[PhD para contrato FPI 2023] CO-EVOLUCIÓN Y ESPECIACIÓN ADAPTATIVA DE GRAMÍNEAS Y ENDÓFITOS (FESTUCA, BRACHYPODIUM, EPICHLOË) EN UN MARCO PANGENÓMICO

DESCRIPCIÓN

Buscamos un estudiante de doctorado entusiasta y motivado para unirse a nuestro grupo de investigación Bioflora y trabajar con nosotros en la co-evolución y especiación adaptativa de gramíneas pooideas y sus endófitos fúngicos. Invitamos a participar en el proceso a candidatos ambiciosos con experiencia investigativa relevante y pasión por llevar a cabo actividades de investigación e innovación en el marco de un proyecto financiado por el Ministerio Español de Ciencia e Innovación (PID2022-140074NB-I00).

El objetivo principal de esta investigación es avanzar en el conocimiento sobre el posible gran alcance de la transferencia lateral de genes (LGT) en pooideas y cómo este mecanismo ha contribuido a generar novedad evolutiva, y sobre la posible co-evolución de holobiontes gramínea-Epichloë y cómo este fenómeno ha contribuido adicionalmente al éxito de la especiación adaptativa en las gramíneas templadas.

Los objetivos específicos buscan:

• (i) generar un amplio marco evolutivo pan-genómico y pan-transcriptómico representativo de Pooideae para un análisis robusto de eventos LGT entre linajes filogenéticamente distantes usando genomas recientemente secuenciados de Loliinae y especies de Brachypodium más genomas disponibles de otras tribus de gramíneas,
• (ii) identificar eventos LGT confiables en Pooideae a través de análisis genómicos comparados usando enfoques de sintenia genómica, mapeo y escaneo de secuencias codificantes, y filtrado filogenético,
• (iii) analizar el nivel de expresión de los genes codificados transferidos lateralmente en las especies receptoras y de los genes nativos, e identificar las funciones biológicas de los genes LGT que confieren novedad evolutiva y mejor adaptabilidad potencial,
• (iv) caracterizar la naturaleza y abundancia de familias de transposones en los genomas y linajes analizados, e identificar posibles transferencias de transposones horizontales (HTT) vinculadas a LGT y su posible efecto en la expresión génica, y
• (v) buscar posibles eventos de transferencia horizontal de genes (HGT) de genes endófitos fúngicos en los genomas de las gramíneas pooideas a través de análisis genómicos comparados de genomas de gramíneas y genomas de Epichloë recientemente generados y disponibles, y evaluar los niveles de expresión de genes foráneos y las posibles ventajas adaptativas evolutivas conferidas a la planta.

CARACTERÍSTICAS

• Tesis doctoral co-tutelada. Supervisores: Prof. Pilar Catalan (Universidad de Zaragoza) y Prof. Jianquan Liu (Universidad de Lanzhou)
• Centro de trabajo: Escuela Politécnica Superior de Huesca, Universidad de Zaragoza, Huesca (España)
• Posición a tiempo completo (37,5 h/semana)
• Duración del contrato: La duración del contrato del candidato a doctorado será de cuatro años.
• Salario: Remuneración financiera de 1.470,97 euros brutos por mes (12 pagos) (17.651,68 euros brutos al año) para el primer y segundo año, 1.576,04 euros brutos por mes (12 pagos) (18.912,51 euros brutos al año) para el tercer año, y 1.970,05 euros brutos por mes (12 pagos) (23.640,64 euros brutos al año) para el cuarto año, que estará sujeto a las retenciones correspondientes, según la normativa vigente, y al convenio colectivo de la Universidad de Zaragoza.
• La Universidad de Zaragoza también pagará las tasas anuales de la Escuela de Doctorado al recibir la matrícula.
• Beneficios para el empleado: 22 días de vacaciones, 3 días de conciliación familiar y laboral, 45 horas de días personales, Horario de verano comprimido del 15 de julio al 31 de agosto, Horario de conciliación.

TAREAS

Las correspondientes a un estudiante de doctorado. El candidato seleccionado se matriculará en el programa de doctorado de Ciencias Agrarias y del Medio Natural de la Universidad de Zaragoza y deberá cumplir con los requisitos académicos del programa de doctorado.

Las tareas específicas incluyen:

• Revisión de literatura, trabajo de campo, jardín experimental y cámara de crecimiento, análisis de laboratorio y recolección y gestión de datos.
• Desarrollar ensamblajes y anotaciones de genomas, y análisis de genómica comparada, filogenómica y genómica de poblaciones.
• Escribir artículos científicos.
• Contribuir al trabajo en equipo y al espíritu de equipo en la línea de investigación.

REQUISITOS

Los candidatos deben tener uno de los siguientes:

• Grado en Ciencias Biológicas, Agronomía, Biotecnología o similar.
• Máster en Genética de Plantas, Evolución, Biodiversidad, Mejora de Plantas o similar.

Los candidatos deben estar en condiciones de acceder a un programa de doctorado según los requisitos de las universidades españolas (acreditando entre 60 y 120 créditos ECTS en un nivel oficial de máster universitario o equivalente).

Los candidatos no deben tener un título de doctorado previo.

Requisitos deseados:

• Buen nivel de inglés (proficiency)
• Capacidades analíticas y organizativas
• Buenas habilidades de comunicación
• Capacidad para trabajar en equipo
• Permiso de conducir

PROCESO DE SOLICITUD

Si desea ser considerado para este puesto, envíe un correo electrónico a la Prof. Pilar Catalan (pcatalan@unizar.es) al puesto de trabajo con referencia FPI-PID2022-140074NB-I00 y adjunte su CV y carta de motivación. Toda la información será tratada con la máxima confidencialidad.