{"id":5811,"date":"2020-07-30T12:55:01","date_gmt":"2020-07-30T10:55:01","guid":{"rendered":"http:\/\/bifi.es\/pilar-catalan-investigadora-del-bifi-y-catedratica-de-botanica-en-la-escuela-politecnica-superior-de-huesca-de-la-universidad-de-zaragoza-acaba-de-publicar-un-interesante-articulo-en-la-prestigiosa\/"},"modified":"2020-07-30T12:55:01","modified_gmt":"2020-07-30T10:55:01","slug":"pilar-catalan-investigadora-del-bifi-y-catedratica-de-botanica-en-la-escuela-politecnica-superior-de-huesca-de-la-universidad-de-zaragoza-acaba-de-publicar-un-interesante-articulo-en-la-prestigiosa","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/bifi.es\/es\/pilar-catalan-investigadora-del-bifi-y-catedratica-de-botanica-en-la-escuela-politecnica-superior-de-huesca-de-la-universidad-de-zaragoza-acaba-de-publicar-un-interesante-articulo-en-la-prestigiosa\/","title":{"rendered":"Pilar Catal\u00e1n, investigadora del BIFI y catedr\u00e1tica de Bot\u00e1nica en la Escuela Polit\u00e9cnica Superior de Huesca, de la Universidad de Zaragoza, acaba de publicar un interesante art\u00edculo en la prestigiosa revista Nature Communications."},"content":{"rendered":"

\"\"Este art\u00edculo se ha publicado el 29 de julio de 2020 (https:\/\/rdcu.be\/b5VSS<\/a>) y est\u00e1 relacionado con la evoluci\u00f3n de los genomas poliploides de plantas dentro un contexto pangen\u00f3mico en la revista Nature Communications<\/strong>, siendo autores de la correspondencia del mismo Pilar Catal\u00e1n<\/strong>, catedr\u00e1tica de Bot\u00e1nica de Unizar e investigadora del BIFI, y John Vogel<\/strong>, investigador del Joint Genome Institute (JGI, USA). Los resultados que se publican en este art\u00edculo han proporcionado nuevas evidencias sobre el origen recurrente y la din\u00e1mica evolutiva de los subgenomas de las plantas alopoliplodes.\"\"<\/p>\n

El equipo de investigaci\u00f3n liderado por Pilar Catal\u00e1n y en el que participan colegas de Unizar<\/strong>, la EEAD-CSIC<\/strong>, el JGI<\/strong> y las Universidades de Silesia<\/strong> (Polonia) y Aberystwyth<\/strong> (UK) lleva desarrollando desde 2018 un proyecto de investigaci\u00f3n financiado por el JGI (CSP 503504) y por el Ministerio de Ciencia e Innovaci\u00f3n de Espa\u00f1a (CGL2016-79790-P) para el estudio evolutivo y gen\u00f3mico de la alopoliploid\u00eda en el complejo de gram\u00edneas modelo Brachypodium<\/em> distachyon<\/em>–B.stacei<\/em>–B.hybridum<\/em><\/strong>. Los peque\u00f1os genomas de las especies progenitoras diploides B. distachyon<\/em> y B. stacei<\/em> y de los subgenomas de ambas en el alotetraploide B. hybridum<\/em> los convierten en dianas \u00f3ptimas para desentra\u00f1ar los or\u00edgenes del alopoliploide y la regulaci\u00f3n de sus interacciones subgen\u00f3micas.<\/p>\n

La poliploid\u00eda<\/strong>, un fen\u00f3meno muy com\u00fan en plantas y en la mayor parte de nuestros cultivos, implica la existencia de m\u00e1s de un genoma en los individuos<\/strong>, que en muchas ocasiones provienen de especies progenitoras diploides distintas (alopoliploid\u00eda). La posesi\u00f3n por duplicado o multiplicada de los genes y de sus redes reguladoras genera toda una serie de interacciones entre los subgenomas<\/strong> participantes manifest\u00e1ndose en distintas expresiones fenot\u00edpicas y fisiol\u00f3gicas de las plantas<\/strong>. Pese a la importancia que tiene para la agricultura y la silvicultura el conocimiento del origen y el comportamiento de los subgenomas progenitores en las plantas alopoliploides, estos procesos se han investigado en un n\u00famero limitado de especies, gran parte de las cuales posee genomas grandes (como los trigos poliploides), lo que dificulta la identificaci\u00f3n de los mecanismos de control de las expresiones diferenciales de los genes de cada subgenoma.<\/p>\n

\"\"En el art\u00edculo publicado se muestran los primeros resultados de esta investigaci\u00f3n, en la que se han detectado dos or\u00edgenes distintos de B. hybridum<\/em><\/strong>, con individuos ancestrales que aparecieron hace ~1.4 millones de a\u00f1os (Ma) y otros m\u00e1s recientes, de hace ~0.4 Ma. El an\u00e1lisis comparado de los genomas de referencia del alotetraploide reciente y de sus especies progenitoras diploides muestran una alta colinearidad de los subgenomas de B.hybridum<\/em> con respecto a cada uno de los genomas diploides progenitores, indicando la ausencia de cambios estructurales inter-subgen\u00f3micos desde que se produjo la hibridaci\u00f3n y la poliploidizaci\u00f3n hace unos cuantos cientos de miles de a\u00f1os. Por otro lado, los ensayos de expresi\u00f3n g\u00e9nica indican la ausencia de dominancia de un subgenoma sobre el otro, expres\u00e1ndose los genes de ambos subgenomas en proporciones similares. El estudio gen\u00f3mico comparado de los alotetraploides ancestrales y recientes en un contexto pangen\u00f3mico que incluye un centenar de genomas de la especie progenitora B. distachyon<\/em> muestra que aunque los alotetraploides ancestrales presentan m\u00e1s polimorfismos y elementos repetitivos propios y divergieron antes, a partir de ancestros desconocidos, su variabilidad g\u00e9nica no difiere significativamente de la encontrada en el pangenoma de B. distachyon<\/em>. Estos resultados muestran la importancia que tiene el desarrollo de los estudios evolutivos gen\u00f3micos de plantas y de otros organismos en un contexto pangen\u00f3mico, tanto de los alopoliploides como de sus progenitores diploides, ya que, de haber empleado \u00fanicamente los genomas de referencia de las especies diploides B. distachyon<\/em> y B. stacei<\/em>, la interpretaci\u00f3n del origen y la evoluci\u00f3n de los subgenomas de los individuos ancestrales de B. hybridum<\/em> hubiese sido distinta. En dicho caso podr\u00eda haberse considerado que las variaciones gen\u00f3micas observadas en los individuos B. hybridum<\/em> ancestrales aparecieron por cambios mutacionales y estructurales posteriores a la hibridaci\u00f3n-poliploidizaci\u00f3n. Por el contrario, al encontrase estas variaciones dentro de la diversidad del pangenoma del progenitor B. distachyon<\/em> su origen probablemente sea pre-hibridaci\u00f3n, habiendo sido causadas por el cruce de progenitores ancestrales que ya las portaban.<\/p>\n

Publicaci\u00f3n:<\/p>\n

Gordon SP, Contreras-Moreira B, Levy JJ, Djamei A, Czedik-Eysenberg A, Tartaglio VS, Session A, Martin J, Cartwright A, Katz A, Singan VR, Goltsman E, Barry K, Dinh-Thi VH, Chalhoub B, Diaz-Perez A, Sancho R, Lusinska J, Wolny E, Nibau C, Doonan JH, Mur L, Plott C, Jenkins J, Hazen SP, Lee SJ, Shu S, Goodstein D, Rokhsar D, Schmutz J, Hasterok R, Catal\u00e1n P, Vogel JP. 2020. Gradual polyploid genome evolution revealed by a pan-genomic analysis of Brachypodium hybridum<\/em> and its diploid progenitors.\u00a0 Nature Communications <\/em>11:3670.<\/p>\n

Im\u00e1genes:<\/p>\n

    \n
  1. Pilar Catal\u00e1n, investigadora del BIFI y catedr\u00e1tica de Bot\u00e1nica en la Escuela Polit\u00e9cnica Superior de Huesca.<\/li>\n
  2. Pilar Catal\u00e1n y Jon Vogel en el 4th Internation Brachypoidum Conference, organizado por el grupo Bioflora en Huesca.<\/li>\n
  3. Brachypodium hybridum<\/em>, la gram\u00ednea modelo para el estudio de la alopoliploidia en plantas.<\/li>\n<\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    Este art\u00edculo se ha publicado el 29 de julio de 2020 (https:\/\/rdcu.be\/b5VSS) y est\u00e1 relacionado con la evoluci\u00f3n de los genomas poliploides de plantas dentro un contexto pangen\u00f3mico en la […]<\/p>\n","protected":false},"author":8,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[30,47],"tags":[],"class_list":["post-5811","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-noticias-es","category-noticias-es-2"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/5811","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=5811"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/5811\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=5811"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=5811"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/bifi.es\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=5811"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}