bb]Biof\u00edsica.[\/mk_fancy_title][\/vc_column][\/mk_page_section][vc_row fullwidth=\u00bbtrue\u00bb][vc_column][mk_divider style=\u00bbthin_solid\u00bb thin_color_style=\u00bbgradient_color\u00bb thin_grandient_color_from=\u00bb#da391a\u00bb [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-2216","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2216","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2216"}],"version-history":[{"count":115,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2216\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10113,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2216\/revisions\/10113"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2216"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}